G767420


Basic Information

Item Value
gene id G767420
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 7381555 ~ 7383075 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU874025
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>TU874027
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>TU874028
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>TU874029
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>TU874030
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>TU874031
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>TU874032
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>TU874033
TGTAGTAAAcaattattatactattactatactgtactattgctgtactgtactattactgtattgtactgtactattaCTATATTGTACTGCACTATTGCTGTACTGTACCATTActttattgtactgtactattATTATATTGTACGGTACTATTACTGTACtagtattatactattacagtattgtactgtactattgctgtactgtactgtactattactatattgtactgtactattactactactgtattgtactatattgtactgtactagtaCTATACTATtacagtattgtactgtactattaCTGTATTGCACTGTACTATTTCTATActattactgtattgtactgtactatcactatattgtactgtactattaCTGTACTattactatattgtactgtactagtaCTGTACTAGTACTATACTATtacagtattgtactgtactattacagtattgtactgtactattactgtattgtactatTATTGTACTAGTACAGTattgtactgttactgtagtattACAGTATTGTATTATTGCCGTACTATTACAGTACTATTACtgtactattactatactattacagtattgtactgtactattaCAGTATTGCACTGTACTATTACAGTATTGTACCATTATTGTACTATTAGTGTACTATTAGTGCACAAAGTTTTCTCCGTGCACTCAGTTCTGCCCTGAAACTGGTGGAATTCCTAattagtccactacttttgacaagaggacCCATAGGCATTTGGGACACGGGCCTCTGTCTTTCTCGTGGCTCATATATTGTGTTCGTGGAAGACTGTCGCTCCACAGCGATAGCGATCTTCTCTGTGAAATGAAATGTTCcacttttgtttgtttactatactgttgttttgttgttgttaaaaacattttttttttttaaatatgatcTGGATCTTTTGAAGTTCATGTAAACATGTCAAATCTGTGATACGCTATGATATTCCTGCTGGGTTTTTTTAACATAAAAATGGAATTACTGGAATCTAGAATAGTCATTATATTAATTGTGTTTCCATGGTTTATAATATATGacaagatctgtgcctcaactcTTTTGATGATTTTTGAtgttatgacagacacacacacacacacacacacacacttttgatgttatgacacacacacacacacttttgatgttatgacacacacacacacacacttttgatgTTATGACATAAAATCAGTGTGATAAATGAAGGAAAGTGGTGAAAACACTGAGAAATAAAATGGAGGATTGAAGAGGGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU874025 False 1241 lncRNA 0.32 4 7381555 7383075
TU874027 False 1204 lncRNA 0.32 3 7381555 7383075
TU874028 False 1268 lncRNA 0.31 2 7381555 7383075
TU874029 False 1202 lncRNA 0.32 4 7381555 7383075
TU874030 False 1202 lncRNA 0.32 3 7381555 7383075
TU874031 False 1280 lncRNA 0.32 2 7381555 7383075
TU874032 False 1239 lncRNA 0.32 4 7381555 7383075
TU874033 True 1304 lncRNA 0.32 4 7381555 7383075

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
tmem179ba t179b coding downstream 2523 7360909 ~ 7379032 (-)
LOC118966172 NA coding downstream 306804 7071957 ~ 7074751 (-)
LOC110531373 LOC106578114 coding downstream 310436 7068527 ~ 7071119 (-)
LOC110531378 LOC106578114 coding downstream 316362 7054835 ~ 7065193 (-)
LOC110531367 LOC106578116 coding downstream 327300 6970858 ~ 7054255 (-)
prox3 LOC106578142 coding upstream 274 7383349 ~ 7390543 (-)
snx15 snx15 coding upstream 24218 7407293 ~ 7426803 (-)
LOC110515519 LOC106578133 coding upstream 422426 7805501 ~ 7873725 (-)
LOC118965986 NA coding upstream 677509 8060584 ~ 8061856 (-)
LOC118965984 NA coding upstream 679151 8062226 ~ 8064024 (-)
G767468 NA non-coding downstream 38408 7342931 ~ 7343147 (-)
G767463 NA non-coding downstream 42425 7338755 ~ 7339130 (-)
G767460 NA non-coding downstream 43766 7336750 ~ 7337789 (-)
G767461 LOC106583515 non-coding downstream 48628 7328900 ~ 7332927 (-)
G767445 NA non-coding downstream 85496 7295671 ~ 7296059 (-)
G767476 NA non-coding upstream 26752 7409827 ~ 7411001 (-)
G767477 NA non-coding upstream 32958 7416033 ~ 7416429 (-)
G767483 NA non-coding upstream 47127 7430202 ~ 7434586 (-)
G767516 NA non-coding upstream 132160 7515235 ~ 7517790 (-)
G767056 ovol1 other downstream 130480 7245644 ~ 7251075 (-)
LOC110531380 LOC106578126 other downstream 411864 6963142 ~ 6969857 (-)
LOC110531366 LOC106578102 other downstream 499437 6851197 ~ 6882912 (-)
G766850 LOC106578109 other downstream 768143 6612079 ~ 6613412 (-)
G766749 NA other downstream 916924 6457203 ~ 6464631 (-)
LOC110510419 LOC106560462 other upstream 729513 8112588 ~ 8155916 (-)
G768390 NA other upstream 806368 8189443 ~ 8191898 (-)
LOC118936684 LOC106578100 other upstream 838456 8221531 ~ 8253809 (-)
LOC110531377 LOC106578102 other upstream 895742 8277882 ~ 8283359 (-)
G768780 NA other upstream 1599393 8982468 ~ 8990706 (-)

Expression


Co-expression Network