LOC110531240 (LOC106567037)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110531240
gene name LOC106567037
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 66228457 ~ 66430917 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036988730.1
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>TU946916
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>TU946914
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Function

NR:

description
PREDICTED: zinc finger protein 385A-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036988730.1 False 8469 mRNA 0.45 8 66228457 66430917
TU946916 False 983 TUCP 0.52 3 66234991 66238174
TU946914 True 648 TUCP 0.57 5 66248103 66430769

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110532692 LOC106572690 coding downstream 80840 66127916 ~ 66147685 (-)
LOC110532694 LOC106572659 coding downstream 124406 66081763 ~ 66104051 (-)
LOC110532695 LOC106572686 coding downstream 180727 66044660 ~ 66047730 (-)
LOC110532698 LOC106572673 coding downstream 334661 65883605 ~ 65893796 (-)
LOC110532700 LOC106567044 coding downstream 353246 65829202 ~ 65875211 (-)
LOC118966098 LOC106567034 coding upstream 91745 66522662 ~ 66543277 (-)
LOC110532712 NA coding upstream 155692 66586609 ~ 66589365 (-)
LOC110531241 LOC106572714 coding upstream 166283 66597200 ~ 66619536 (-)
l1cama LOC106572712 coding upstream 197003 66627920 ~ 66751125 (-)
LOC110531242 LOC100380641 coding upstream 369124 66800041 ~ 66888485 (-)
G832725 NA non-coding downstream 274 66227600 ~ 66228183 (-)
G832724 NA non-coding downstream 1347 66224285 ~ 66227110 (-)
G832580 NA non-coding downstream 37063 66190958 ~ 66191394 (-)
G832570 NA non-coding downstream 56580 66171667 ~ 66171877 (-)
G832565 NA non-coding downstream 65518 66162596 ~ 66162939 (-)
G832813 NA non-coding upstream 739 66431656 ~ 66431871 (-)
G832814 NA non-coding upstream 1484 66432401 ~ 66432643 (-)
G832815 NA non-coding upstream 1886 66432803 ~ 66433246 (-)
G832818 NA non-coding upstream 4535 66435452 ~ 66435691 (-)
G832820 NA non-coding upstream 8686 66439603 ~ 66441656 (-)
G832503 NA other downstream 192277 66035872 ~ 66036180 (-)
G832480 LOC106572660 other downstream 226723 66001219 ~ 66001734 (-)
G832461 NA other downstream 281864 65946182 ~ 65946593 (-)
G832401 kmt2d other downstream 433267 65793857 ~ 65795190 (-)
G832991 myl6b other upstream 77801 66506278 ~ 66515999 (-)
G833029 NA other upstream 156495 66587412 ~ 66588680 (-)
G833521 NA other upstream 748332 67179249 ~ 67185243 (-)
LOC110531246 LOC106572701 other upstream 1017534 67327762 ~ 67455661 (-)
LOC110532727 LOC106572699 other upstream 1112233 67543067 ~ 67560577 (-)

Expression


Co-expression Network