G773437


Basic Information

Item Value
gene id G773437
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 14024873 ~ 14028528 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU881209
ATTTTCCAGCCTGCTAGCACCCCTCAATGTCAGGAGCGGCAGAGAAGACCTTTTAGGATCTGACGGCTGACCAGGATACTCATTACGAGGGCCTGAAAAAGGAAATCCTGTGCCGGTGTAGTTACACCCTGATTAGCAGGGCGTAAAGGTTCCGTGATTGGGCATATGATGCTACAACAAACTCACCAATCACAAATGCATGATCTGATTAGGCCGGCCAAGAGCTGGCTAACTGCTGAACAACTGACAATCACACCCATCAAGAAAGTGGTCATAGATACATTTCTACACTACAAGATAAATTATGTTTGAAAAACGTGTTAAATATCttctaaaaataaaatgtattcatCATGAGGGCCTTAAAAAAAATAACTAGTAatgatacatacagttgaagtcggaagattacatacaccttagccaagtacatttaaactcagtctctcacaattcctgacatttaatcctagtaaaaatcccctgtcttaggtcagttaggatcaccactttatttaaagaatgtgaaatgtcagaagaataatagagagaattatttatttcagcttttatttctttcatcacattcccagtgggtcagaagtttacatacactcaattagtatttgatagcattgcctttaaattgtttaacttgggtcaaatgtttcgggtatccttccacaagcttcccgcaataactttcctgaggtcttgactgatttcttttgattttcccatgatgtcaagcaaagaggcactgagtttgaaggtaggccttgaaatacatccacaggtacacctacaattgactcaaatgatgtcaatttgcctatcagaagcttctaacgccatgacatcattttctggaattttccaagctgtttaaaggcacagtcaaattagtgtatgtaaacttctgacccactggaattgtgacacacataagtgaaataatctgtctgtaaacaattgctggaaaaattacctttgtcatgcacaaagtagatgtcctaaccgacttgccaaaactatagtttgttaacaagacatttgtggagtggtttaaaaacgagtTATAAAGACTCCAACATAaatgtgtgtaaacttctgacttcaactgtactacaAAAAAAGATAAAACGCTCACCTTTTTGTTACGATTTTATATAAATAGCTGAGGTGTACTATACTCACTTTGGAGGACACAAGCTCAATTACATAGTACAAGGaatatgaaaataataaataTTATATTAATTAATTTTCCTAGTCAACAAAAGTGGGTGAATCGGGCTTGAAATAATGTAAATGTTCTCTAAATATAGTAGCAATCAAATTCTAAACAACTTACTATTTAATTGCACTTTTCTTACAACtgtaaaataaaaattattatacTTAGTGACAGTGCAACATTGGCACCATTTCATACTGCTGATTACAGAGAACATTCTGTCCTGCGTCCTCAGTGACACAGAGACACGATTCAAATACATGCGGACTCGTTACAACCTTGGCTTTAAGCACAACATTTTGTCCCTTTGTGACAAAGCAAATTTGGTCATGTTTAAATTCTACAAAACGAATGTTGAGAGCTGTAAATCTGAGATTGATTTTGTTGCATTCTCTAGGCTCTTCCCTTACATATACCTGATCAGAAGTGGAGCTCCGATGCTCATAGCCAGAGGATATCCACACTTTGTCTGGATAGGCCAAAAAATGTGACATGTCAGGTATTATGCAAATGAGGGATCCAATTTCACACTCTCCCTCTCAGCTTCCTGCAGGCAGCAACAACTAAATGGGGAGACTCAGTTTTGCACTGAGCATAAAGCCAATGTCACATGAAGCATTCTGCTCAAATGTTTTGTTGCTTGCATCTGTCACATTAGGAGCTGTAGATGTTGTTGTATTatgagctgtagttgttgttgtattatgagctgtagttgttgttgtattaggagATGTAGTTGTTGCATTATGCGCTGTAGTTGTTGAAGTAGGAACTGTAGTTGTTGTATTAGGAGATGTAGTTGTTGCATTATGAGCTGTAGTTGTTGAAGTAGGAACTGTAGTTGTTGTATTAGGAGGTGTAGTTGTTGTATTAGGAGGTGTAGTTGTTgtattaggagctgtagttgttgaAGTAGGAGCTGTCGTTGTTGTTGTATTAGGACCTGTAATTGTTGTCGTATCAGGacctgtagttgttgttgtattggGAGCTGCAGATGTTGTAGTAGgaacagtagttgttgtagtatgagctgtagttgttgttgtagtagtagctgtagtagttgttgtagtaggagctttagttgttgtagtagaagcagtagttgttgtagtaggtgctgtagttgttgttgtattaggagcAGTAGTTGTTGTTTTCAGAGGTGTAGTTgtattaggagctgtagttgttgttttaggagctgtagttgttgttgtattaggagctgtagttgttgtatttggagctgtagttgttgtatttggagctgtagttgttttattaggagctgtagttgttttattaggagctgtagttgttgcaGTAGAAAATGTACTTGTTAtagtaggagctgtagttgttgttgaatTAGGATCTGGTGTTGTTTTAGTAGGAGCTGTATTTGTTTtattaggagctgtagttgttgcaGTAGAAAATGTACTTGTTAtagtaggagctgtagttgttgttgaatTAGGATCTGGTGTTGTTTTAGTAGGAGCTGTATTTGTTGTATTAGTAGCAGTACCTGTTGTAGCATAAGTTTTTGTTTTAGGAACTGTAGTTCTTGttgtcagcctccagtatttatgctgcagtagtttatgtgtcggggggctagggtcagtttgttatatctggagtacttctcctgtcctattcggtgtcctgtgtgaatctaagtgtgcgttctctaattctctccttctctctttctctctctcggaggacctgagccctaggaccatgccccaggactacctgacatgatgactccttgctgtccccagtccacctggctgtgctgctgctccagtttcaactgacctgagccataggaccatgccccaggaatacctgacatgatgactccttgctgtccccagtccacctgactgtg
