G772753


Basic Information

Item Value
gene id G772753
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 12758490 ~ 12764721 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU880434
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>TU880435
GTTGACCACTATTACCAATTTCATTAGCTATTAAGTAAAGTAAATCACACTTACTAAGCCCACTATTCGTGGTTGACTGTCCGGCAGGTGGAGTTGTAGTGCTCATTTGTGTAGTTTTTGGTAGCTCAGTAGTGGTTGTGAAATTAGCTAAAGTTAttgttgttgtattaggagctgtggttgttgtattagaagctgtagttgttgtaaaaggagctgtagttgttgtattagGAGCTGTAGTAGTTGTATTAGGAGATGTAGTTGTTgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgtcgtattaggagctgtagttgtcgtattaggagctgcagttgttgtattaggagctgtagttgtcgtattaggagctgtagttgtcgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgtcgtattaggagctgtagttgtcgtattaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtcatagtaggtgctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctacagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcatagtaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtactAGGAGCTGGAgttgttgtcgtagtaggagctgtggttgttgtcgtagtaggagctgcagtggttgtcgtactaggagctgcagttgttgttatactaggagctgcagttgttgtcatagtaggagctgcagttgttgttgtaccaagagctgcagttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgttgtagtaggagctgcagtggttgttgtactagtagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtactaggagctgcagttgttgttgtagtaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcggATGTTGTCGTAGTAGTtgctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgttatACTAGGAGCGGCAgttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttatactaggagctgcagttgttatACTCGGAGCTGCAGTTgctgtcgtagtaggagctgcagtagtagttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtagtaggagctgcagttgttgaactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagtggttgtcgtactaggagctgcagttgttgtcgtaCTAGGAGCTGCAGatgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagcggCAGTGGTTGTTGtactaggagctgcagttgttgtcgtagtagcagctgtagttgttgtcgtagtaggagctgcagtagtTGTACTAgaagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtactaggagctacagttgttgtactaggagctgcagttgttgtactaggagctgtagttgttgtacTAGGAgttgcagttgttgttgttgttgtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggatctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagtggttgtcgtagtaggagctgcagtggttgtcgtagcaggagctgcagtggttgtcgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtaCTAGGAGCTGCAGatgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagcagcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtagcagctgtagttgttgtcgtagtaggagctgtagtagttgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtactaggagctacagttgttgtactaggagctgcagttgttgtactaggagctgtagttgttgtactaggagctgcagttgttgttgttgttgtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtactAGGATCTGCAgttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtactagcagctgcagttgttgttgtactAGGATCTGCAgttgttgtcgtagtaggagctgcagtggttgtcgtagtaggagcagcagtggttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtaccaagagctgcagttgttgttgcaCTAGTATCTGCAATTGTTGTCGTAGTAGGAGTTGCAGTTGTTGTTGTactaggagctgcagtggttgttgtacTAAGAGCTGTGGTGGTTGTTGTACTAGGAGCTGTGGTTGTTGaactaggagctgcagttgttgtcgtaGTAGGATCTGCAGTTGTTGTACTAGGAGTTGCAGTTGTTGTACTAGGAGCTGTGGTGGTTGTTGtactaggagctgcagttgttgttgtactAGGATCTGCAGTTGTTGTCGTAGTAGGATCTGCAgttgttgtcgtagtaggagctgcagtggttgtcgtagtagaAGCAGCAATTGTTGTTGTactaggagctgcagtggttgttgtacTAGGAGCTGCAAATGTTGTCGtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcactggttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagcttcagttgttgtcgtagtaggagcttcagttgttgtcgtagtaggagcttcagttgttgtcgtagtaggagcttcagttgttgtcgtagtaggagcttcagtggttgtcgtagtaggagttgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgtagtaggagctgcggttgttgtagtaggagctgtggttgtagttgttATAGCAGGAAGTGTGGTTGTTGgagtaggagctacagttgtggttgtaGAAGGatctgtggttgttgtagtaggagctgcagttgtagttgTAGAAGGatctgtggttgttgtagtaggagctgcagttgttgctGTAGTAGGAGCCTCAGTTGTGGTTGTCATATTAGGATCTGTGGTTGTGCTTGTTACAGAGCAGAGGCTGCCTATTACTGGGACAAATATTACAATTATTAGGTAGCTTAAAAATACCTTAAGACCAGAGACCAGAAATTGGCCCTGGCTTTTCCAAAACATCTGCCCATTTTTTCCCTCAACGTCACCACACAAAAAATTGACAGGCCCATTGGTCTTAAGATGGACCAGCACATCTGGCATTTGCTGGAAATTCAATATAACTAGTCTATTTGTGTCCCGTTTCAAGAAGCTAGGCCTAATATCgcatgtcactacttcacaggagaggcatttcaacgttttttttattgttatcaaaatgcgttttttggaaTAAAAGCCTTCTGGAATATATGAACGTTCATGTGCCTTAATTTCAAACTTTTATGCCATCTGTATATACGAATACAATTCTTACaatacgagcctagttggtttagccacggaaaaaacAGGAACCTTCCTTTCAGCCATGATTGGTTGAGATAATGGATggactggacatgccgagagatgagtttgggtTTGTATTCCATGTAGCACGATTCTATTTATAACATgacctgctcagtgtgtgtg
>TU880436
