XLOC_026832 (FQ311920.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_026832
gene name FQ311920.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 56354644 ~ 56355966 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00052178
cctttttgctgtgaggtgacaactgcgccactgcgtcacccaagCTCATTATAAAACAAGCTAATTTTTGTACATAAAggtcataaaacaaataagctacattaaaaaaagtattgTGGTGTGTGTTAACTATACAGAAAATGTGATTGCAGTAAAGAATAACACAGAATAGAGCATTTTTATTAACCATATTTTTACATAACTGTTATGTAAAAGTACTCCTAGACGTTCTTTATGTTGAGTTGCACACCATGTACTCTTACTGTTAAgccttaaattaataaaaaaaatgtgtgtggccGTGCATCAgtaatatattatacattttaatgattGAAATAGAATGCCACAGTTTTTGTTCAGTGGTATTGTTTAATACAAactctaaaataaaatgtctgtctgtccgtccgtccgtacgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatcattttatctatcatctctctatctctctatctctctatctatctatctgtctgtctgtctgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccatcgatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatctctctgtcaTTTTATCTATCATCTCTctgtcattctatccatccatccatccatccatccatccatcgatccatcgatcgatcgatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatccatccatccatccatctctctgtcaTTTTATCTATCATCTctctgtcattccatccatccatccatccatccatccatccatccatctctctgtcaTTTTATCTATCATCTCTctgtcattctatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatcgatcgatcgatcgatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatccatccatccatccatctctc

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000100672

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00052178 True 1323 mRNA 0.36 1 56354644 56355966

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_026830 cep112 coding downstream 324527 55684449 ~ 56030117 (-)
XLOC_026831 NA coding downstream 515130 55838454 ~ 55839514 (-)
XLOC_026829 axin2 coding downstream 703873 55627948 ~ 55650771 (-)
XLOC_026828 tex2 coding downstream 817548 55487261 ~ 55537096 (-)
XLOC_026827 ern1 coding downstream 873487 55420176 ~ 55481157 (-)
XLOC_026833 cyth1a coding upstream 52874 56408840 ~ 56574965 (-)
XLOC_026834 CU855917.1 coding upstream 55175 56411141 ~ 56413023 (-)
XLOC_026835 SMIM10 coding upstream 209334 56565300 ~ 56569968 (-)
XLOC_026836 stk19 coding upstream 245863 56601829 ~ 56617097 (-)
XLOC_026837 zgc:112148 coding upstream 505093 56861059 ~ 56871984 (-)
XLOC_026814 NA non-coding downstream 1470464 54873401 ~ 54884180 (-)
XLOC_026812 NA non-coding downstream 1533744 54791553 ~ 54820900 (-)
XLOC_026811 NA non-coding downstream 1570323 54748396 ~ 54784321 (-)
XLOC_026805 NA non-coding downstream 2511860 53842532 ~ 53842784 (-)
XLOC_026840 NA non-coding upstream 681128 57037094 ~ 57037670 (-)
XLOC_026851 CT583687.2 non-coding upstream 1701648 58057614 ~ 58059819 (-)
XLOC_026854 NA non-coding upstream 1752465 58108431 ~ 58110154 (-)
XLOC_026858 CABZ01038493.1 non-coding upstream 1854339 58210305 ~ 58217276 (-)

Expression


Co-expression Network