G797667


Basic Information

Item Value
gene id G797667
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 35029215 ~ 35044172 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU907841
TTATTATGACATGGCAGATCTCTAgtaatgctgaagtgttgtatcatcataaacagtttttTTGGCAATGTTTAGGGATTATTATGACATGGCACATCTCTAGTAATGCTGAACTGTTGTttcatcataaacagttttctggcaatgtttagggatgactGTGACATGCCACATCTCTAATAATTCTGAactgttgtatcatcataaacagtttcctggcaatgtttagggataactatgacatgacacatctctaataatgctgAACTGTTGTACCATCACAAACAGTTTCCTGGCAATGTTTAAGGATAACTATGCATGGCACATCTCTAATTatgctgaagtgttgtatcatcataaacagttttctgCCAATGTTTAGGGATGACTGTGACATGCCACATCTCTAATAATTCtgaagtgttgtatcatcataaacagttttctggcaatgATTAGGGATTACTATGACATCATGgcacatctctaataatgctgaagtgttgtatcatcataaacagtttcctggcaatgtttagggataACTATGCATGGCACATCTCTAATTATGCTGAACTGTTGTATCATCAAaaacagttttctggcaatgATTAGGGATTACTATGACATGGCACTTCTCTAgtaatgctgaagtgttgtatcatcataaacacATAGTACAGGTGtctggcaatgtttagggatgactatgacatCATTGCACATCTaataatgctgaagtgttgtatcatcataaacagttgtctggcaatgtttagggatgactatgacatGGCAGATCTCTAgtaatgctgaagtgttgtatcatcataaacagttttctggTAATGTTTAGGGATGATTATGACATGgcacatctctaataatgctgaagtgttgtaccatcataaacagttttttggcaatgtttagggatgactatgacatggcacatctctagtaatgctgaagtgttgtatcatcataaacagttttctaGCAACGTTTAGAGATGACTATGACATCATTGCAAATCTCTaataatgctgaagtgttgtaccatcataaacagttttctggcaatgtttagggataGCTATGATATGGCAGATCTCTAGTAATGCTGAAGTGTTCTATCATCATAAAAGgttttctggcaatgtttagggatgactatAACATGGCAGATCTCTATTAATGCTGAACggttgtatcatcataaacagttttctggcaatgtttagAGATGCTTATGACATGgcacatctctaataatgctgaagtgttgtacCATCATAAACAATTTACTGGTTATGTTTACGGATGCCTATGACATACGGgcacatctctaataatgctggagtgttgtatcatcataaacagttttctggcaacgtttagggatgactatgacatCATTGCAAATCTCTaataatgctgaagtgttgtaaCATCAAACAGTTTTCTGCAAATGTTTAGCGATGACTATGACATCATGGCACATCTCTAATAATGAtgaagtgttgtatcatcataaacagttttctggcaatgtttagggatgactatgacatcatggcacatctctaataatgctgaagtgttgtatcatcataaacaaTTTTCTGGCAACGTTTAGGGATGACTTTGACATGGCAAATATATATTAATGCTGAactgttgtatcatcataaaccgttttctggcaatgtttagggatgactatgacataattgcacatctctaataatgctgaagtgttgtaaCATCAACCAGTTTTCTGAAAATGTTTAGCGATGACTATGACATCAATGCACATCTCTAATAATGATGAAGTGTTGTACCATCATAAACAGTTTTttggcaatgtttagggatgactatgacatGGCACATCTCTAGTAATGCTGAACTGTTATTCAATCGtaaacagttttctggcaatgtttagggataCTTATGACATGGCAGATCTCTATTAATGCTgaaatgttgtattatgtttagGGATAGCTATGATATGGCAGATCTCTAgtaatgctgaagtgttgtatcaCCATAAACAGTTTCCTGGCAATGATTAGGGATAACTATGACATCATGACACATCTAATAATGCTGTAGTGTTGTATCACcataaacagttttctggcaatgtttagggataGCTATGATATGGCAGATCTCTAGTAATGCTGAAGTGTTctatcatcataaacagttttctggcaatgtttagggatgactatAACATGGCAGATCTCTATTAATGCTGAACggttgtatcatcataaacagttttctggcaatgtttagAGATGCTTATGACATGgcacatctctaataatgctgaagtgttgtacCATCATAAACAATTTACTGGTTATGTTTACGGATGCCTATGACATCATTGCAAATCTCTaataatgctgaagtgttgtaaCATCAAACAGTTTTCTGCAAATGTTTAGCGATGACTATGACATCATGGCACATCTCTAATAATGATGAAGTGTTGTAccatcataaacagttttctggcaatgtttagCGATACTTATGACATGGCAGATCTCTATTAATGCTgaaatgttgtattatgtttagGGATTATTATGACATGGCAGATCTCTAgtaatgctgaagtgttgtatcaCCATAAACAGTTTCCTGGCAATGATTAGGGATAACTATGACATCATGACACATCTAATAATGCTGTAGTGTTGTATCATTataaacagttttctggcaatgtttagggataGCTATGATATGGCAAATCTCTAGTAATGCTGATGTGTTctatcatcataaacagttttctggcaatgtttagggatgactatAACATGGCAGATCTCTATTAATGCTGAACggttgtatcatcataaacagttttctggcaatgtttagAGATGCTTATGACATGgcacatctctaataatgctgaagtgttgtacC
>TU907839