GTTGACCACTATTACCAATTTCATTAGCTATTAAGTAAAGTAAATCACACTTACTAAGCCCACTATTCGTGGTTGACTGTCCGGCAGGTGGAGTTGTAGTGCTCATTTGTGTAGTTTTTGGTAGCTCAGTAGTGGTTGTGAAATTAGCTAAAGTTAttgttgttgtattaggagctgtggttgttgtattagaagctgtagttgttgtaaaaggagctgtagttgttgtattagGAGCTGTAGTAGTTGTATTAGGAGATGTAGTTGTTgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgtcgtattaggagctgtagttgtcgtattaggagctgcagttgttgtattaggagctgtagttgtcgtattaggagctgtagttgtcgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgttgtattaggagctgtagttgtcgtattaggagctgtagttgtcgtattaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtcatagtaggtgctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctacagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcatagtaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtactAGGAGCTGGAgttgttgtcgtagtaggagctgtggttgttgtcgtagtaggagctgcagtggttgtcgtactaggagctgcagttgttgttatactaggagctgcagttgttgtcatagtaggagctgcagttgttgttgtaccaagagctgcagttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgttgtagtaggagctgcagtggttgttgtactagtagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtactaggagctgcagttgttgttgtagtaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcggATGTTGTCGTAGTAGTtgctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgttatACTAGGAGCGGCAgttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttatactaggagctgcagttgttatACTCGGAGCTGCAGTTgctgtcgtagtaggagctgcagtagtagttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtactaggagctgcagttgttgttgttgtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggatctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagtggttgtcgtagtaggagctgcagtggttgtcgtagcaggagctgcagtggttgtcgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtaCTAGGAGCTGCAGatgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagcagcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtagcagctgtagttgttgtcgtagtaggagctgtagtagttgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtactaggagctacagttgttgtactaggagctgcagttgttgtactaggagctgtagttgttgtactaggagctgcagttgttgttgttgttgtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagtggttgtcgtagtaggagctgcagtggttgtcgtagcaggagctgcagtggttgtcgtactaggagctgcagttgttgttgtactAGGAGCTGCAGTGTTTGTCGtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtagtaggagctgcagttgtggttgtcatAGCAGTAAGTGTGGTTGTTggagtaggagctgcagttgtggttattgTAGCAGGAGCTGTTGTAGTTGTAGAAGGAActgtggttgttgtagtaggagctgcagttgtagttgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtactAGGAGGTGCAgttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtcatagtaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtactAGGAGGTGCAgttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgttgtactAGGAGCTGCAGTAGTTGTACTAGGAGGTGCAgttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgttgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagtgcttgtcgtagtaggagctgcagtgcttgtcgtagtaggagctgcagtggttgttgtactaagagctgcagttgttgttgtactAGGATCTGCAgttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagtggttgtcatAGTAGAAGCAGCAGTGGTTGTTGTACCaagagctgcagttgttgttgtactAGGATCTGCAgttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtacTAGGAGCTGTGGTGGTTGTTGtactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgtcgtagtaggatcTGCAGTTGTTGtactaggagctgcagttgttgtagtaggagctgagGTTGTGGTTGTCATAGCAGTAAGTGTGGTTGTTggagtaggagctgcagttgtggttattgTAGCAGGATCTGTTGTTGTAGTTGTAGAAGGAActgtggttgttgtagtaggagctgcaatTGTAGTTGtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtgctagaagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtactAGGAGgtgcagttgttgttgtagtaggagctgcagttgttatcgtggtaggagctgcagttgttgtcgtaGTAGGATCTGCAGTgcttgtcgtagtaggagctgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtactAGGATCTGCAgttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtactagcagctgcagttgttgttgtactAGGATCTGCAgttgttgtcgtagtaggagctgcagtggttgtcgtagtaggagcagcagtggttgttgtactaggagctgcagtggttgttgtaccaagagctgcagttgttgttgcaCTAGTATCTGCAATTGTTGTCGTAGTAGGAGTTGCAGTTGTTGTTGTactaggagctgcagtggttgttgtacTAAGAGCTGTGGTGGTTGTTGTACTAGGAGCTGTGGTTGTTGaactaggagctgcagttgttgtcgtaGTAGGATCTGCAGTTGTTGTACTAGGAGTTGCAGTTGTTGTACTAGGAGCTGTGGTGGTTGTTGtactaggagctgcagttgttgttgtactAGGATCTGCAGTTGTTGTCGTAGTAGGATCTGCAgttgttgtcgtagtaggagctgcagtggttgtcgtagtagaAGCAGCAATTGTTGTTGTactaggagctgcagtggttgttgtacTAGGAGCTGCAAATGTTGTCGtactaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcactggttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgttgtactagtagctgcagttgttgttgtactaggagctgcagttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgcAGTAGGAGATGCAGTTGTTGTTGtactaggagctgcagttgttgtactaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagctgcagttgttgtcgtagtaggagcttcagttgttgtcgtagtaggagcttcagttgttgtcgtagtaggagcttcagttgttgtcgtagtaggagcttcagttgttgtcgtagtaggagcttcagtggttgtcgtagtaggagttgcagtggttgttgtactaggagctgcagttgttgtagtaggagctgcggttgttgtagtaggagctgtggttgtagttgttATAGCAGGA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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU880435 False 4681 lncRNA 0.46 3 12758490 12764721
TU880436 True 5746 lncRNA 0.46 3 12758490 12764721