>TU881210
ATTTTCCAGCCTGCTAGCACCCCTCAATGTCAGGAGCGGCAGAGAAGACCTTTTAGGATCTGACGGCTGACCAGGATACTCATTACGAGGGCCTGAAAAAGGAAATCCTGTGCCGGTGTAGTTACACCCTGATTAGCAGGGCGTAAAGGTTCCGTGATTGGGCATATGATGCTACAACAAACTCACCAATCACAAATGCATGATCTGATTAGGCCGGCCAAGAGCTGGCTAACTGCTGAACAACTGACAATCACACCCATCAAGAAAGTGGTCATAGATACATTTCTACACTACAAGATAAATTATGTTTGAAAAACGTGTTAAATATCttctaaaaataaaatgtattcatCATGAGGGCCTTAAAAAAAATAACTAGTAatgatacatacagttgaagtcggaagattacatacaccttagccaagtacatttaaactcagtctctcacaattcctgacatttaatcctagtaaaaatcccctgtcttaggtcagttaggatcaccactttatttaaagaatgtgaaatgtcagaagaataatagagagaattatttatttcagcttttatttctttcatcacattcccagtgggtcagaagtttacatacactcaattagtatttgatagcattgcctttaaattgtttaacttgggtcaaatgtttcgggtatccttccacaagcttcccgcaataactttcctgaggtcttgactgatttcttttgattttcccatgatgtcaagcaaagaggcactgagtttgaaggtaggccttgaaatacatccacaggtacacctacaattgactcaaatgatgtcaatttgcctatcagaagcttctaacgccatgacatcattttctggaattttccaagctgtttaaaggcacagtcaaattagtgtatgtaaacttctgacccactggaattgtgacacacataagtgaaataatctgtctgtaaacaattgctggaaaaattacctttgtcatgcacaaagtagatgtcctaaccgacttgccaaaactatagtttgttaacaagacatttgtggagtggtttaaaaacgagtTATAAAGACTCCAACATAaatgtgtgtaaacttctgacttcaactgtactacaAAAAAAGATAAAACGCTCACCTTTTTGTTACGATTTTATATAAATAGCTGAGGTGTACTATACTCACTTTGGAGGACACAAGCTCAATTACATAGTACAAGGaatatgaaaataataaataTTATATTAATTAATTTTCCTAGTCAACAAAAGTGGGTGAATCGGGCTTGAAATAATGTAAATGTTCTCTAAATATAGTAGCAATCAAATTCTAAACAACTTACTATTTAATTGCACTTTTCTTACAACtgtaaaataaaaattattatacTTAGTGACAGTGCAACATTGGCACCATTTCATACTGCTGATTACAGAGAACATTCTGTCCTGCGTCCTCAGTGACACAGAGACACGATTCAAATACATGCGGACTCGTTACAACCTTGGCTTTAAGCACAACATTTTGTCCCTTTGTGACAAAGCAAATTTGGTCATGTTTAAATTCTACAAAACGAATGTTGAGAGCTGTAAATCTGAGATTGATTTTGTTGCATTCTCTAGGCTCTTCCCTTACATATACCTGATCAGAAGTGGAGCTCCGATGCTCATAGCCAGAGGATATCCACACTTTGTCTGGATAGGCCAAAAAATGTGACATGTCAGGTATTATGCAAATGAGGGATCCAATTTCACACTCTCCCTCTCAGCTTCCTGCAGGCAGCAACAACTAAATGGGGAGACTCAGTTTTGCACTGAGCATAAAGCCAATGTCACATGAAGCATTCTGCTCAAATGTTTTGTTGCTTGCATCTGTCACATTAGGAGCTGTAGATGTTGTTGTATTatgagctgtagttgttgttgtattatgagctgtagttgttgttgtattaggagATGTAGTTGTTGCATTATGCGCTGTAGTTGTTGAAGTAGGAACTGTAGTTGTTGTATTAGGAGGTGTAGTTGTTGTAATAGGAGCTGTCGTTGTTGAAGTAGGAGCTgtcgttgttgtagtaggagcagtagttgttgttgtattaggagctgtagttgttgttgtattaggagcTGTAGTTTTTGTATTAGGACCTGTAGTTGTTGTCGTAGGAACTGTAGTTGTTGTATTAGGAGGTGTAGTTGTTGTATTAGGAGGTGTAGTTGTTGTATTAGGAGCTgtcgttgttgtagtaggagcagtagttgttgttgtattaggagcTGTAGTTTTTGTATTAGGACCTGTAGTTGTTGTCGTATTAGGACCTGTATTTGTTGTTGTATtgggagctgcagttgttgtagtaggagcagtagttgttgtagtaggaattgtagttgttgtagtaggagcaatagttgttgtagtagaagcagtagttgttgtagtaggtgctgtagttgttgttgtattaggagcAGTAGTTGTTGTTTTCAGAGGTGTAGTTgtattaggagctgtagttgttgttttaggagctgtagttgttgttgtattaggagctgtagttgttgtatttggagctgtagttgttgtatttggagctgtagttgttttattaggagctgtagttgttttattaggagctgtagttgttgcaGTAGAAAATGTACTTGTTAtagtaggagctgtagttgttgttgaatTAGGATCTGGTGTTGTTTTAGTAGGAGCTGTATTTGTTTtattaggagctgtagttgttgcaGTAGAAAATGTACTTGTTAtagtaggagctgtagttgttgttgaatTAGGATCTGGTGTTGTTTTAGTAGGAGCTGTATTTGTTGTATTAGTAGCAGTACCTGTTGTAGCATAAGTTTTTGTTTTAGGAACTGTAGTTCTTGttgtcagcctccagtatttatgctgcagtagtttatgtgtcggggggctagggtcagtttgttatatctggagtacttctcctgtcctattcggtgtcctgtgtgaatctaagtgtgcgttctctaattctctccttctctctttctctctctcggaggacctgagccctaggaccatgccccaggactacctgacatgatgactccttgctgtccccagtccacctggctgtgctgctgctccagtttcaactgacctgagccataggaccatgccccaggaatacctgacatgatgactccttgctgtccccagtccacctgactgtg

