G827458


Basic Information

Item Value
gene id G827458
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 61943934 ~ 61944525 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU940893
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>TU940894
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>TU940896
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>TU940897
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>TU940898
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>TU940899
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Function

NR:

description
agmatinase, mitochondrial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU940893 False 456 lncRNA 0.36 3 61943934 61944525
TU940894 False 456 lncRNA 0.36 2 61943934 61944525
TU940895 False 456 lncRNA 0.36 2 61943934 61944525
TU940896 False 524 lncRNA 0.36 2 61943934 61944525
TU940897 False 524 lncRNA 0.36 2 61943934 61944525
TU940898 False 520 lncRNA 0.36 2 61943934 61944525
TU940899 True 524 lncRNA 0.36 2 61943934 61944525

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110531232 djc16 coding upstream 1294 61937419 ~ 61942640 (+)
trnaa-ugc-37 NA coding upstream 212767 61731094 ~ 61731167 (+)
si:ch73-206d17.1 LOC106572549 coding upstream 256413 61662253 ~ 61687521 (+)
ptpn22 LOC106572545 coding upstream 581196 61332104 ~ 61362738 (+)
LOC110532569 LOC106572541 coding upstream 787231 61103767 ~ 61156703 (+)
mul1b mulan coding downstream 140483 62085008 ~ 62093546 (+)
LOC110532588 LOC106572556 coding downstream 228927 62173452 ~ 62186259 (+)
LOC110532589 cpsf3l coding downstream 252378 62196903 ~ 62206569 (+)
LOC110532593 LOC106572560 coding downstream 281259 62225784 ~ 62323683 (+)
LOC110532591 LOC106572559 coding downstream 382465 62326990 ~ 62340784 (+)
G827408 NA non-coding upstream 73863 61865027 ~ 61870071 (+)
G827357 NA non-coding upstream 140426 61801797 ~ 61803508 (+)
G827302 NA non-coding upstream 215333 61728356 ~ 61728601 (+)
G827242 NA non-coding upstream 236693 61705692 ~ 61707241 (+)
G827422 NA non-coding downstream 330 61944855 ~ 61945306 (+)
G827423 agmat non-coding downstream 1370 61945895 ~ 61948613 (+)
G828151 NA non-coding downstream 50454 61994979 ~ 61995252 (+)
G828172 NA non-coding downstream 63670 62008195 ~ 62008645 (+)
G828181 NA non-coding downstream 70285 62014810 ~ 62015019 (+)
G827039 NA other upstream 692696 61212461 ~ 61251238 (+)
G826751 NA other upstream 1282028 60661369 ~ 60661906 (+)
G826653 NA other upstream 1380537 60563080 ~ 60563397 (+)
G826505 NA other upstream 1497400 60446030 ~ 60446534 (+)
G825749 NA other upstream 1933509 60010009 ~ 60010425 (+)
G828274 NA other downstream 244657 62189182 ~ 62190606 (+)
LOC110532602 NA other downstream 678714 62623239 ~ 62627845 (+)
LOC110532619 LOC106572645 other downstream 1621053 63565578 ~ 63601970 (+)
G830755 gp182 other downstream 2369553 64314078 ~ 64316656 (+)
G830923 NA other downstream 2721223 64665748 ~ 64666311 (+)

Expression


Co-expression Network