G766640


Basic Information

Item Value
gene id G766640
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 6251597 ~ 6262155 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU872925
AGGGAGATAAGATAAGGACAACACCCAATATGACTTAAatagccctgacacacacacacacacacacacacacacacacacctctaaccATGCATGTACATGcctacgtcacacacacacacccattcgCTAACATTCAGAAACTACATCCCTAATTGGTTAAAACTAAGGTTTGTCAACCAATTACCAAATAAATTTACCAAATCACCCTTTAATCCAATCATATCTATCCCTCCGAGATTTACTGATTAggtctgattgattgattgattgagggaTGGTTGGTTTGAGTCTCACCTGCTTTCCTCATCCTGACCCTCTCCCTCATACGGACTCCTCAAGAAAAATCAACACAAGTTTAGTCTTCGGAGCTAACGGCTAATAGGCTACAAAATGTTAGTTTAACAGCTagcaacaccactaagcacaGTACCATCCTCCACAAGCACACACGTTGACATTCCTATTCCAGGACCCATTCCTATTCCAGAACCCATTCCTATTCCAGAACATAGTGGCTTTGTGTATCAGTACAGAACGCCCTGTAGCATAAAACCACACCAGGGAGGGAAAAAATTTAAGGGGAGTAGGGGCATTTTAAAGATTTATTCATGATGATTGAAATGTTTATGAACTAATAGATTAGAACAGAGGGATGGTTTGATTTAGAATGGGATGTTCAGTTTAGaatagtttggaatgggatgttcaGTTTAGaatagtttggaatgggatgttcaGTTTAGaatgggatgtttagtttgaaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatggtttagaatgggatgtttagtttggaacagtttggaatgggatgtttattATGGAAcggtttggaatgggatgtttagtttggaacagtttggaatgggatgtttagtttggaacagtttggaatgggatgtttattATGGAAcggtttggaatgggatgtttagtttggaacagtttggaatggtatgtttagtttggaacagtttggaatgggatgtttagtttggaacagtttggaatgggatgtttagtttggaacagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaacggTTTGGTTTGGAATGGTATGGTTTAGATTAATGATTTAATTTGTAATAGGAtggtttagtttggaatggtttaATTTGGaatggtatggtctggtctggaatGGTTTGGTCTGGAATGTAGGGGAGTATGAGTCCTGTGCCTAAagaagagggaaggaaggagggaaagtGGGTCAAATAGTCTCTCCAACAGCATTACACTGCTGCACCTAGTCAGACTAGCCCTCTAAACCTgcacacacagcacagccatgTACAGATAACAGAGGACGGATAGAATGAACAATATATTAGATAAGAAAATAGAGCCATACACTAccgtcaaaagttttagaacacctactcattcaagggt
>TU872926
gggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatggtttagaatgggatgtttagtttggaatggtttagaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatggtttagaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatggtttagaatgggatgtttagtttggaatgggatgttgtgtttggaatgggatgttgtgttgtgtttggaatggggtgttgtgtttggaatgggatgttgtgtttggaatgggatgttgtgtttggaatggtttagaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatggtttggaatgggatgtttagtttggaatggtttagaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatggtttagaatgggatgtttagtttggaatgggatgttgtgtttggaatgggatgttgtgttgtgtttggaatggggtgttgtgtttggaatgggatgtttagtttggaatggtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgttgtgtttggaatgggatgttgtgtttggaatgggatgttgtgtttggaatgttttagaatgggatgtttagtttggaatgggatgttgtgttgtgtttggaatgggatgttgtgtttggaatgggatgtttagtttggaatggtttagaatgggatgtttagtttggaatggtttagaatgggatgtttagtttggaatggtttagaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatggtttagaatgtgatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaacagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaacggTTTGGTTTGGAATGGTTTAGAATggtatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaacagtttggaatggtatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatggtttagaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatggtttagaatggtatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttggtttggaatgggatgtttattATGGAACGGTttggtttggaatgggatgtttagtttggaacggTTTGGTTTGGAATGGtttagaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaacggtttggtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaacggtttggtttggaatgggatgtttagtttggaacggtttggtttggaatgggatgtttagtttggaacagtttggaatggtatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatggtttagaatggtatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaacagtttggaatggtatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaacagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttattATGGAACGGTTTGGTTTGGAATGGgatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaatgggatgtttagtttggaacggTTTGGTTTGGAATGGTATGGTTTAGATTAATGATTTAATTTGTAATAGGAtggtttagtttggaatggtttaATTTGGaatggtatggtctggtctggaatGGTTTGGTCTGGAATGTAGGGGAGTATGAGTCCTGTGCCTAAagaagagggaaggaaggagggaaagtGGGTCAAATAGTCTCTCCAACAGCATTACACTGCTGCACCTAGTCAGACTAGCCCTCTAAACCTgcacacacagcacagccatgTACAGATAACAGAGGACGGATAGAATGAACAATATATTAGATAAGAAAATAGAGCCATACACTAccgtcaaaagttttagaacacctactcattcaagggt