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G772797 NA non-coding upstream 72545 12837266 ~ 12838655 (-)
G772798 NA non-coding upstream 75489 12840210 ~ 12840885 (-)
G772802 NA non-coding upstream 80375 12845096 ~ 12845394 (-)
G772803 NA non-coding upstream 80810 12845531 ~ 12845754 (-)
G772857 NA non-coding upstream 175073 12939794 ~ 12942007 (-)
G771614 NA other downstream 787136 11970904 ~ 11971354 (-)
G771540 LOC106577916 other downstream 869775 11870589 ~ 11916867 (-)
LOC110532912 LOC106577883 other downstream 969921 11759145 ~ 11788765 (-)
LOC110531452 LOC106577886 other downstream 1056907 11698392 ~ 11701613 (-)
G771457 NA other downstream 1128902 11628616 ~ 11629588 (-)
G772877 LOC106577934 other upstream 229548 12994269 ~ 12996410 (-)
G773163 NA other upstream 825532 13586326 ~ 13666937 (-)
G773168 NA other upstream 932458 13697179 ~ 13699328 (-)
LOC110531538 NA other upstream 1215607 13977459 ~ 13987582 (-)
LOC118966145 LOC106599223 other upstream 1484680 14249401 ~ 14254157 (-)

Expression


Co-expression Network