uckl1a (LOC106572454)



Basic Information


Item Value
gene id uckl1a
gene name LOC106572454
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 58937789 ~ 58947479 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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XM_036988523.1 False 4480 mRNA 0.43 15 58937922 58947479
XM_021616464.2 True 4901 mRNA 0.44 15 58938391 58947479
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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110532497 LOC106572446 coding upstream 114736 58817004 ~ 58823053 (+)
prickle3 LOC106572445 coding upstream 123251 58763665 ~ 58814538 (+)
LOC110532505 LOC106572456 coding downstream 18147 58965626 ~ 58973628 (+)
LOC110532506 LOC106572457 coding downstream 27990 58975469 ~ 58982674 (+)
LOC110532510 LOC106572461 coding downstream 66083 59013562 ~ 59018678 (+)
LOC110532511 LOC106572500 coding downstream 71359 59018838 ~ 59024572 (+)
ppdpfa LOC106572462 coding downstream 77695 59025174 ~ 59028152 (+)
G824640 NA non-coding upstream 35231 58894243 ~ 58902558 (+)
G824619 NA non-coding upstream 73282 58863920 ~ 58864507 (+)
G824618 NA non-coding upstream 74390 58863142 ~ 58863399 (+)
G824617 NA non-coding upstream 74775 58861127 ~ 58863014 (+)
G824616 NA non-coding upstream 76782 58860130 ~ 58861007 (+)
G824675 NA non-coding downstream 26423 58973902 ~ 58974353 (+)
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G824755 NA non-coding downstream 191169 59138648 ~ 59139540 (+)
G824753 NA non-coding downstream 196799 59144278 ~ 59145748 (+)
LOC110531219 LOC106572493 other upstream 253279 58684149 ~ 58720758 (+)
LOC110532492 LOC106572441 other upstream 266538 58668090 ~ 58671251 (+)
G823580 LOC106567312 other upstream 402146 58519219 ~ 58535643 (+)
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LOC118966079 NA other downstream 211102 59158581 ~ 59161748 (+)
LOC110532530 LOC106572481 other downstream 429627 59374974 ~ 59382411 (+)
G824936 NA other downstream 466668 59414147 ~ 59415013 (+)
G825484 NA other downstream 650550 59598029 ~ 59598970 (+)

Expression


uckl1a(LOC106572454) Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 5.
End of interactive chart.

uckl1a(LOC106572454) Expression in each Bioproject

Bar chart with 17 bars.
uckl1a(LOC106572454) Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 600.
End of interactive chart.

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