Function

NR:

description
unnamed protein product, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU881209 False 3149 TUCP 0.39 2 14024873 14028528
TU881210 True 3254 lncRNA 0.39 2 14024873 14028528

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC100301641 LOC100301641 coding upstream 8818 14009557 ~ 14017498 (+)
cbln11 LOC106577971 coding upstream 15452 14005801 ~ 14009421 (+)
LOC110531534 LOC106577991 coding upstream 120138 13896757 ~ 13904735 (+)
LOC118966141 LOC106577961 coding upstream 330290 13682296 ~ 13694583 (+)
LOC110531525 LOC106577958 coding upstream 357191 13651265 ~ 13667682 (+)
LOC110531541 LOC106594400 coding downstream 23715 14052243 ~ 14069229 (+)
LOC118966143 NA coding downstream 72301 14100829 ~ 14108880 (+)
LOC110531546 NA coding downstream 82363 14110891 ~ 14140299 (+)
si:ch211-63p21.1 LOC106577995 coding downstream 209970 14238498 ~ 14243012 (+)
LOC110531550 LOC106577826 coding downstream 234413 14262941 ~ 14277145 (+)
G772540 NA non-coding upstream 6500 13918002 ~ 14018373 (+)
G772569 NA non-coding upstream 49454 13974589 ~ 13975419 (+)
G772544 LOC106577970 non-coding upstream 72960 13946320 ~ 13951913 (+)
G772458 LOC106609922 non-coding upstream 198561 13767934 ~ 13826312 (+)
G773464 NA non-coding downstream 103050 14131578 ~ 14200231 (+)
G773465 NA non-coding downstream 140064 14168592 ~ 14191296 (+)
G773535 LOC106577997 non-coding downstream 184921 14213449 ~ 14216852 (+)
G773543 NA non-coding downstream 209345 14237873 ~ 14238171 (+)
G772402 LOC106577959 other upstream 314430 13671810 ~ 13710443 (+)
G772241 LOC106577945 other upstream 632152 13391797 ~ 13392721 (+)
LOC110531509 tmm85 other upstream 929803 13087000 ~ 13095070 (+)
G773583 NA other downstream 278102 14306630 ~ 14328474 (+)
G773562 LOC106577828 other downstream 282940 14311468 ~ 14315250 (+)
G773601 NA other downstream 354142 14382670 ~ 14384166 (+)
G773983 LOC106577853 other downstream 1269930 15291949 ~ 15299214 (+)

Expression


Co-expression Network