G823397


Basic Information

Item Value
gene id G823397
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 58069667 ~ 58075937 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU936183
ctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcaggcagggataaagcagggatggggcagtatgtttATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggattgggcAGTATGTTAATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcaggcagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcaggcagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcggggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcaggcagggataaagcagggatggggcagtatgtttATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggatggggcagtatgtttATATTATCTGTCTATATGGCAGGGAT
>TU936184
ctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcaggcagggataaagcagggatggggcagtatgtttATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggattgggcAGTATGTTAATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaggcagggatggggcagtatgtttATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggatggggcagtatgtttATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatataatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtcttaggcagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttATATTATCTGTCTATATGgcagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcaggcagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcaggcagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgtttatattatctgtctcagacagggataaagcagggatggggcagtatgttaatattatctgtct

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU936183 False 1842 lncRNA 0.43 3 58069667 58075937
TU936184 True 1978 lncRNA 0.43 2 58069667 58073709

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110532463 LOC106572391 coding upstream 49075 57984189 ~ 58020592 (+)
LOC110532462 LOC106572392 coding upstream 110705 57342345 ~ 57958962 (+)
LOC118966205 NA coding upstream 706181 57363432 ~ 57363486 (+)
LOC110532457 LOC106572399 coding upstream 824965 57241333 ~ 57244702 (+)
mfsd4ab mfsd4a coding upstream 846389 57217995 ~ 57223278 (+)
apex2 apex2 coding downstream 210508 58286445 ~ 58290128 (+)
LOC110532471 LOC106572384 coding downstream 222836 58298773 ~ 58321350 (+)
LOC110532474 LOC106572383 coding downstream 245664 58321601 ~ 58331563 (+)
LOC110532475 LOC106572379 coding downstream 284836 58360773 ~ 58382911 (+)
LOC110532478 LOC106572378 coding downstream 309573 58385510 ~ 58390570 (+)
G823378 NA non-coding upstream 30709 58038759 ~ 58038958 (+)
G823377 NA non-coding upstream 32971 58036404 ~ 58036696 (+)
G823372 NA non-coding upstream 41210 58028240 ~ 58028457 (+)
G823371 NA non-coding upstream 42101 58027266 ~ 58027566 (+)
G823409 NA non-coding downstream 17247 58093184 ~ 58094280 (+)
G823347 NA non-coding downstream 41037 58116974 ~ 58118766 (+)
G823459 LOC106572386 non-coding downstream 140239 58216176 ~ 58250307 (+)
G823549 NA non-coding downstream 258714 58334651 ~ 58334911 (+)
G823551 NA non-coding downstream 260504 58336441 ~ 58336705 (+)
G823373 NA other upstream 40810 58028619 ~ 58028857 (+)
G822404 NA other upstream 1306127 56762625 ~ 56763540 (+)
G822283 NA other upstream 1496710 56572607 ~ 56572957 (+)
LOC110532427 LOC106572343 other upstream 1936731 56125754 ~ 56132936 (+)
G823467 NA other downstream 129326 58205263 ~ 58244984 (+)
G823580 LOC106567312 other downstream 443282 58519219 ~ 58535643 (+)
LOC110532492 LOC106572441 other downstream 592217 58668090 ~ 58671251 (+)

Expression


Co-expression Network