G833241 (LOC106572720)


Basic Information

Item Value
gene id G833241
gene name LOC106572720
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 66931688 ~ 66934487 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU947546
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>TU947547
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>TU947549
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>TU947550
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU947546 False 2772 TUCP 0.40 2 66931688 66934487
TU947547 False 2778 TUCP 0.40 2 66931688 66934487
TU947549 False 2766 TUCP 0.40 2 66931688 66934487
TU947550 True 2752 TUCP 0.40 2 66931688 66934487

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118966099 NA coding upstream 305863 66615300 ~ 66628653 (+)
LOC110532711 LOC106572715 coding upstream 338103 66582815 ~ 66593585 (+)
LOC110532709 myl6b coding upstream 415686 66506476 ~ 66516002 (+)
LOC118965939 NA coding upstream 449309 66481679 ~ 66482379 (+)
LOC110532708 LOC106572691 coding upstream 450144 66478086 ~ 66481544 (+)
LOC110532716 LOC106572708 coding downstream 93542 67028029 ~ 67042094 (+)
LOC110532719 ssrd coding downstream 110710 67045197 ~ 67049885 (+)
LOC110532722 LOC106572704 coding downstream 329077 67263564 ~ 67278303 (+)
LOC110532726 LOC106572718 coding downstream 545865 67480352 ~ 67580588 (+)
LOC110532729 LOC106572697 coding downstream 673186 67607673 ~ 67618114 (+)
G833240 LOC100846954 non-coding upstream 329 66929691 ~ 66931359 (+)
G833239 LOC106572710 non-coding upstream 4591 66926578 ~ 66927097 (+)
G833230 NA non-coding upstream 9894 66921002 ~ 66921794 (+)
G833142 NA non-coding upstream 138103 66793266 ~ 66793585 (+)
G833099 NA non-coding upstream 172780 66758653 ~ 66758908 (+)
G833271 NA non-coding downstream 85870 67020357 ~ 67021927 (+)
G833307 NA non-coding downstream 132256 67066743 ~ 67067594 (+)
G833311 NA non-coding downstream 141645 67076132 ~ 67080003 (+)
G833335 NA non-coding downstream 186605 67121092 ~ 67121455 (+)
G833471 NA non-coding downstream 202871 67137358 ~ 67137840 (+)
G833139 LOC100380641 other upstream 110049 66814464 ~ 66821639 (+)
G833100 LOC106613929 other upstream 172015 66759278 ~ 66759673 (+)
LOC110532701 LOC106572669 other upstream 1130857 65754497 ~ 65801814 (+)
LOC110532705 LOC106567051 other upstream 1260205 65669353 ~ 65671483 (+)
G831865 NA other upstream 1308372 65622938 ~ 65623316 (+)
G833541 NA other downstream 278933 67213420 ~ 67213884 (+)
G833906 LOC100194703 other downstream 686391 67620878 ~ 67621366 (+)
G834099 NA other downstream 1114426 68048913 ~ 68049222 (+)
fance fance other downstream 1282591 68213202 ~ 68218960 (+)
G834228 NA other downstream 1333550 68268037 ~ 68268408 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
mexican tetra (Astyanax mexicanus) G131329 NA non-coding NC_035911.1 CM008314.1 11552913 ~ 11555625 (+)