XLOC_027160



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_027160
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 11761954 ~ 11772599 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00057637
TGTGTCTGCCAGAGGTGtcactgtcctgcagagtttaggtACTATTGCTTTAACCCACGTGTCTGAATGTTTCAGACACTCactgattagctggttcaggtgcaTTTAATTAGGTTAAGAACTGAACTATATACAGGACTGTGGCCTTGCCGGAGCATCATTAGACGCCCAGTATATGGAAAAGACAGGTGTGGCTTCCTGGTTTCCCTTGGGATGAAATTATGGAGAGGAAGGGGAGGGTGAAGGGATGACAGGAACTGTCGGAATGACTGAGGGCAGCTCATCCCCCAGAGACGTCTTTCTCCCACAATGCCCTGACCCTGAGATCTATGTGTGGAATTCTCTGCTCATTTATCAGTGTGGGCCTGCTCCTCTCCCTGTGCACTCTCATTTGTTCACAGTCCCGATCCTGGTACTGTTGCACCCCAAACTACATCTGTGTAACTCTCAGACTCAACCAAGCATACCTACAGCTGTGGggaaaatacaaaaataagagaccacttgaaaaaaatgtatgcatttttctCTACAAATTTAACATAATACAATAACGTACCTATTTAAGTTAATAAAAAGCtgtactttttaaaagttttaagtgTTAAGTACTTTTAGCCTGATATGTTTTTGAGTacttttttccagtttttttagCTCCTTGTATGATTTATGTTCATTTCTAATTATCAATATTAATGAAATTTGTAGTTTTAGTTTAatcagacatttatttatttaattatttcattcatgcattcatgatTAGTATTATTTTAGAATTAAGTCATTTACTAaccacttttaatttatttttaaaattttttaaagctttttctcCAAACATTTAAACTGACCCCCAGCATATTGTGGCACTTGATAATTAAGTATGCATCAAAATCACTGTCAACAAATATAATCAATGAATTAGTTGTTTAAATTAGTTGATATTAAGCATTTTTACTCATAACTAAAATAACAGGCACAGGCATGAGATCAGTTAATCAGCTCCCTCTTGTGGACAATAAGTGAACGTGAGAACAGCAGTCGTGTCTGATCCTGATTTAAACCTGATTGAGAACACCTGAAGCAGGTGAAGCCCTCCAGCACAGGTTTGATGAACTTGATTGATGTGTTTTAATTCTGGTAAAACTACTGATTTGCATAAACAGATTGTGTTGTTTACATGTTTGCATTTGAAATGTGAAAATTAATAAAGATTTTAATGACCCTCATAATTGTTTTGTACGTTTCTTGAAGATCTTAGCTGTGTGAACTTGATTAAACACATGATAGTTTTGTGATGTTAATGAAATGACATATTTTATTAGACGCTTGTTAGCAGTGTAAAATCTGGACTGGAGTTCAGAATAAACTGATCAAGCTGATATGAGCATTGATAAACAAATCTGAGGATTTATTCTTAACTGTTTATAAGATTTGAAGACATAAAAAACACAATCACATTGGTTCTGTACTTTCAACAAAGGGACTAAAACTTTTAATTAGTTCACATGTGAAACACATCAAGGCTTACAAACACATGATTGGATAGTGTTTCATACAAAAACAATATTTCTATAAACAATGTTTTagctaaattaaatataaatcacCCTGAAAAACATAACtctgttcagaaaaaaaacagacaaccATTACTGACAAACATCTTGGTTTCAATCCTATGACTAAGCTCATAGATTTGTATGCGTAATCAAGTTAGCCAAGTGGTTAGTGAGTTGGACTGGTAACCCagaggttgctggtttgattcccACTCCTGACAGGAGGGCTGGGCTGTCCATGAGCAAGCCACTTAACCCTCAAAGAGAGCAGTCATAAGTATGCATAATCAAGTTAGCCTAATGGTTAGTGAGTTGGACTGGTAACCCagaggttgctggtttgattctCTGTCCTGACAGGTGTTGAAGGGCGGTAAACAGCTGACCTGCTAATAAGCAAGGCACTTAACAAGAGAGCTTGAGTGCCCCAAAGAGTGCAATAATGactatggattaaaaaaaaaaccttaattgAAAACACCTGCTGCTGCTGATTTCTGGGTTTTCTTGACATAATTCTTTAGCCTGAATTAAAACGAACAGGTTATCAGAAGCTCAGTGGCGCAGAGGCAAATCATTTGCCATTGAATCAGTAAGACAGGGTTCAAATCCCACATGGGCAGATTTTCGAAACCTGTTTTATCTATAGGAATATATCAGACTCTTAAACGATATATAGCACATCACAAGCTCTATGGCATAGTGGATAATCACTTACCTTCACATCAGTAACCTTTGGTTTTGAATCCCATTTCCACAGCTATTCTTCATTCAAAAGCAGGACCAAACACAACGTCATGCTCAAGGGTGCAGTGGATGAGCGTTTGCCTATGAATCAGAAAGTTTGGATAAGCAGGAAACATTGTAAGCTCTTTGGCTGAGTGGATAATCATTTGCCTGTGAATCAGAATGTTTTAGGATCCAATCCCACAAACGCAGGTTCTCTTCACTTTTTCCTTGCaaatagaaatatatttacaAGACTGTGTAACAACATATAGGACATCAAAAACTCTTTGGTGCAGTGGTTAATCATTTGCCTGTGGATCAGAATGTTTTAGGTTCCAATCCCACAAACACAGGTTCCCTTCACTTTTTCTTTGCAGATATAAATGTATGTACAAGACCGTATATCAACACACATGACATCAAATGCCCTCTGGCGCAATGGTTAATCATTTGCCTGTGAATCAGAATGTTTTAGGTTCCAATCCCACCAACGCAGGTTCCCTACACTTTTTCCTTGCagatataaatatatgtacaagACCGTATATCAACACATATGACATCAAATGCCCTCTGGCGCAGAGGTTAATCATTTGCCTGTGAATCAGAATGTTTTAGGTTCCAATCCCACCAACGCAGGTTCCCTTCACTTTTTCCTTGCagatataaatatatgtacaagAAAGTATAACAACATCTAGGACATCAAAAGCCCTTTGGCACAGTGGTTAATCATTTGCCTGTGGATCAGAATGTTTTAGGTTCCAATCCCACAAATGCAGGTTCTCTTCACCTTTccttacaaataaaaacacatagaAGACCCCATAAAACAAGCAGGGAACCTTGTACGCTCTTTGGTGCAGTGGATAATCGTTTGCctgtaaaccaaaatgttttgggtttgaatcccacaTTGACTGAGTATCATTACATACAACAAAGTGCTATAAACGTCAATGCTAACTGTGAGTGCCATAGTGGCGCTGCTGGGTGAACACAAGCTCTCAATGGCCAAGGCTGTCTGAAAGACTTGGGTTCAAGGCCCAGCTCTGCTCACTTTCGCACTCTGGCCAACCTACAGAGGGCCAAATATAAGTTCCAGCACATCATTAGGTATGTGACTGTGGCTCAGCGGTAGAGCATTGCCTCAAGGGTTAAGAGGTCGCTGGTTCCATCCCAGCCAGATCACTGCGATATGTGTGAGTGTCGGCGTGAATGAAGGGGGAGGATGAAACGTTCCTCCCCTGACCTACGGGGCCATGTACAGCAGGGGTTATGCtactttttactaaaaaaaaaattagctctaTAAAAATCCGGACCCCCGTCCCTTCTCTCCCCGTTTCGGTTACCATCACTTCCTTTCTAGAGGGGTTGACCCTCCAGAAAGGAAGTGATGGTAACCGATAGCACATAACACAAAAACGAGCGAGAGGTCTTACCTGTCCGCAGAAGACGTCCATCACGCCAGAAAACGTAGTCCAAACGTCCTGGAGCTCTGCTTCTGTTGACTGTACGGTCCAAACACATCCCTCAATCTCTAAAGGAAACACAGAAATAGAGACACGGTCAAACAGCAGATCTAAACATCACACTCTGACAGATATTACAGTTAATAATTCAGAATTATACACATTTACAGCCTAAATATTGCCTGTGAAAGCTCTACAAACACAGCAGAACACCAGAGCTTAACAAACTGACTTGTTGACACACATTATGTTTTGTTCTGCTTTATAATAAGAGGCTGTTTAACTCAGAGCCTTCACATATAAAACAACAACTAAGTTACCAATTTGTTTGCTCTTAAATGTCTGACAGTGACAGAGCAACATGTAAACAAAGCTGTTTAAACAAACAGGAGAGCTCTGCTTAAACATATCACTAAAGACACTTCAACATGTGCTAAACATGAACTTAACTGCGACTGAAGTACAAAGAATAAAGACTTAATGAGGAAATGCAGGAGAAATACTGTACAGTTACTTACAGGTGAGTCGCTTTTCACTGCATTTCTGTCCTTTATCTCAGCGTGTTGTGGTTCTTTTAGTTGTCGGACTACATCAAATGTTGTTTATTAACACTAAAACACTGTCACTGAGCTGTCATCTTCAGTTTATGTGTTTAAAACTGTACActcgtgctgctgctgctgcaccaaaACAAACGTCACACTGTCAACATCCTGAAGCTGTGATTCAGAGTGAACGAGAAACCACATGCGCCACCTGGTGGAGCGGATGGAGAACTGCACTACAGTGTCTAACAGGACGAGTTACAGTGTTAAAGTCTTGTTAATTTAAGCCTGATAGGTCGTTTAAATTCCAGATATTTCAACTAATTTAAAACGTTGAACAACACACCCAgaacaaaataatgaattcactaggtTAAATAGCTCAATGTCATGTGCCAAATATGTCAAGCTGTGGTCgtcagcgccctcttgtggatgaTGAGTTACTGTTGTTCAGATCATGAACTCGAGGTGTTCAGTCGCAGATATGGAAAAGACAGGTGTGGCTTCCTGGTTTCCCTTGTGATGAAATAATAGAGAGGACGGGGAGGGTGAAGGGATGACAGGAACTGTCTAAATGACTAAGATGCATTGCATACAAAAAGACCTGATGCAGCCCTAATAGTGACTCTTTTATGCAAGGCAGCTCATCCCCCAGAGACGACTTTCTCCCACAATGCCCTGACCCTGAGATCTATGTGTGGAATTCTCTGCTCATTTATCAGTGTGGGCCTGCTCCTCTCCCTGCGCACTCTCATTTTTTCACAGTCCCGATCCTGGTACTGTTGCACCCCAAACTACATCTGTGTAACTCTCAGACTTGCACACAACCGAGCATACCTACAGCTGTGGGAAAAGTTATGTGTTTTTCTctccaaattcaaaatataaacacTTAAGATAACAAAACATAactaaattaacataaatattttagttaaaataagCTGTACTGTTTTACTTTTAAGTATTaacgttttttttattgttttgtcacaaatttcagaaccctgatgtcaattttcaaaactctacatACAAAACTCTAAACAGTCACTACTTTTAACGCAGACACTTCAGAGTTCAGTAAAGTATAGGATACAGGTTTTATTATGGTTTATACATAAGTGTTGAACAGTACAGACAGTGGATACACTGAACTACTTTTACTCATTCCATCATAATGTaggtttactgtattttttttctcactgCACGTCCCCATATAGAAAGCTGATATATGGCATGATATATGACAACAAATGCAACTTACGATTGGATTCCGTACTGTATATTAGGCTTGCCACGTtagacggtgttgacggtgataccggttttaagacgcaacaacggtgacatcactttttcacagtgacaccgtccccacatttgttttttgttttttaagtatttttttttattaaatgtttatttgaattaaatgggaaacataattctaaataatttacttaagacGAGAGCATGCACTATAATTATTATCTGAATATAGCTACAAAgcatcatatttcatttatcacatgAAGAGAACGAGAG
>TCONS_00057638
TGTGGCCTTGCCGGAGCATCATTAGACGCCCAGTATATGGAAAAGACAGGTGTGGCTTCCTGGTTTCCCTTGGGATGAAATTATGGAGAGGAAGGGGAGGGTGAAGGGATGACAGGAACTGTCGGAATGACTGAGATGCATTGCATACAAAAAGACCTGATGCAGCCCTAATAGTGACTCTTTTATCTCATCCCCCAGAGACGACTTTCTCCCACAATGCCCTGACCCTGAGATCTATGTGTGGAATTCTCTGCTCATTTATCAGTGTGGGCCTGCTCCTCTCCCTGCGCACTCTCATTTTTTCACAGTCCCGATCCTGGTACTGTTGCACCCCAAACTACATCTGTGTAACTCTCAGACTTGCACACAACCGAGCATACCTACAGCTGTGGGAAAAGTTATGTGTTTTTCTctccaaattcaaaatataaacacTTAAGATAACAAAACATAactaaattaacataaatattttagttaaaataagCTGTACTGTTTTACTTTTAAGTATTaacgttttttttattgttttgtcacaaatttcagaaccctgatgtcaattttcaaaactctacatACAAAACTCTAAACAGTCACTACTTTTAACGCAGACACTTCAGAGTTCAGTAAAGTATAGGATACAGGTTTTATTATGGTTTATACATAAGTGTTGAACAGTACAGACAGTGGATACACTGAACTACTTTTACTCATTCCATCATAATGTaggtttactgtattttttttctcactgCACGTCCCCATATAGAAAGCTGATATATGGCATGATATATGACAACAAATGCAACTTACGATTGGATTCCGTACTGTATATTAGGCTTGCCACGTtagacggtgttgacggtgataccggttttaagacgcaacaacggtgacatcactttttcacagtgacaccgtccccacatttgttttttgttttttaagtatttttttttattaaatgtttatttgaattaaatgggaaacataattctaaataatttacttaagacGAGAGCATGCACTATAATTATTATCTGAATATAGCTACAAAgcatcatatttcatttatcacatgAAGAGAACGAGAG
>TCONS_00053522
GCCTTGCCGGAGCATCATTAGACGCCCAGTATATGGAAAAGACAGGTGTGGCTTCCTGGTTTCCCTTGGGATGAAATTATGGAGAGGAAGGGGAGGGTGAAGGGATGACAGGAACTGTCGGAATGACTGAGATGCATTGCATACAAAAAGACCTGATGCAGCCCTAATAGTGACTCTTTTATGGCAGCTCATCCCCCAGAGACGACTTTCTCCCACAATGCCCTGACCCTGAGATCTATGTGTGGAATTCTCTGCTCATTTATCAGTGTGGGCCTGCTCCTCTCCCTGCGCACTCTCATTTTTTCACAGTCCCGATCCTGGTACTGTTGCACCCCAAACTACATCTGTGTAACTCTCAGACTTGCACACAACCGAGCATACCTACAGCTGTGGGAAAAGTTATGTGTTTTTCTctccaaattcaaaatataaacacTTAAGATAACAAAACATAactaaattaacataaatattttagttaaaataagCTGTACTGTTTTACTTTTAAGTATTaacgttttttttattgttttgtcacaaatttcagaaccctgatgtcaattttcaaaactctacatACAAAACTCTAAACAGTCACTACTTTTAACGCAGACACTTCAGAGTTCAGTAAAGTATAGGATACAGGTTTTATTATGGTTTATACATAAGTGTTGAACAGTACAGACAGTGGATACACTGAACTACTTTTACTCATTCCATCATAATGTaggtttactgtattttttttctcactgCACGTCCCCATATAGAAAGCTGATATATGGCATGATATATGACAACAAATGCAACTTACGATTGGATTCCGTACTGTATATTAGGCTTGCCACGTtagacggtgttgacggtgataccggttttaagacgcaacaacggtgacatcactttttcacagtgacaccgtccccacatttgttttttgttttttaagtatttttttttattaaatgtttatttgaattaaatgggaaacataattctaaataatttacttaagacGAGAGCATGCACTATAATTATTATCTGAATATAGCTACAAAgcatcatatttcatttatcacatgAAGAGAACGAGAG
>TCONS_00053521
GCCTTGCCGGAGCATCATTAGACGCCCAGTATATGGAAAAGACAGGTGTGGCTTCCTGGTTTCCCTTGGGATGAAATTATGGAGAGGAAGGGGAGGGTGAAGGGATGACAGGAACTGTCGGAATGACTGAGATGCATTGCATACAAAAAGACCTGATGCAGCCCTAATAGTGACTCTTTTATGCAAGGCAGCTCATCCCCCAGAGACGACTTTCTCCCACAATGCCCTGACCCTGAGATCTATGTGTGGAATTCTCTGCTCATTTATCAGTGTGGGCCTGCTCCTCTCCCTGCGCACTCTCATTTTTTCACAGTCCCGATCCTGGTACTGTTGCACCCCAAACTACATCTGTGTAACTCTCAGACTTGCACACAACCGAGCATACCTACAGCTGTGGGAAAAGTTATGTGTTTTTCTctccaaattcaaaatataaacacTTAAGATAACAAAACATAactaaattaacataaatattttagttaaaataagCTGTACTGTTTTACTTTTAAGTATTaacgttttttttattgttttgtcacaaatttcagaaccctgatgtcaattttcaaaactctacatACAAAACTCTAAACAGTCACTACTTTTAACGCAGACACTTCAGAGTTCAGTAAAGTATAGGATACAGGTTTTATTATGGTTTATACATAAGTGTTGAACAGTACAGACAGTGGATACACTGAACTACTTTTACTCATTCCATCATAATGTaggtttactgtattttttttctcactgCACGTCCCCATATAGAAAGCTGATATATGGCATGATATATGACAACAAATGCAACTTACGATTGGATTCCGTACTGTATATTAGGCTTGCCACGTtagacggtgttgacggtgataccggttttaagacgcaacaacggtgacatcactttttcacagtgacaccgtccccacatttgttttttgttttttaagtatttttttttattaaatgtttatttgaattaaatgggaaacataattctaaataatttacttaagacGAGAGCATGCACTATAATTATTATCTGAATATAGCTACAAAgcatcatatttcatttatcacatgAAGAGAACGAGAG
>TCONS_00057639
TATAAACAATGTTTTagctaaattaaatataaatcacCCTGAAAAACATAACtctgttcagaaaaaaaacagacaaccATTACTGACAAACATCTTGGTTTCAATCCTATGACTAAGCTCATAGATTTGTATGCGTAATCAAGTTAGCCAAGTGGTTAGTGAGTTGGACTGGTAACCCagaggttgctggtttgattcccACTCCTGACAGGAGGGCTGGGCTGTCCATGAGCAAGCCACTTAACCCTCAAAGAGAGCAGTCATAAGTATGCATAATCAAGTTAGCCTAATGGTTAGTGAGTTGGACTGGTAACCCagaggttgctggtttgattctCTGTCCTGACAGGTGTTGAAGGGCGGTAAACAGCTGACCTGCTAATAAGCAAGGCACTTAACAAGAGAGCTTGAGTGCCCCAAAGAGTGCAATAATGactatggattaaaaaaaaaaccttaattgAAAACACCTGCTGCTGCTGATTTCTGGGTTTTCTTGACATAATTCTTTAGCCTGAATTAAAACGAACAGGTTATCAGAAGCTCAGTGGCGCAGAGGCAAATCATTTGCCATTGAATCAGTAAGACAGGGTTCAAATCCCACATGGGCAGATTTTCGAAACCTGTTTTATCTATAGGAATATATCAGACTCTTAAACGATATATAGCACATCACAAGCTCTATGGCATAGTGGATAATCACTTACCTTCACATCAGTAACCTTTGGTTTTGAATCCCATTTCCACAGCTATTCTTCATTCAAAAGCAGGACCAAACACAACGTCATGCTCAAGGGTGCAGTGGATGAGCGTTTGCCTATGAATCAGAAAGTTTGGATAAGCAGGAAACATTGTAAGCTCTTTGGCTGAGTGGATAATCATTTGCCTGTGAATCAGAATGTTTTAGGATCCAATCCCACAAACGCAGGTTCTCTTCACTTTTTCCTTGCaaatagaaatatatttacaAGACTGTGTAACAACATATAGGACATCAAAAACTCTTTGGTGCAGTGGTTAATCATTTGCCTGTGAATCAGAATGTTTTAGGTTCCAATCCCACCAACGC
>TCONS_00057640
GTTGAACAACACACCCAgaacaaaataatgaattcactaggtTAAATAGCTCAATGTCATGTGCCAAATATGTCAAGCTGTGGTCgtcagcgccctcttgtggatgaTGAGTTACTGTTGTTCAGATCATGAACTCGAGGTGTTCAGTCGCAGGTAAGAGggctgagaaatgaataaaacatttaaaagccaATCAATCATTTATTGCAGCGTCTCAACATGTAAAGCAACGTGTGTTTTTAGCAGTTTgggtaaatttattttaaacgaTACAGTAAAACAGATCAAACGTGTTCAACTCAAATGTGCTCGGTGTGTAAACAGTCAAAACTCCAACGATATTTGTTCATGTGCAAGTTTTATGTcgatgtatgtttttgtttacttatttgcAGTGATATTCATAATGCTTGGGCACAGTTAAAACCACAGTTTCACACTGTTGTGTCAGTGTTTGCAGATTTAAGtgcatttagagtacatttagtcTACAGATTCAGACACAGAAATGCATGAGATCAGATCAGTGTTTCAGCTCCGCCTGGTGGACAGTAAGTGTATCTGTATTAATGTCCAACACTAGTTAGTGGAAGCATTTTTCTGTCATTAGTTTGTTGAAGCTGGATGCACTTTCATAACCTGATTAATATAATTTCATGGTGAATATACCTTAATTCTGCTGGGACGGTTATAAAGAAATTATAAAGGGTTATTTAGCAAACAGGTAACGAACTAATCTTAACAGTCTGATTAATTGTATAGTTTGTCCTAGATTGTGGAAATTTGATGCTTTcactaattaaaacaataattcacttttttcaaatatttttttcacacagttgtaaaaaaagtaattaactTTTTCCAAATCTcttttttacagatttataatTCACAATGTACATTTTACCCCTCAGAATTGCAGGTTTGCATCACGCAAATTTGAGATTGCGAGCTCACAAATCTATCAAAAAGACAATAACACTCTTAATTCTGAagggaaaaataaaatgtacatgcTTTTTTGTTCACTGAGTACAGCATTAATGCAATCATGTATTtggaattcaattcaataatgCAACATTTGTTAAATAACCTCATGTTTCCCTCTTTTTTATTGCATGATTACAACTTCTGTTGGAATGGATCAGTAACTGTTTTAGCAATCCAGTCCTGGGGACCAACAGAGCTCCATATTTTACATGTGAAGAACAGAGCTTTCCAAAACTTTCAATCAATCgtcttgaattgaattgaattgagctgAATACTCTACAACCCTCAAGCTCTGACACCCACTGgttaaaatgttgtaaatgaaaatAAGAACAGTCAAAACTAGACTAATAGGATCAACTTTTCTTGTTGCGAATAATTGATGAAGCTTTTATcactgtatatatttgaaaactaTGCAAATATGTCCACTATTATTGACACATTTAAATGACACTgcaacaaatgtttttttctcttaGGGGTTTTGTTTAGACCAGTCTAAATATCtataaaatcttaaatcaagactgGTTTCTAAGCATGTAATAAACAGTGTTTAGTTTTGGGAAATAAGATGTCTAAATTAAGTCAGTGCCAGTAgagcaagtaaaataatcttgtttttgatttaaaataagattattttactcaaCCCACTGGCAAATTATTTAATATACCTTATTTTATGTTTGCAAAGAAAGTGCTTCTTGAAAGAATTGTTATTTacttggactagaaataagacaaagcTTTTTTGTGCAGTGTAAAAGATTAGTGCTTTTATTGAGTAGAAATTTATAGTTTAACTTCATGAGAACTTCATGAGCACCGTATCAGCATATTCAGATTCTGTCTGAAGCATCACATGACACTAACTGGGTTTCCATCACTCTGCATTATAGCACACTTTGAAGCATCTCATGAGCAATGAGTGATGTAAATGCCACATTTAGAATAAAAATTACTTCTTTAAATAACAAAGTctgtttttactttaattttgcgCTGGTTTTGGACTAAATTGTGTTAATGTGAATAATGGGAGATGGAAATGCATTTGGCATGTGACCAATCAGATGTCTCCACTAagcttgctttgtttactttttttaggTTACCAACACTACAGTCAGCATATCTAACAACCTGATGGAAATGTACCCAATAcgtaattgtgatttttcttttcttttttgtgctaacacttaaataaataataataatacaaacaaaataaaaaagtcgctttaggatggaaacccagctactgAAGAATGAAGAAATGATGGTTAAAATTCAGCTTTGTAATCATACCAGtacaaaatgattcattggatttactcaatttttttaaggtaagtgtttgcaaacaatttatatgggctgaatttaaacacatttaatttagtaatgttcaattaaatctgtttaaattcagcccaaataaattctttgcaaacacttaccttaaaaaaattgcAAGTCCAATTAATCATTTTGGTCTGTGTAGGAATATTCTGCTTAAAATAAAATGGGTTTGCCagagtcctgcagagtttagttacTATTGCTTTAACAAACACGTCTGAATGAAAAAATGTTGAAATTGATGAAGGAATTTTGATGTTTTGGTTTACaaacattatttgaaacattaaagtagatGCTCTGCTTTCACTGGATATATgttatatgtataataataaaccaCTTTTGTAGATGTAATTTGATATCGACAGTAAAATGGGACGTCTCGTTTTtggcataaataaacaattatctTTTTCTTggacattttgtgtgtgtggtggATCCATAAGGAAATGAATGCTGAAAATGATAATTATCATGACAGTTATTAATTCCTGCTATGGTTTATCTTTCTCAGATATGGAAAAGACAGGTGTGGCTTCCTGGTTTCCCTTGTGATGAAATAATAGAGAGGACGGGGAGGGTGAAGGGATGACAGGAACTGTCTAAATGACTAAGGTaagtgtctatttatttatttattcattcattcatttatttatttatttaagcatcTAGTGCTATTAGCTTTACCGAAgtctttccatttttttttatgtgactcATGAACAATTGTTACGAAGTTCACTTTTAAAGCACACTTGGGGAGCATAAAATGGgccgcacactcacacactaatCTGGCATCTTTATGCTCTGGATTTGAGTCATTTTAGATCATTAGATCATCATCAGATTAGATCATTTATGAAAGATTAAAAGACAAAGATATTATTGCATATTTATACATGACATTGATTATATTTTCTGCAGATGCATTGCATACAAAAAGACCTGATGCAGCCCTAATAGTGACTCTTTTATGCAAGTATTTACCAGTCCTTTCTCCTTCATTTACACTGTTCTGTTGCATGTTTTAGACATTTTGCTTTGTGTCTCTGAATGCTCTGATTAGTTATCCCTAGAATGCCAGTGTTTTGtgataacttattttttttcatctttgactTTTTCTATCTGTATTTGAAGGGCAGCTCATCCCCCAGAGACGACTTTCTCCCACAATGCCCTGACCCTGAGATCTATGTGTGGAATTCTCTGCTCATTTATCAGTGTGGGCCTGCTCCTCTCCCTGCGCACTCTCATTTTTTCACAGTCCCGATCCTGGTACTGTTGCACCCCAAACTACATCTGTGTAACTCTCAGACTTGCACACAACCGAGCATACCTACAGCTGTGGGAAAAGTTATGTGTTTTTCTctccaaattcaaaatataaacacTTAAGATAACAAAACATAactaaattaacataaatattttagttaaaataagCTGTACTGTTTTACTTTTAAGTATTaacgttttttttattgttttgtcacaaatttcagaaccctgatgtcaattttcaaaactctacatACAAAACTCTAAACAGTCACTACTTTTAACGCAGACACTTCAGAGTTCAGTAAAGTATAGGATACAGGTTTTATTATGGTTTATACATAAGTGTTGAACAGTACAGACAGTGGATACACTGAACTACTTTTACTCATTCCATCATAATGTaggtttactgtattttttttctcactgCACGTCCCCATATAGAAAGCTGATATATGGCATGATATATGACAACAAATGCAACTTACGATTGGATTCCGTACTGTATATTAGGCTTGCCACGTtagacggtgttgacggtgataccggttttaagacgcaacaacggtgacatcactttttcacagtgacaccgtccccacatttgttttttgttttttaagtatttttttttattaaatgtttatttgaattaaatgggaaacataattctaaataatttacttaagacGAGAGCATGCACTATAATTATTATCTGAATATAGCTACAAAgcatcatatttcatttatcacatgAAGAGAACGAGAG
>TCONS_00053523
