LOC110532193 (LOC106572175)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110532193
gene name LOC106572175
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 45462628 ~ 45484801 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036988129.1
CATGGATGAAAAGTAGTCCCGCCTCCTGTGTTTTGGTGCGCCGAGGAATCACGTGACATGCCTATATTCTTGTTTTGCTCATCTCATTTCCTACACAGTCTCCGAAATTCTCAATACCGCCGTAAAAATGGTGACACCGGAGAACTTGTCCGGCGAGACAGGTGCTCAAAGGGAGCCCAAATTTGACCGGGATGCGTCCACTACGGCCGTGGACACAGCAATCGTGCTTCTCGGAGCCGGGGTGACAGCGATCACACACCCGCTGCTGTACGTCAAACTGCTAATTCAGaccATTCCAGCAGAGGAGGTAGAGAATGTATCTGACAGAGATGACTTGAACACCTCCCTCAGGAAAGTGGTCaaagagACCTCACATGAGATGGTCATCCAGTGCCTGTCCAGGATAGCCACTCATCCCTTCCATGTGATCTCAGTGCGCTGCATGGCCCAGTTTGTGGGGAGAGAGATCAAGTACAGGGGGTTGTTCAGCTGCATAGCCAACATCTTCAAGGAGGAGGGCGTTGGGGGATTCTTTGCGGGGGTTGTGCCCCATGTCCTGGGTGAGGTCATCTTCCTGTGGTGTTGTAACCTCCTGGCCCACTTCATCAACACCTACGCAGTGGACAACAATTTCAGCCAAGCCCCAGCAGTGAGAAGCTACACTAAGTTTGTGATGGGGATTGCAGTGAGTGTGTTGACATACCCATTTATGCTGGTGGCAGACCTGATGGCAGTCAACAACTGTGGCTTAGTGGCTGGTGTTCCCCCTAACTCTCCCATCTTCAAGTCCTGGGTGTGCTGTTGGGCTCACCTGAGCCATGAGGGCCATCTCTTCCGAGGATCCAGCTTCTTCTTCCGCCGCGTACCTGTGAAAGCGATGGCCTTGACTGAGGAGTGATGTCATCAACCGCCGCACAACCTGTGCCACTGTTCTCCCTCCTAACTGGTACCTCAGTGAGACCAACGTACAGCCCACCAAGTCAAACCTTCCCCTCACCTTAAACACCCTGGTGGGTACAGCAGGAGCAGCAAGATATCAATGGGCTTGGTGATCTACTgatctttttttttgctgaatcAAAGTTACTTACAAAATAAGTTGTTTTGTTAATTTGGTTTTTAATCTTAAGTATTAGTGTAGCCACTCAAAAGTAAGAGGTTGGAGAATTAATGTGAGCAAATCAAAATGCTATCCAATAGATGTCCTCTTGGTTGAATGCTGAGAGTATAATCTCCTTTTACTATCCCAGCCTAAAGTTGCAcaattcttttttattttttcaattcAAATCTATCACTTAATTTagccatgtatttatttttatatacagtttaatTAAGTTCTATGTAAGCTTTGGAATTGGATAGTTGATAACATCATCTATTGAAATATGccaaatgtttatttttcaaaTGATCTTCTTCCCAGAAGCATGATAAGTGTTGTTGCATTCAAAGGGGATCCTTTGTCTCCTATCAGAAGTGCTTTAACCAAGAATTATACCTATTCAGAAACATCATAAACCCACAATAACTGGAGTACTCTCCTTTCAACCATAAGATTAATTAGACAACTGGTTTCTCGCAAATTCTTACAAATTGCAGCTCTAGTGTTTGCCTGCCATGAGGAGTATGAAACGGGAGGAATTCAGAGGGCAACCAGTGGTTTTCAGTGATGTCTAAAAACTAAGCCTGCCATCCAAAAAAGGTTTTCTCTGTGGCCATATTGACAACTGTCCTTTAATGTATAATATATCAAATAAGTGATATATCTAACTGGTGCAAAAttatgggtatgtttgtgttACCAATGACAAAGAAATGCTAAATTATGTGATGACAATGGCTGAGCATATTATGCATATTACGATACATTTTGCATTCAGGCTAAGGGTGTGTGCCTGATCTTTGAACCAACCATTTCTGTTTGAGTTCCTTTTTGACTGCAGGTGAAGATCCCAATTAACCTGATAGTTTACAGTTAACCACTTGTAGTAGCATATAAATAAAAGGAATCACCTTACCTCCTCGTTAACATGATCATATTGTGTCTCCCCCTGCCCCCATGATCAGTGTTAACCACAAAATGATCTTGACCGGGTTTGGTATAGGCTGTTTTTGTCCTTATTCCAGATGTTTTTGTTGCAATGGATTGCTCTAATCATGTCTACTTGAAATAATGTGTGGAAAAAAGCTTGCAGAAGAGACCTGCTTTGCCAAGTGTGTGAGTGGGTTTATGATGTGTGCATCTTTATACCATGTAATTGAGAATATGATGCCCAGTGCTGTAATCtttctgtatgtttttttttctcaaaatgtCATGAGCATTcactctcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttccagccaAACATTCCCTGTAAACTGTGATCTCCGAAAGAGGGAGAAGCAATGGCGAGGCAGTTGCTTTGCGACCTTGCATTTCCGATGTCTATTTTCCTGAAATAATATGAAAGCTGGCATTcttgtctagtctacagtatctGTGTTAGGTTTAAAAACAATCCTTTGATCTGgttttatattttaaaaaatgaaattacATGGATGATG
>XM_036988128.1
TGGATGAAAAGTAGTCCCGCCTCCTGTGTTTTGGTGCGCCGAGGAATCACGTGACATGCCTATATTCTTGTTTTGCTCATCTCATTTCCTACACAGTCTCCGAAATTCTCAATACCGCCGTAAAAATGGTGACACCGGAGAACTTGTCCGGCGAGACAGGTGCTCAAAGGGAGCCCAAATTTGACCGGGATGCGTCCACTACGGCCGTGGACACAGCAATCGTGCTTCTCGGAGCCGGGGTGACAGCGATCACACACCCGCTGCTGTACGTCAAACTGCTAATTCAGattGGACATGAGCCCCTCACCCCAACTGTCGGAACCACCATGTTTGGGAGGAAAGTGTTGTACCTCCCTGGATTCTTCTCCTATGCACAGCACATCATAAGGGTGGATGGAAAGAGGGGACTCTTCCGAGGTCTGTCCCCTCGTATTATGTCCAGTGCCATCTCTACCATGGTCCGGAGTAAAGTCAAACAGaccATTCCAGCAGAGGAGGTAGAGAATGTATCTGACAGAGATGACTTGAACACCTCCCTCAGGAAAGTGGTCaaagagACCTCACATGAGATGGTCATCCAGTGCCTGTCCAGGATAGCCACTCATCCCTTCCATGTGATCTCAGTGCGCTGCATGGCCCAGTTTGTGGGGAGAGAGATCAAGTACAGGGGGGTTGTGCCCCATGTCCTGGGTGAGGTCATCTTCCTGTGGTGTTGTAACCTCCTGGCCCACTTCATCAACACCTACGCAGTGGACAACAATTTCAGCCAAGCCCCAGCAGTGAGAAGCTACACTAAGTTTGTGATGGGGATTGCAGTGAGTGTGTTGACATACCCATTTATGCTGGTGGCAGACCTGATGGCAGTCAACAACTGTGGCTTAGTGGCTGGTGTTCCCCCTAACTCTCCCATCTTCAAGTCCTGGGTGTGCTGTTGGGCTCACCTGAGCCATGAGGGCCATCTCTTCCGAGGATCCAGCTTCTTCTTCCGCCGCGTACCTGTGAAAGCGATGGCCTTGACTGAGGAGTGATGTCATCAACCGCCGCACAACCTGTGCCACTGTTCTCCCTCCTAACTGGTACCTCAGTGAGACCAACGTACAGCCCACCAAGTCAAACCTTCCCCTCACCTTAAACACCCTGGTGGGTACAGCAGGAGCAGCAAGATATCAATGGGCTTGGTGATCTACTgatctttttttttgctgaatcAAAGTTACTTACAAAATAAGTTGTTTTGTTAATTTGGTTTTTAATCTTAAGTATTAGTGTAGCCACTCAAAAGTAAGAGGTTGGAGAATTAATGTGAGCAAATCAAAATGCTATCCAATAGATGTCCTCTTGGTTGAATGCTGAGAGTATAATCTCCTTTTACTATCCCAGCCTAAAGTTGCAcaattcttttttattttttcaattcAAATCTATCACTTAATTTagccatgtatttatttttatatacagtttaatTAAGTTCTATGTAAGCTTTGGAATTGGATAGTTGATAACATCATCTATTGAAATATGccaaatgtttatttttcaaaTGATCTTCTTCCCAGAAGCATGATAAGTGTTGTTGCATTCAAAGGGGATCCTTTGTCTCCTATCAGAAGTGCTTTAACCAAGAATTATACCTATTCAGAAACATCATAAACCCACAATAACTGGAGTACTCTCCTTTCAACCATAAGATTAATTAGACAACTGGTTTCTCGCAAATTCTTACAAATTGCAGCTCTAGTGTTTGCCTGCCATGAGGAGTATGAAACGGGAGGAATTCAGAGGGCAACCAGTGGTTTTCAGTGATGTCTAAAAACTAAGCCTGCCATCCAAAAAAGGTTTTCTCTGTGGCCATATTGACAACTGTCCTTTAATGTATAATATATCAAATAAGTGATATATCTAACTGGTGCAAAAttatgggtatgtttgtgttACCAATGACAAAGAAATGCTAAATTATGTGATGACAATGGCTGAGCATATTATGCATATTACGATACATTTTGCATTCAGGCTAAGGGTGTGTGCCTGATCTTTGAACCAACCATTTCTGTTTGAGTTCCTTTTTGACTGCAGGTGAAGATCCCAATTAACCTGATAGTTTACAGTTAACCACTTGTAGTAGCATATAAATAAAAGGAATCACCTTACCTCCTCGTTAACATGATCATATTGTGTCTCCCCCTGCCCCCATGATCAGTGTTAACCACAAAATGATCTTGACCGGGTTTGGTATAGGCTGTTTTTGTCCTTATTCCAGATGTTTTTGTTGCAATGGATTGCTCTAATCATGTCTACTTGAAATAATGTGTGGAAAAAAGCTTGCAGAAGAGACCTGCTTTGCCAAGTGTGTGAGTGGGTTTATGATGTGTGCATCTTTATACCATGTAATTGAGAATATGATGCCCAGTGCTGTAATCtttctgtatgtttttttttctcaaaatgtCATGAGCATTcactctcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttccagccaAACATTCCCTGTAAACTGTGATCTCCGAAAGAGGGAGAAGCAATGGCGAGGCAGTTGCTTTGCGACCTTGCATTTCCGATGTCTATTTTCCTGAAATAATATGAAAGCTGGCATTcttgtctagtctacagtatctGTGTTAGGTTTAAAAACAATCCTTTGATCTGgttttatattttaaaaaatgaaattacATGGATGATG
>XM_021615880.2
ATGAAAAGTAGTCCCGCCTCCTGTGTTTTGGTGCGCCGAGGAATCACGTGACATGCCTATATTCTTGTTTTGCTCATCTCATTTCCTACACAGTCTCCGAAATTCTCAATACCGCCGTAAAAATGGTGACACCGGAGAACTTGTCCGGCGAGACAGGTGCTCAAAGGGAGCCCAAATTTGACCGGGATGCGTCCACTACGGCCGTGGACACAGCAATCGTGCTTCTCGGAGCCGGGGTGACAGCGATCACACACCCGCTGCTGTACGTCAAACTGCTAATTCAGattGGACATGAGCCCCTCACCCCAACTGTCGGAACCACCATGTTTGGGAGGAAAGTGTTGTACCTCCCTGGATTCTTCTCCTATGCACAGCACATCATAAGGGTGGATGGAAAGAGGGGACTCTTCCGAGGTCTGTCCCCTCGTATTATGTCCAGTGCCATCTCTACCATGGTCCGGAGTAAAGTCAAACAGaccATTCCAGCAGAGGAGGTAGAGAATGTATCTGACAGAGATGACTTGAACACCTCCCTCAGGAAAGTGGTCaaagagACCTCACATGAGATGGTCATCCAGTGCCTGTCCAGGATAGCCACTCATCCCTTCCATGTGATCTCAGTGCGCTGCATGGCCCAGTTTGTGGGGAGAGAGATCAAGTACAGGGGGTTGTTCAGCTGCATAGCCAACATCTTCAAGGAGGAGGGCGTTGGGGGATTCTTTGCGGGGGTTGTGCCCCATGTCCTGGGTGAGGTCATCTTCCTGTGGTGTTGTAACCTCCTGGCCCACTTCATCAACACCTACGCAGTGGACAACAATTTCAGCCAAGCCCCAGCAGTGAGAAGCTACACTAAGTTTGTGATGGGGATTGCAGTGAGTGTGTTGACATACCCATTTATGCTGGTGGCAGACCTGATGGCAGTCAACAACTGTGGCTTAGTGGCTGGTGTTCCCCCTAACTCTCCCATCTTCAAGTCCTGGGTGTGCTGTTGGGCTCACCTGAGCCATGAGGGCCATCTCTTCCGAGGATCCAGCTTCTTCTTCCGCCGCGTACCTGTGAAAGCGATGGCCTTGACTGAGGAGTGATGTCATCAACCGCCGCACAACCTGTGCCACTGTTCTCCCTCCTAACTGGTACCTCAGTGAGACCAACGTACAGCCCACCAAGTCAAACCTTCCCCTCACCTTAAACACCCTGGTGGGTACAGCAGGAGCAGCAAGATATCAATGGGCTTGGTGATCTACTgatctttttttttgctgaatcAAAGTTACTTACAAAATAAGTTGTTTTGTTAATTTGGTTTTTAATCTTAAGTATTAGTGTAGCCACTCAAAAGTAAGAGGTTGGAGAATTAATGTGAGCAAATCAAAATGCTATCCAATAGATGTCCTCTTGGTTGAATGCTGAGAGTATAATCTCCTTTTACTATCCCAGCCTAAAGTTGCAcaattcttttttattttttcaattcAAATCTATCACTTAATTTagccatgtatttatttttatatacagtttaatTAAGTTCTATGTAAGCTTTGGAATTGGATAGTTGATAACATCATCTATTGAAATATGccaaatgtttatttttcaaaTGATCTTCTTCCCAGAAGCATGATAAGTGTTGTTGCATTCAAAGGGGATCCTTTGTCTCCTATCAGAAGTGCTTTAACCAAGAATTATACCTATTCAGAAACATCATAAACCCACAATAACTGGAGTACTCTCCTTTCAACCATAAGATTAATTAGACAACTGGTTTCTCGCAAATTCTTACAAATTGCAGCTCTAGTGTTTGCCTGCCATGAGGAGTATGAAACGGGAGGAATTCAGAGGGCAACCAGTGGTTTTCAGTGATGTCTAAAAACTAAGCCTGCCATCCAAAAAAGGTTTTCTCTGTGGCCATATTGACAACTGTCCTTTAATGTATAATATATCAAATAAGTGATATATCTAACTGGTGCAAAAttatgggtatgtttgtgttACCAATGACAAAGAAATGCTAAATTATGTGATGACAATGGCTGAGCATATTATGCATATTACGATACATTTTGCATTCAGGCTAAGGGTGTGTGCCTGATCTTTGAACCAACCATTTCTGTTTGAGTTCCTTTTTGACTGCAGGTGAAGATCCCAATTAACCTGATAGTTTACAGTTAACCACTTGTAGTAGCATATAAATAAAAGGAATCACCTTACCTCCTCGTTAACATGATCATATTGTGTCTCCCCCTGCCCCCATGATCAGTGTTAACCACAAAATGATCTTGACCGGGTTTGGTATAGGCTGTTTTTGTCCTTATTCCAGATGTTTTTGTTGCAATGGATTGCTCTAATCATGTCTACTTGAAATAATGTGTGGAAAAAAGCTTGCAGAAGAGACCTGCTTTGCCAAGTGTGTGAGTGGGTTTATGATGTGTGCATCTTTATACCATGTAATTGAGAATATGATGCCCAGTGCTGTAATCtttctgtatgtttttttttctcaaaatgtCATGAGCATTcactctcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttccagccaAACATTCCCTGTAAACTGTGATCTCCGAAAGAGGGAGAAGCAATGGCGAGGCAGTTGCTTTGCGACCTTGCATTTCCGATGTCTATTTTCCTGAAATAATATGAAAGCTGGCATTcttgtctagtctacagtatctGTGTTAGGTTTAAAAACAATCCTTTGATCTGgttttatattttaaaaaatgaaattacATGGATGATG

