G798672



Basic Information


Item Value
gene id G798672
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 36152526 ~ 36235544 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU908950
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>TU908957
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>TU908952
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>TU908942
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>TU908944
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>TU908948
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>TU908949
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>TU908951
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>TU908955
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>TU908959
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>TU908961
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Function


NR:

description
LOW QUALITY PROTEIN: transcription and mRNA export factor ENY2-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU908950 False 3945 lncRNA 0.34 6 36152526 36189791
TU908957 False 2531 lncRNA 0.34 7 36152526 36235544
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TU908944 False 647 lncRNA 0.35 3 36234102 36235544
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TU908949 False 781 lncRNA 0.35 3 36234102 36235544
TU908951 False 908 lncRNA 0.35 2 36234102 36235544
TU908954 False 1047 lncRNA 0.35 3 36234102 36235544
TU908955 False 1041 lncRNA 0.34 4 36234102 36235544
TU908959 False 1039 lncRNA 0.34 4 36234102 36235544
TU908960 False 642 lncRNA 0.35 4 36234102 36235544
TU908961 True 777 lncRNA 0.35 4 36234102 36235544

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC110531975 LOC106571876 coding upstream 259116 35885933 ~ 35893410 (+)
LOC110531973 LOC106571875 coding upstream 296422 35752012 ~ 35856104 (+)
LOC110531972 LOC106566626 coding upstream 408106 35666422 ~ 35744420 (+)
LOC110531971 LOC106571873 coding upstream 600549 35544777 ~ 35551977 (+)
LOC110531969 LOC106571870 coding upstream 656388 35487368 ~ 35496138 (+)
LOC110531941 LOC106580207 coding downstream 13800 36249344 ~ 36262924 (+)
si:dkey-7l6.3 LOC106580210 coding downstream 151374 36386918 ~ 36396094 (+)
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G798717 NA non-coding upstream 3309 36148960 ~ 36149217 (+)
G798701 NA non-coding upstream 33707 36118168 ~ 36118819 (+)
G798584 NA non-coding upstream 215515 35936669 ~ 35937011 (+)
G799011 NA non-coding downstream 1405 36236949 ~ 36237149 (+)
G799026 snap29 non-coding downstream 67528 36303072 ~ 36303901 (+)
G799089 NA non-coding downstream 146492 36382036 ~ 36382235 (+)
G799091 NA non-coding downstream 147592 36383136 ~ 36383353 (+)
G799096 NA non-coding downstream 162657 36398201 ~ 36399373 (+)
G797932 pphln other upstream 780378 35364988 ~ 35372148 (+)
G797056 NA other upstream 1595904 34555931 ~ 34556622 (+)
G796495 LOC106613263 other upstream 2030786 34121422 ~ 34121740 (+)
G794886 LOC106577459 other upstream 3565138 32583606 ~ 32587388 (+)
G794893 NA other upstream 3649777 32502396 ~ 32502749 (+)
G799053 NA other downstream 77585 36313129 ~ 36316805 (+)
G799578 LOC106571900 other downstream 798874 37034418 ~ 37035918 (+)
G799858 LOC106571908 other downstream 1331701 37567245 ~ 37570411 (+)
G800834 NA other downstream 1834672 38070216 ~ 38071433 (+)
G801778 NA other downstream 2552517 38788061 ~ 38788354 (+)

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