G812382


Basic Information

Item Value
gene id G812382
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 48278177 ~ 48286426 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU924208
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>TU924209
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>TU924210
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Function

NR:

description
peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP1A-like

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU924208 False 2982 lncRNA 0.37 4 48278177 48284725
TU924209 False 3013 lncRNA 0.38 6 48278177 48286426
TU924210 True 3409 lncRNA 0.37 3 48278177 48281763

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
snphb LOC106572120 coding upstream 18840 48224647 ~ 48259337 (+)
ntsr1 LOC106572121 coding upstream 119213 48104332 ~ 48158964 (+)
LOC110532248 LOC106572122 coding upstream 254987 47986339 ~ 48023190 (+)
LOC110532243 mthfr coding upstream 584029 47679540 ~ 47694148 (+)
LOC110533018 LOC106572129 coding upstream 641764 47635370 ~ 47636413 (+)
LOC110532257 LOC106572113 coding downstream 100341 48386767 ~ 48394099 (+)
LOC110532258 LOC106572114 coding downstream 114211 48400637 ~ 48404003 (+)
taf13 taf13 coding downstream 294817 48581243 ~ 48582509 (+)
LOC110531191 LOC106566483 coding downstream 329897 48616323 ~ 48617448 (+)
LOC118966185 NA coding downstream 332557 48618983 ~ 48620336 (+)
G812101 NA non-coding upstream 246059 48029315 ~ 48032118 (+)
G812103 NA non-coding upstream 250190 48027529 ~ 48027987 (+)
G812102 NA non-coding upstream 251998 48024222 ~ 48026179 (+)
G812127 NA non-coding upstream 317430 47960522 ~ 47960747 (+)
G812126 NA non-coding upstream 317958 47959996 ~ 47960219 (+)
G812555 NA non-coding downstream 43170 48329596 ~ 48329827 (+)
G812613 NA non-coding downstream 139858 48426284 ~ 48435659 (+)
G812683 NA non-coding downstream 248145 48534571 ~ 48534871 (+)
G812684 LOC106572106 non-coding downstream 251601 48538027 ~ 48541698 (+)
G812143 NA other upstream 295876 47982001 ~ 47982301 (+)
G809685 NA other upstream 2142445 46134731 ~ 46135732 (+)
G807841 NA other upstream 3825100 44442662 ~ 44453077 (+)
G807677 NA other upstream 4082136 44195715 ~ 44196041 (+)
G805600 NA other upstream 5929391 42346176 ~ 42348786 (+)
G812688 LOC106572106 other downstream 259028 48545454 ~ 48570593 (+)
G813071 NA other downstream 673323 48959749 ~ 48959991 (+)
G813074 etbr2 other downstream 716893 48962187 ~ 49006710 (+)
G813139 NA other downstream 828711 49115137 ~ 49115618 (+)
G815428 NA other downstream 2509788 50796214 ~ 50800381 (+)

Expression


Co-expression Network