G765224


Basic Information

Item Value
gene id G765224
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 4760163 ~ 4762575 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU871082
CAATACATTCTGGTTGGACCTGAGAAATCGATAGTCTCTATTGATTGGTGTGTATTGATTCTGGTCCTATCACAGGACTGCTGGGTATTAGCCTGGCCCTGACCTGATCATTGATTGGCAGAGAGAACTGAGAGAGGATTATAGGATGAGTggtttgtatgtttgtatgtgtgtatgtgtgtttgtgtttgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtattggtgtcCTGAGATTAGTTCGAAAAGAGTGGTGTAttgtagtttagtgtagtgtagtgtattgtagagtggtgtagtgtagtgtagtgtagtgtattgtagagtggtgtagtgtagtgtagtgtagtgtattgtagagtggtgtagagtggtgtagtgtagtgtagtgtagtgtattgtagagtggtgtagagtggtgtagcgtagtgtagtgtattgtagagtggtgtagtatagtgtggtttagtgtagtgtggtgttgtttagtgtagtgtagtgtagtctattgtagtgtagtgtagtgtggtgtagaatagtggggtgtagtgtagtgtagtgtggtgtagtgtagtgtggtgtaatgcagtgtagtgtggtgtagtgtagtgtagtgtagtctattgtggtgtagtgtggtttAGTGTAGTCtattgtggtgtagtgtagtgtagtgtggtgtagtgtaatatagtgtagtgtagtctattgtggtgtagtgtagtctattgtggtgtagtgtagtgtagtgtggtttagtgtagtgtagtgtggtgcattgtagtgtattgtagagGCGTGTAGagtcgtgtagtgtagtgttgtgtatagtagtgtatagtagtgtagtgtgctgtggtgtattgtagtgtggcgtagtgtattgtagagtagtgtagtgtagtgtggtgtagtgtggtgtagtgtagtgtagtgctgtgtagtgtagtgtggtgtagtgtagtgtattgtgctgtggtgtattgtagtgtggtgtagtgtattgtagtgtagtgtagtgtggtgtattgtagtgtggtgtagtgtggtgaggtgtagtgtggtgtagtgtagtgtggtttagtgtagtgtagtgtagtgtggtgtattgtagtgcagtgtggtgtagtgtggtgtagtgtagtgtattgtagtgtagtgtggtgtagtgtagagtggtgtagtgtggtgtagtgtagtgaggTGTAGTGTGGTTTAGTGTAGAGTGGTGTAGTCTGGTGgagagtggtgtagtgtggtgttgtgtggtgtagtgtagtgtagtgtggtgtagtgcagtgtagtgtggtgtagtgtggtttagtgtagagtggtgtagtgtggtgtacagtggtgtagtgtagtgtagtgtagtctattgtggtgtagtgtggtttAGTGTAGTCtattgtggtgtagtgtagtgtagtctattgtggtgtagtgtggtttAGTGTAGTCtattgtgttgtagtgtagtgtagtgtggtgtagtgtaatgtagtgtagtatagtctattgtggtgtagtgttgtctattgtggtgtagtgtagtgcagtgtggtTTAGTGTGGTgcattgtagtgtattgtagaggggtgtagagtgatgtagtgtagtgtagtgtatagtagtgtagtgtattgtagtgtggtctagtgtgttgtagtgtggtgtagtgtagaagGATTAGTGAagagtggtgtagagtggtgtagtgtagagtggtgtagtgtggtttagtgtcgtgtggtgtagtgtggtgtagtgtagagtggtgtagtgtagtgtagtgtagtgttgtgtagtgtagagtggtgtagtgtagtgtggtgttgtgtagtttagtgtagtgtagtgtggtgtagtgtagtgtggtttagtgtagagtggtgtagtgtagagtggtgtagtgtagtgtagtgttgtgttgtgtagtgtagagtggtgtagtgtagtgtggtgtagtgtagtgtagtttagtgtgatgtagtgtggtgtagtgtggtgtagtgtggtttagtgtggtgtatagtagtgtagtgtagtgtggtgtattgtagtgtagtgtggtgtagtgtagtgtattgtagtgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU871082 True 2213 lncRNA 0.43 4 4760163 4762575

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110515555 NA coding downstream 184297 4574163 ~ 4575872 (-)
LOC118965975 NA coding downstream 194762 4564760 ~ 4565401 (-)
LOC118965974 NA coding downstream 224123 4534165 ~ 4536040 (-)
LOC118966171 NA coding downstream 230570 4528651 ~ 4529593 (-)
LOC110518373 LOC106597704 coding downstream 292476 4465470 ~ 4467687 (-)
LOC118965976 rbm46 coding upstream 112507 4875082 ~ 4879698 (-)
rbm46 rbm46 coding upstream 117329 4879904 ~ 4900797 (-)
LOC118965977 LOC106578182 coding upstream 139311 4901886 ~ 4916456 (-)
LOC110532986 LOC106578168 coding upstream 160456 4922850 ~ 4933486 (-)
LOC110518233 LOC106594193 coding upstream 223237 4985812 ~ 5018523 (-)
G765217 NA non-coding downstream 50980 4708750 ~ 4709183 (-)
G765210 NA non-coding downstream 73648 4685170 ~ 4686515 (-)
G765188 NA non-coding downstream 122140 4637139 ~ 4638023 (-)
G765183 NA non-coding downstream 131142 4616913 ~ 4629021 (-)
G765184 NA non-coding downstream 138918 4620716 ~ 4621245 (-)
G765246 NA non-coding upstream 39380 4801955 ~ 4802200 (-)
G765260 NA non-coding upstream 79867 4842442 ~ 4843240 (-)
G765275 NA non-coding upstream 110708 4873283 ~ 5168519 (-)
G765284 NA non-coding upstream 125670 4888245 ~ 4889945 (-)
G765286 NA non-coding upstream 137767 4900342 ~ 4910027 (-)
G765100 LOC106597704 other downstream 224084 4446327 ~ 4536079 (-)
G765059 NA other downstream 440337 4270732 ~ 4319826 (-)
LOC118966151 LOC106587785 other downstream 743754 4012152 ~ 4033537 (-)
LOC110498423 LOC105006500 other downstream 901270 3851852 ~ 3901549 (-)
G765347 NA other upstream 292905 5055480 ~ 5057322 (-)
G765579 LOC101077030 other upstream 534901 5297476 ~ 5298437 (-)
G766599 LOC106578100 other upstream 1438794 6201369 ~ 6209209 (-)
G766640 NA other upstream 1489022 6251597 ~ 6262155 (-)
G766665 NA other upstream 1578046 6340621 ~ 6365895 (-)

Expression


Co-expression Network