GgcacatctctaataatgctgaagtgttgtaacatcaaacagttttctggcaacgtttagggatgactatgacatCATTGCAAATCTCTaataatgctgaagtgttgtaaCATCAAACAGTTTTCTGCAAATGTTTAGCGATGACTATGACATCATGGCACATCTCTAATAATGAtgaagtgttgtatcatcataaacagttttctggcaatgtttagggatgactatgacatcatggcacatctctaataatgatgaagtgttgtatcatcataaacaaTTTTCTGGCAACGTTTAGGGATGACTTTGACATGGCAAATATATATTAATGCTGAactgttgtatcatcataaaccgttttctggcaatgtttagggatgactatgacataattgcacatctctaataatgctgaagtgttgtaaCATCAAACAGTTTTCTGAAAATGTTTAGCGATGACTATGACATCAATGCACATCTCTAATAATGATGAAGTGTTGTACCATCATAAACAGTTTTttggcaatgtttagggatgactatgacatGGCACATCTCTAGTAATGCTGAACTGTTATTCAATCGtaaacagttttctggcaatgtttagggataCTTATGACATGGCAGATCTCTATTAATGCTgaaatgttgtattatgtttagGGATTATTATGACATGGCAGATCTCTAgtaatgctgaagtgttgtatcaCCATAAACAGTTTCCTGGCAATGATTAGGGATAACTATGACATCATGACACATCTAATAATGCTGTAGTGTTGTATCATTataaacagttttctggcaatgtttagggataGCTATGATATGGCAGATCTCTAGTAATGCTGAAGTGTTctatcatcataaacagttttctggcaatgtttagggatgactatAACATGGCAGATCTCTATTAATGCTGAACGtttgtatcatcataaacagttttctggcaatgtttagAGATGCTTTTGACATGgcacatctctaataatgctgaagtgttgtacCATCATAAACAATTTACTGGTTATGTTTACGGATGCCTATGACATACGGgcacatctctaataatgctgaagtgttgtatcatcataaacagttttctggcaacgtttagggatgactatgacatCATTGCAAATCTCTaataatgctgaagtgttgtaaCATCAAACAGTTTTCTGCAAATGTTTAGCGATGACTATGACATCATGGCACATCTCTAATAATGAtgaagtgttgtatcatcataaacagttttctggcaatgtttagggatgactatgacatcatggcacatctctaataatgctgaagtgttgtatcatcataaacagttttctggcaatgtttagggatgactatgacatggcacatctctagtaatgctgaagtgttgtatcatcataaacaaTTTTCTGGCAACGTTCAGGGATGACTTTGACATGGCAAATATATATTAATGCTGAactgttgtatcatcataaaccgttttctggcaatgtttagggatgactatgacataattgcacatctctaataatgctgaagtgttgtaaCATCAAACAGTTTTCTGAAAATGTTTAGCGATGACTATGACATCAATGCACATCTCTAATAATGATGAAGTGTTGTACCATCATAAACAGTTTTttggcaatgtttagggatgactatgacatGGCACATCTCTAGTAATGCTGAAATGTTGAATTATGTTTAGGGATAGCTATGATATGGCAGATCTCTAGTAATGCTGAAGTGTTctatcatcataaacagttttctggcCATGTTTAGGGATGACTATAACATGGCAGATCTCTATTAATGCTGAACggttgtatcatcataaacagttttctggcaatgtttagAGATGCTTATGACATGgcacatctctaataatgctgaagtgttgtacCATCATAAACAATTTACTGGTTATGTTTACGGATGCCTATGACATACGGgcacatctctaataatgctgaagtgttgtatcatcataaacagttttctggcaacgtttagggatgactatgacatCATTGCAAATCTCTaataatgctgaagtgttgtaaCATCAAACAGTTTTCTGCAAATGTTTAGCGATGACTATGACATCAATGCACATCTCTAATAATGATGAAGTGTTGTAccatcataaacagttttctggcaatgtttagggatgactatgacatcatggcacatctctaataatgctTAAGTGTTATAccatcataaacagttttctggcaatgtttagggataACTATGACATCATGgcacatctctaataatgctgaagtgttataccatcataaacagttttctggcaatgtttagggatgactatgacatggcacatctctaataacgctgaagtgttgtatcatcataaacagtttttttggcaatgtttagggatgactatgacatGGCAGATCTCTATTAATGCTGAAATGTTGTGTTATGTTTAGGGATTATTATGACATGGCACATCTCTAGTAATGCTGAACTGTTGTATCATAAATCATAAACAGTTTTTttggcaatgtttagggatgactatgacatggcacatctctaataatgctgaactgttgtatcatcataaacagtttcctggcaatgtttagggataattatgacatggcacatctctagtaatgctgaagtgttctatcatcAAAAACAGATTcctggcaatgtttagggataactatgacatggcacatctctaataatgctgAACTGTTTTTATCATCAAAAACAATTTTCTGGCAATGATTAGGGATTACTATGACATCATGgcacatctctaataatgctgaagtgttgtatcatcataaacagtttcctggcaatgtttagggataACTATGCATGGCACATCTCTAATTATGCTGAACTGTTGTATCATCAAaaacagttttctggcaatgATTAGGGATTACTATGACAAGGCACTTCTCTAgtaatgctgaagtgttgtatcatcataaaaACATAGTACAGGTGtctggcaatgtttagggatgactatgaAATCATTGCACATCTAATAATGCTgaattgttgtatcatcataaacagttttctggcaatgtttagggatgactatgacatGGCACATCTCTAATAACGCTGAAGTGTTGTACCATCATAAACAGTTTCCTGGTTATGTTTAGGGATGATTATGACATGTCACATCTCTAAAAATGCTGAAGTGTTGTATAATCATAAACAGTTTTTttggcaatgtttagggatgactatgacatGGCAGATCTCTATTAATGCTGAAATGTTGTGTTATGTTTAGGGATTATTATGACATGGCAGATCTCTAgtaatgctgaagtgttgtatcatcataaacagtttttTTGGCAATGTTTAGGGATTATTATGACATGGCACATCTCTAGTAATGCTGAACTGTTGTttcatcataaacagttttctggcaatgtttagggatgactGTGACATGCCACATCTCTAATAATTCTGAactgttgtatcatcataaacagtttcctggcaatgtttagggataactatgacatgacacatctctaataatgctgAACTGTTGTACCATCACAAACAGTTTCCTGGCAATGTTTAAGGATAACTATGCATGGCACATCTCTAATTatgctgaagtgttgtatcatcatgaACAGTTTTCTGCCAATGTTTAGGGATGACTGTGACATGCCACATCTCTAATAATTCtgaagtgttgtatcatcataaacagtttcctggcaatgtttagggataactatgacatggcacatctctaat

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU907841 False 2964 lncRNA 0.36 4 35029215 35037351
TU907839 True 3837 lncRNA 0.35 4 35032519 35044172

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110531962 LOC106571888 coding downstream 226381 34729334 ~ 34802834 (-)
LOC110533011 LOC106571887 coding downstream 307899 34715740 ~ 34721316 (-)
eif2d eif2d coding downstream 392921 34617500 ~ 34636294 (-)
LOC118966030 NA coding downstream 422082 34596540 ~ 34607133 (-)
LOC110531958 LOC106571859 coding downstream 497787 34429068 ~ 34531428 (-)
LOC110531965 pphln coding upstream 319880 35364052 ~ 35372459 (-)
LOC110531966 LOC106571884 coding upstream 337489 35381661 ~ 35400349 (-)
LOC118966032 LOC106571870 coding upstream 450892 35492026 ~ 35521884 (-)
LOC110531156 wdr46 coding upstream 512695 35556867 ~ 35562538 (-)
LOC118936388 LOC106571889 coding upstream 520089 35564261 ~ 35566271 (-)
G797660 NA non-coding downstream 19166 35008728 ~ 35010049 (-)
G797608 NA non-coding downstream 89759 34902433 ~ 34939456 (-)
G797609 NA non-coding downstream 91402 34914791 ~ 34937813 (-)
G797612 NA non-coding downstream 111018 34913900 ~ 34918197 (-)
G797611 NA non-coding downstream 121641 34905487 ~ 34907574 (-)
G797706 NA non-coding upstream 56330 35100502 ~ 35101902 (-)
G797707 NA non-coding upstream 61657 35105829 ~ 35108729 (-)
G797742 NA non-coding upstream 91369 35135541 ~ 35135846 (-)
G797751 NA non-coding upstream 99383 35143555 ~ 35143839 (-)
G797755 NA non-coding upstream 103251 35147423 ~ 35147632 (-)
G797605 NA other downstream 153336 34869955 ~ 34875879 (-)
G796733 rl32 other downstream 971666 34051059 ~ 34057549 (-)
G794311 LOC106577443 other downstream 3000947 32026071 ~ 32028445 (-)
G793842 NA other downstream 3367017 31661239 ~ 31662198 (-)
G793489 NA other downstream 3610242 31418455 ~ 31418973 (-)
G798195 NA other upstream 310047 35354219 ~ 35354675 (-)
LOC110531979 brpf1 other upstream 933250 35948544 ~ 35979307 (-)
G798993 NA other upstream 1106166 36150338 ~ 36150637 (-)

Expression


Co-expression Network