Function

NR:

description
hypothetical protein EH28_02767

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU872925 False 1509 lncRNA 0.40 3 6251597 6262155
TU872926 True 2160 TUCP 0.38 2 6251597 6256628

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
exoc6b LOC106560516 coding downstream 61183 6066184 ~ 6190414 (-)
LOC110531356 LOC106578148 coding downstream 226848 5982772 ~ 6024749 (-)
LOC118966152 NA coding downstream 437722 5813423 ~ 5813875 (-)
LOC110511386 LOC106560508 coding downstream 1003975 5194243 ~ 5247622 (-)
LOC110532892 LOC106578154 coding downstream 1175758 5058029 ~ 5075839 (-)
rcor2 rcor2 coding upstream 3176 6265331 ~ 6287151 (-)
LOC118936332 LOC106578081 coding upstream 78421 6340576 ~ 6351208 (-)
LOC118966221 NA coding upstream 78645 6340800 ~ 6340873 (-)
LOC118966228 NA coding upstream 80053 6342208 ~ 6342277 (-)
LOC118966211 NA coding upstream 81155 6343310 ~ 6343381 (-)
G766633 NA non-coding downstream 15113 6235941 ~ 6236484 (-)
G766631 NA non-coding downstream 17014 6233277 ~ 6234583 (-)
G766629 NA non-coding downstream 19258 6231442 ~ 6232339 (-)
G766624 NA non-coding downstream 28900 6222050 ~ 6222697 (-)
G766620 NA non-coding downstream 38247 6212263 ~ 6213350 (-)
G766657 NA non-coding upstream 38483 6300638 ~ 6323871 (-)
G766658 NA non-coding upstream 58038 6320193 ~ 6321181 (-)
G766682 LOC106578097 non-coding upstream 68748 6330903 ~ 6334035 (-)
G766687 NA non-coding upstream 76437 6338592 ~ 6338812 (-)
G766599 LOC106578100 other downstream 42388 6201369 ~ 6209209 (-)
G765579 LOC101077030 other downstream 953160 5297476 ~ 5298437 (-)
G765347 NA other downstream 1194275 5055480 ~ 5057322 (-)
LOC110515555 NA other downstream 1675725 4574163 ~ 4575872 (-)
G765100 LOC106597704 other downstream 1715518 4446327 ~ 4536079 (-)
G766665 NA other upstream 78466 6340621 ~ 6365895 (-)
G766749 NA other upstream 195048 6457203 ~ 6464631 (-)
G766850 LOC106578109 other upstream 349924 6612079 ~ 6613412 (-)
LOC110531366 LOC106578102 other upstream 610681 6851197 ~ 6882912 (-)
LOC110531380 LOC106578126 other upstream 703299 6963142 ~ 6969857 (-)

Expression


Co-expression Network