Function

NR:

description
mitochondrial carrier homolog 1-like

GO: NA

KEGG:

id description
K17885 MTCH; mitochondrial carrier

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036988129.1 False 2573 mRNA 0.43 10 45462628 45484801
XM_036988128.1 False 2703 mRNA 0.43 11 45462630 45484801
XM_021615880.2 True 2760 mRNA 0.43 12 45462633 45484801

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110532191 stk35 coding upstream 38111 45406122 ~ 45424517 (+)
LOC118966054 NA coding upstream 144830 45315766 ~ 45318483 (+)
LOC110532189 gmeb2 coding upstream 151354 45303366 ~ 45311274 (+)
LOC110532188 LOC106572179 coding upstream 163876 45285980 ~ 45298752 (+)
chrna4b LOC106572182 coding upstream 270788 45176863 ~ 45191840 (+)
LOC110532192 LOC106572174 coding downstream 871 45485672 ~ 45494087 (+)
LOC110532197 cept1 coding downstream 33241 45518042 ~ 45541267 (+)
LOC110532198 dram2 coding downstream 56642 45541443 ~ 45546493 (+)
ela2l LOC106572163 coding downstream 286564 45771365 ~ 45775008 (+)
LOC110532211 LOC106572158 coding downstream 674148 46158949 ~ 46185603 (+)
G808874 NA non-coding upstream 88397 45373898 ~ 45374231 (+)
G808869 NA non-coding upstream 95734 45366519 ~ 45366894 (+)
G808863 NA non-coding upstream 104213 45358192 ~ 45358415 (+)
G808823 NA non-coding upstream 134686 45283986 ~ 45327942 (+)
G809234 NA non-coding downstream 114538 45599339 ~ 45604558 (+)
G809248 LOC106572168 non-coding downstream 131343 45616144 ~ 45616483 (+)
G809249 NA non-coding downstream 132077 45616878 ~ 45617212 (+)
G809256 efhd2 non-coding downstream 146971 45631772 ~ 45715145 (+)
G809267 lrif1 non-coding downstream 155563 45640364 ~ 45643150 (+)
G807841 NA other upstream 1009551 44442662 ~ 44453077 (+)
G807677 NA other upstream 1266587 44195715 ~ 44196041 (+)
G805600 NA other upstream 3113842 42346176 ~ 42348786 (+)
G805451 NA other upstream 3130190 42332093 ~ 42332438 (+)
LOC110532114 LOC106572334 other upstream 3438225 42021496 ~ 42027071 (+)
G809685 NA other downstream 649930 46134731 ~ 46135732 (+)
G812143 NA other downstream 2497200 47982001 ~ 47982301 (+)
G812688 LOC106572106 other downstream 3060653 48545454 ~ 48570593 (+)
G813071 NA other downstream 3474948 48959749 ~ 48959991 (+)
G813074 etbr2 other downstream 3518518 48962187 ~ 49006710 (+)

Expression


Co-expression Network