XLOC_027143


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_027143
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 10764277 ~ 10791239 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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Function

GO:

id name namespace
GO:0008610 lipid biosynthetic process biological_process

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TCONS_00057633 False 725 lncRNA 0.44 3 10768753 10773173
TCONS_00053486 False 390 lncRNA 0.47 3 10769126 10771011
TCONS_00057634 False 1328 lncRNA 0.39 2 10775281 10791239
TCONS_00057635 True 1329 lncRNA 0.38 2 10789148 10791239

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_027142 stab2 coding upstream 730 10721795 ~ 10763547 (+)
XLOC_027141 NA coding upstream 48685 10714745 ~ 10715592 (+)
XLOC_027140 wnt16 coding upstream 50693 10706755 ~ 10713584 (+)
XLOC_027139 cped1 coding upstream 59692 10616626 ~ 10704585 (+)
XLOC_027138 ing3 coding upstream 148922 10604110 ~ 10615355 (+)
XLOC_027144 NA coding downstream 24891 10816130 ~ 10826992 (+)
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XLOC_027147 cracr2ab coding downstream 343809 11135048 ~ 11148941 (+)
XLOC_027148 tspan11 coding downstream 381725 11172964 ~ 11198055 (+)
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XLOC_027131 NA non-coding upstream 875180 9867910 ~ 9889097 (+)
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Expression


Co-expression Network