XLOC_026802


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_026802
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 53573131 ~ 53589177 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00053142
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00053142 True 16047 lncRNA 0.37 1 53573131 53589177

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_026801 notch3 coding downstream 13550 53526025 ~ 53559581 (-)
XLOC_026800 shfl coding downstream 64551 53491105 ~ 53508580 (-)
XLOC_026799 soul5 coding downstream 86962 53476155 ~ 53486169 (-)
XLOC_026798 nr5a5 coding downstream 107882 53457192 ~ 53465249 (-)
XLOC_026797 NA coding downstream 120349 53449116 ~ 53452782 (-)
XLOC_026803 rdh8a coding upstream 98468 53687645 ~ 53722182 (-)
XLOC_026804 BX004869.1 coding upstream 100133 53689310 ~ 53689428 (-)
XLOC_026805 NA coding upstream 253355 53842532 ~ 53842784 (-)
XLOC_026806 trip10a coding upstream 841916 54431093 ~ 54500354 (-)
XLOC_026807 si:ch73-208g10.1 coding upstream 913173 54502350 ~ 54524194 (-)
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XLOC_026793 NA non-coding downstream 496220 53074847 ~ 53076911 (-)
XLOC_026786 BX897682.1 non-coding downstream 1355880 52215045 ~ 52217251 (-)
XLOC_026785 NA non-coding downstream 1376307 52194623 ~ 52196824 (-)
XLOC_026811 NA non-coding upstream 1159219 54748396 ~ 54784321 (-)
XLOC_026812 NA non-coding upstream 1202376 54791553 ~ 54820900 (-)
XLOC_026814 NA non-coding upstream 1284224 54873401 ~ 54884180 (-)

Expression


Co-expression Network