gtggatgaTGAGTTACTGTTGTTCAGATCATGAACTCGAGGTGTTCAGTCGCAGATATGGAAAAGACAGGTGTGGCTTCCTGGTTTCCCTTGTGATGAAATAATAGAGAGGACGGGGAGGGTGAAGGGATGACAGGAACTGTCTAAATGACTAAGATGCATTGCATACAAAAAGACCTGATGCAGCCCTAATAGTGACTCTTTTATGCAAGGCAGCTCATCCCCCAGAGACGACTTTCTCCCACAATGCCCTGACCCTGAGATCTATGTGTGGAATTCTCTGCTCATTTATCAGTGTGGGCCTGCTCCTCTCCCTGCGCACTCTCATTTTTTCACAGTCCCGATCCTGGTACTGTTGCACCCCAAACTACATCTGTGTAACTCTCAGACTTGCACACAACCGAGCATACCTACAGCTGTGGGAAAAGTTATGTGTTTTTCTctccaaattcaaaatataaacacTTAAGATAACAAAACATAactaaattaacataaatattttagttaaaataagCTGTACTGTTTTACTTTTAAGTATTaacgttttttttattgttttgtcacaaatttcagaaccctgatgtcaattttcaaaactctacatACAAAACTCTAAACAGTCACTACTTTTAACGCAGACACTTCAGAGTTCAGTAAAGTATAGGATACAGGTTTTATTATGGTTTATACATAAGTGTTGAACAGTACAGACAGTGGATACACTGAACTACTTTTACTCATTCCATCATAATGTaggtttac

Function


GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000096099

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00057637 False 5871 lncRNA 0.39 6 11761954 11772599
TCONS_00057638 False 1094 lncRNA 0.37 4 11762093 11772599
TCONS_00053522 False 1095 lncRNA 0.38 4 11762097 11772599
TCONS_00053521 False 1099 lncRNA 0.38 4 11762097 11772599
TCONS_00057639 False 1069 lncRNA 0.40 2 11765092 11766446
TCONS_00057640 False 4438 lncRNA 0.33 1 11768162 11772599
TCONS_00053523 True 764 lncRNA 0.39 4 11768261 11772240

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_027159 mkln1 coding upstream 31186 11690923 ~ 11730768 (+)
XLOC_027158 NA coding upstream 133342 11628170 ~ 11628612 (+)
XLOC_027157 BX465862.5 coding upstream 195798 11566040 ~ 11566156 (+)
XLOC_027156 asb13a.2 coding upstream 237066 11483335 ~ 11524888 (+)
XLOC_027155 asb13a.1 coding upstream 278764 11479705 ~ 11483190 (+)
XLOC_027161 NA coding downstream 17200 11789799 ~ 11793783 (+)
XLOC_027162 NA coding downstream 174276 11946875 ~ 11950926 (+)
XLOC_027163 cry1a coding downstream 240444 12013043 ~ 12026507 (+)
XLOC_027164 tnnt2c coding downstream 259359 12031958 ~ 12033866 (+)
XLOC_027165 NA coding downstream 267050 12039649 ~ 12052670 (+)
XLOC_027150 BX649349.1 non-coding upstream 472171 11285929 ~ 11289783 (+)
XLOC_027149 BX784029.3 non-coding upstream 523932 11202941 ~ 11238022 (+)
XLOC_027144 NA non-coding upstream 934962 10816130 ~ 10826992 (+)
XLOC_027166 NA non-coding downstream 291392 12063991 ~ 12065363 (+)
XLOC_027175 NA non-coding downstream 979955 12752554 ~ 12755202 (+)

Expression



Co-expression Network