G771639 (LOC106577893)


Basic Information

Item Value
gene id G771639
gene name LOC106577893
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 12021717 ~ 12032123 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU879128
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Function

NR:

description
histidine N-acetyltransferase-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU879128 True 10377 lncRNA 0.40 2 12021717 12032123

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
trnal-aag NA coding downstream 51467 11970169 ~ 11970250 (-)
LOC110532912 LOC106577883 coding downstream 232952 11759145 ~ 11788765 (-)
LOC110531453 LOC106577884 coding downstream 271490 11741911 ~ 11750227 (-)
LOC110531452 LOC106577886 coding downstream 320104 11698392 ~ 11701613 (-)
LOC110531450 med11 coding downstream 360884 11658664 ~ 11660833 (-)
LOC110531465 LOC107666294 coding upstream 94104 12092145 ~ 12144786 (-)
LOC110531459 LOC106577897 coding upstream 115371 12147494 ~ 12153015 (-)
trnas-uga-2 NA coding upstream 153509 12185486 ~ 12185735 (-)
trnaw-cca-4 NA coding upstream 166584 12198707 ~ 12198778 (-)
sox19b LOC106577904 coding upstream 404217 12436340 ~ 12441768 (-)
G771635 NA non-coding downstream 12513 12008299 ~ 12009204 (-)
G771620 NA non-coding downstream 40755 11980509 ~ 11980962 (-)
G771618 NA non-coding downstream 42501 11978889 ~ 11979216 (-)
G771615 NA non-coding downstream 49861 11971580 ~ 11971856 (-)
G771613 NA non-coding downstream 51706 11969603 ~ 11970011 (-)
G771642 NA non-coding upstream 751 12032874 ~ 12033112 (-)
G771644 NA non-coding upstream 2215 12034338 ~ 12034577 (-)
G771645 NA non-coding upstream 2733 12034856 ~ 12035098 (-)
G771646 NA non-coding upstream 3072 12035195 ~ 12035467 (-)
G771647 NA non-coding upstream 3419 12035542 ~ 12035950 (-)
G771614 NA other downstream 50363 11970904 ~ 11971354 (-)
G771540 LOC106577916 other downstream 133002 11870589 ~ 11916867 (-)
G771457 NA other downstream 392129 11628616 ~ 11629588 (-)
G772877 LOC106577934 other upstream 962146 12994269 ~ 12996410 (-)
G773163 NA other upstream 1558130 13586326 ~ 13666937 (-)
G773168 NA other upstream 1665056 13697179 ~ 13699328 (-)
LOC110531538 NA other upstream 1948205 13977459 ~ 13987582 (-)
LOC118966145 LOC106599223 other upstream 2217278 14249401 ~ 14254157 (-)

Expression


Co-expression Network