G810560


Basic Information

Item Value
gene id G810560
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 46250051 ~ 46252928 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU922204
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>TU922202
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>TU922203
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>TU922201
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU922204 False 2753 lncRNA 0.35 1 46250051 46252803
TU922202 False 2643 lncRNA 0.34 1 46250286 46252928
TU922203 False 2518 lncRNA 0.34 1 46250286 46252803
TU922201 True 2237 lncRNA 0.35 1 46250567 46252803

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110532213 emp3 coding downstream 43347 46202726 ~ 46206704 (-)
zmynd12 zmynd12 coding downstream 49801 46187156 ~ 46200250 (-)
LOC110532208 LOC106572161 coding downstream 208786 45816274 ~ 46041265 (-)
tmem51a LOC106572162 coding downstream 444187 45793209 ~ 45805864 (-)
ela2 LOC106572326 coding downstream 486033 45760116 ~ 45764018 (-)
LOC110532215 LOC106572154 coding upstream 5107 46256999 ~ 46263834 (-)
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LOC110532223 LOC100380856 coding upstream 140173 46393101 ~ 46525481 (-)
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LOC110532229 sycp2 coding upstream 466634 46719562 ~ 46781807 (-)
G809974 NA non-coding downstream 99150 46150656 ~ 46150901 (-)
G809971 NA non-coding downstream 101437 46148166 ~ 46148614 (-)
G809967 NA non-coding downstream 107555 46142297 ~ 46142496 (-)
G809966 NA non-coding downstream 109947 46139856 ~ 46140104 (-)
G809940 NA non-coding downstream 143465 46106362 ~ 46106586 (-)
G810563 NA non-coding upstream 1664 46253514 ~ 46256922 (-)
G810595 NA non-coding upstream 49795 46302723 ~ 46302961 (-)
G810596 NA non-coding upstream 51209 46304137 ~ 46304413 (-)
G810623 LOC106572152 non-coding upstream 91746 46344674 ~ 46346295 (-)
pdyn pdyn other downstream 931285 45316564 ~ 45318766 (-)
G809071 LOC106572179 other downstream 952201 45295856 ~ 45298740 (-)
G808375 NA other downstream 1613205 44634559 ~ 44636846 (-)
G807941 NA other downstream 1887885 44361416 ~ 44362166 (-)
G811300 NA other upstream 925876 47178804 ~ 47181797 (-)
LOC110531190 clcn6 other upstream 1410137 47642136 ~ 47676649 (-)
LOC110532252 fkb1a other upstream 2025246 48278174 ~ 48286453 (-)
G812840 NA other upstream 2255717 48508645 ~ 48509094 (-)

Expression


Co-expression Network