LOC110533671 (LOC106603546)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110533671
gene name LOC106603546
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 32981866 ~ 33045499 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036990084.1
acacaccacacacacacgttctcacACAGCGGAGCGTAGCTGAGAGGCAGGGACTGCAGCAGTATGCACCAGCCACGTCTGATCTGTGTGGAGACTTGAGGAAGGAGAACTAGGAAGAGGATATAATGTAGCAGTGTCTTACACAACCCAACCCCCGTGCGTACAGTAGCTACATCTCTACTCTGCAGCAGTGGCAACGGTGCATTTCAAGAGTGGACAGCTTATGTTATCTGCCCCCCTCTGACTGCACTGCCTCTGCATCCATCTCCATTCACTCTGCTCCTCCCATTCCacatcttcatcctcctcttcctcctcccaacTACGGCAACATTAGGCAGGACCACGGACCGTACGAGATTGCCAACGCTGATCACAGGACCCTCAGGTTTGTCCTGTCTGATGGAGTCGTGCTGGTTATGCTAGATCATCATCACCTTCATTAACGACTGGATTCTAATCGAGCTCAGGAGACAAGGAAAGAAAAAACATCCCCCAAAAACGAAAAAGGAGTGTTGGATGTTTGTGACGCTCTTTGTCGGCTCTGTTGGGTTGTTGGCTCTTTTCCTGTATTTGCTTGGTTGTTTTTGCCTTCTCTGAGACCGGCTAGCAGGCACTGCAGCACCAGGAAGGACTGCAGGAGCCGTGAAGTAGTATGGCATGAGGACCCAGGGGCGAGCGAATCGGAAGGGCTTGAGCTACCATTACTGCTGCTGCTGAGGTGCTTATCttaattttttttctccagaaaggGCATCTGGAGGGGGCTGGGTTGGGGTGGGTTGTGACAGTGAAGGTACCCGGGACCCTACAGAGTGGAGTGGGTGTCTCTGGCGTAGAGGAGCCACGCAGATAGGCAGGACGTCCtgtgggaaaggaggagagaagagaggaagaggggctgGCTCAGGCTCGGGCCCCTGATGGTGGCTATTTTTGTCTCCCCTAGCTGAGTGATTGGGGACAGCAGGTAAAGGAAAAGATGCTTATGGGTGCGGGACGAGACACGGCGCGGGATGAGGCCCAGAAGCTTCACAGGAAGTGGCTGAAGCACCAGGCCTTCATGGCCGAGCTGGCCCGCAACAAAGAATggctggccaagatagagcagGAGGGCCAGGAGCTGATCGATGAGAAGCCGGAGCTGCGTTCGGTGGTGCAGCAGAAGCTGGAGGAGATCAGGGAGTGCTGGACGGACCTGGAGACCACCACCAAGGCCAAGGCCCGGGCTCTGTTTGAGAACAACAAGCCAGAGCCGGTGGTGAAGAGCTACTCAGACCTGGACCACCAGCTCTCTGGCCTGGAGAAACAGCCCCCCCAGCTGGAGCAGGCTCATCACCTACCCACCTTCAACGAGCAGCTGCAGAAATTTCAGTCTCAGATGGGGAACTTGTACAAGGACGTAGGGGAACTAGGGTCCCTCCAGGGGGTGTGCCTCCCCCAGCGAGGCAGCCTGGTGAAGGGTGGCGAGGGAGAAGGGGGCGAGCAGCCAGCCGTAGTGGAGACCCGCATCGTGCGCCTCATCGAGCCCCTGAAGGAGAGACGACGCATCCTGCTGGCCTCCAAAGAGATGCACCAGGTCGCTCAGGACCTGGAGGAAGAGATACTGTGGATCCAGGAGCGGCTTCCTCTGGCCTCCTCTAATGATTACGGCAACAACCTGCAGAGTGTTCAGCAGCATGTCAAGATCAACCAGACACTGCAGAGGGATCTGCAGGGGCGCCAAGCACGGGTGGAGGAGGTGTTGGACCGGGCGGGGATCATCGCCTCTCTGCGGACCCCTGAGGTTGACTTTGTGCGTGAGGGGGCGGGGCATGTGCGTCAGGTGTGGGAGGTGCTGAGGCTGGAGGCGGAGAAGAGGTCTGTGATGCTGGATGTGGTGCTGCTGGCCCAGCAGTACTACAGCGAGGCAGCCAAGGTGGAGTCCTGGCTGGCAGGCCAGAAACTGCACCTCATCAATGAGGAGAAGGGCACGGACGAGGAGAGCACCCTGCAGCTGCTGAAGGAGCACCTGGCCTTGGAGGCGACAGTGGAGAACTACGCTGAGACAGTGGGCATGCTCTCCCAGCAGTGTCAGCGACAGCTTGAGCTGGGGCACCCAGATAGTGAGGGGATCACCAAGCAGCAGTCCCACATAGACCGTCTGTATGTGTCTCTGAAGGACATGGTGGAGCACAGGAAGACCAagctggagcagcagtactggaTGTACCAGCTCaacagagaggtggaggagttaGAGAAGTGGATCACTGAGAGGGAGGCCGTTGCCAGCTCCACTGAGCTGGGTCAAGACCTGGAGCATGTCACGatgcTACAGGAAAAATTCACCAAGTTCTGCTCAGAGACCAACAGCATAGGCCAGCAGAGGATGGAGCAGGTGAATAAGATGGTGAATGAGATGATAGACTGTGGCCACACGGACGCGGCCACCATAGCTGAGTGGAAGGACGGACTGAACGAGTCATGGGCCGACCTACTGGAGCTCATGGAGACCCGAAGACAGATGCTGGCAGCATCACACCAGCTGCACAAGTTCTTCACCGACTGCAAAGAGGTCTTGGCTCAGACTGCGGGGAAGATGAGGCAGTTGCCAGAGGTGAGGGCGTGCCAAGCCAGCATCGCCAACCCTGCCACCCTGCAGAGGCTCATGCTCTCCTTCGAGCACGCCCTCCAGCTGCTCGTCTCACAGGTAAGGCAGCTGCAGGAAAATGCGGCCCAGCTGAGGACCATCTATGCCGGAGAGAAGGCTGAGGCCATCATGAGCAAAGAGCAGGAAGTGATGTCAGCATGGAAGGAGTTACTGGTTTCCTGTGAGGCCAGTCGTGTGCAGGTCACCTCGGTGACAGACAAGGTGCAGTTCTTCTCGGTGGTGCGCGAGCAGCTCATGTGGATGGAGGGCATCATGGGACAGATTGGAGGGGACGACCCCAGGGACTCGTCTTCTGCAGAGGTGATGATGAAACAGCATGGTGAGCTGAAAGCCAAGATGGATGGCCGTAGGAAGACAATACAGCAATGTGTGGAGCTGGGAAAGATCCTGCTGGCCGCAGGCAACCCAGCCTCCGAGGAGATAAAGGAGAAGTTGGATGCGCTCCTGGCTAAGCAGAAGGATCTCTCTGAGAGATGGGACAAACAGCAGGAGAAGCTACAGCGCAAGAAGGATCAGTTCCAGTATGCCCAGGAGACGGTGAAGGCGGAGGCCTGGCTGAAGGCCAAGGAGCCCCTGATTAGCTCCAGCTCCTCCTCTAGGGTGGCTGGGGGGGCTGGAGGAGACGCCCAGGTCCAGACTGATGAGGTGGAGCAACTCATCCTCCGCCACGAGGCCTTCCGCAATGCTGCAGCCACCTGGAAGGAGCGCTTCAGCTCACTGAGACAGCTCTCCAATGCAGAGAAgctgagagaagaacagagcagcaAGCCTTCCCCAATGCCACTCTCCAGTCGGAGGATGTTCCCATCATCCTGTCTTACTCCGACCATTCCTCTTGCTACCTCAACTCTGCTGAGACAGACGGTCCAGGTGCATATTGAGCCCAGGCCCAAGCAGACCAGTCTGGAGATGTCTGCCTCTGCCTCCTCTGCAGCCCAAAGGTTGGGTTCTACCATAGCCAGCTATGCTCCTGTCATAAATGGCTCTGGTTACCATGGACTGGACAATCAGAGCAGCAGCGGGGGATTGGAGAGTTCCAACTACCCTGGACTGAACCATCCAGGCAGTGGAGGAGTGGACAGCAGCTCTAGTTACCTTGGAGGGAACCATCAGACTGGCTCCCCGCCAGTGGATAGTTCTGGCTACCTTGGACTGAACCATCAAAACAGTGGGGGTATGGTTAGTCCAGGCTACCTACCTCAAAACCAAAGTAGTGGAGGTATGTGTGGTCCAGGCTACCTACCTCAAAATCAAAGCAGTGGGAGTATGGGTAGTCCAGGCTACTTGCCGCAAAATCTAAGTAGTGGGAGTATGGGTAGTCCAGGCTACCAGCCACAAAATCAAAGTAGTGGGGGTATGGGTAGTCCAGGCTACCTGCCAAAAAATCTAAGTATTGGGGGTATGGGTagtccaggctacctgcctcaaaATCAAAGTAGTGGGGGTATGGGTagtccaggctacctgccgcaaaATCAAAGTAGTGGGGGTATGTGTAgttcaggctacctgccgcaaaATCAAAGTAGTGGGGGTATAGGTAGTTCAGGCTACTTGCCGCAAAATCAAAGTAGTGGTGGTATGGGTAGCTCAGGCTACCTTGCACAAAATCAAAACAGTGTTGGGATTGGTAGCTCAGGCTACCTTGGGAAAAATCAAAGTAGTGGGGGTATGGGAAGTACTGGCTACCTTGCACAGCACCAAGGTAGTGGGAGTATGGGTAGTTCAGGCTACCTTGCGCAAAGTGTTGGGGGTATGGGTAGTTCTAGCTATCTGCCTCAAAGTGGTGGGGTCATGGACCCCAAAATGGCATATGCGTGGCAGCATCTGAAAGCTGACTGCATGCAGCCCAGGATCAACCACATGCACAAAGCTGTCAACCCCCTCCTGGAGGCCAGCAGGGCGCAGAGGGAACAGTTTGGGGACATCCCCATGGTGGACATGATCGGGCCGGAGTCTGGCCTGGATCTCCTCCACGGCAGGCTCCAGAGGGACCCTCGCGGCAGCCGCTCCGACCCCCAGATGGACCACCTGCGGCGGGAGAGGGAGTACAAGCTGGGTCGGCAGACCTCCAGCGAACAGGAGATTCAGGCGCGCCTCAACGAGCTGCCAATGATTGTGCGCCAGGAGCGCTATAGGCGACGCCTGGAGAGGCAGTCGTCCAGCGAGCAGGAGGGCAGTGGGAAGGCGAGGACACCGAGGCAGGACGACTCCAGCGACATGGAGTCAGCCAAGGAAGGCTCCGACAAGCGCTCAATAGAGAAGAGAGCCACCACCATGGCTGAGATTGTGGAGCAGgcccaggagagagaggcagcacaAGCTCGAGGGGAGATGTACCGCCCCACCAGCAGCCTCTCAGCACCCGTGACCTACGAGCGCCCGCGAGCCCGAGACCGCCCCAAACCCCGCAGGAGACCCCGCCCCAAAGAGCCTGAGGAGAAGCGACGCTCTCGCTCGGCTCCGGCCCAGAGCCCGGCACAACTTCTGCCACCCTCACACACTGCCCATAATGAAGGCTTCCTGTACCGCAAACACGACTTTGAGGGGCACCAGAAGAGTCCCAGCAGTAAGTCCTGGGTGAATTTGTATTGCGTGTTGTCAAAGGGAGGGATCACTTTCTACAAGGACGCCAAGAGCACCACCACACCTTACAATGAAGAAACCCCACTCGACCTGAGCGTCTGTATATGTGATAGCACCATAGGatacaagaagaagaaaaatgtcTTCGTTATCAAGAAAAATGATGGCAATGACTATATTTTCCATGCAAAGGATGAGGAGGACCTGAAGGCTTGGGTCACTAACATCACCACCAGTATAACTGAACATGAGGAGATCGCCAAGTGGGACAAGCCCACCACCTCGTCCACAGATCCCGACCGCtcggagaggaaggagaagtcAGAGGGCGACGCAGACGCCAGGTCAGAGAGGtctgagatgggaggagaggtggaggaggaggagaggtcagagaaagagaggtctgAGAAGGGAGAGGGGTCCAAGAAGACGGGAGAAGGCTCAGAGAAAGCAGACACGtcggagaggggtgagagggcaGAGGGGGGGGCAGGGGGCTCCAGCACGTCAGGGAAGAGCAAATGATCCCCGCTGAGTGGAGGAGTGGACTGGCATCCAACCATCTAAagcccccctcccctcctaaCTTTACCCTGCGACACCAGACAGTGCTGAAcaagggagacggagggagatgtGTACATTTCTGTGCAtatcttctctctttttctctctctatatctctctgtctctctctgtgacatCCTGAGGCTTGGGTCCTAATGTTAACTGTGACTGTCTGATCTTtcagcccctccccctcccccaggcAAAATACATCAATACTTGCATTGCATTGTGGCCCTTGCTGGTAGGTTGGAGGATAGGGGAGATTAACCAGCGCCACTGTGTGGTCACAGGCATTTGTCACAGTCACGACTCATTGATCATTTATTTCTTGGATTCACAGCATctctcagtatatatataatatacctatgACTGACTATGTAATGCTCTGTCTAAAACAACCCAAGCAGTGGTGAATGAAATGTCTCACAATATTTTGAAAAAGCTTTTTTCTGAAGcaatatacttttttatttattctctttgtttgagagagagggaaaggagaaaaGAAACAGTTGCTTATTAATTCTATGATTGTTCACATTCATCATCAGCTTATTTCTGTCAGGTCAGCAGCACCTTAAACACTTCCAACACGTTTGTGTATACTCAGCATATTGACATTTCAAACCCACCTCATCGCTATCTCTGAGTCATGTTGTCATGATGGAATGCTGGTATTACCTATTTGTGTTAATAATTGAATTGATCAACACACGATTCTCTTCTGAACTTTTGGATTAATCATGTACAGTCCCATGCCATGCCAGGAATAAATGTGAAATAGGGTTGCCAAAAAACTCCATCACATCCAAGAGTCTATTCAAGGAGGCAATGCCCAATTTAACCTCCTTGTGGTGCCAGACCTGTGTCATGGCATGACAGTATAGTGCACCTTCTATTTGAATGCCTTCATGTTCTTCGTGGTCTTGAGAGGTTCACCAgtttttaaatgaatttggcAGTGCAATAATTCCATCTGAAGGGAAGGTCTGTGTAAAATGCTAATATCATGGTAGATCTTAAACTATCCCCACATAAAGTATGGTGATAAGAAGATATGTTTTAATGACATAGCAGAGAAAAGCCCAAGCCAGAAATACTTAATGCTTCTTTTGACTGCTATTTGATCTGAGACAAATTAAGAAGCATTAGAACCCCATTGCtgtttttattatattattaGAATATATTCGACAGGGACTGTAATGGTTTCACTTGTGGAAATACAGTAGTAACATCAACATTAGGTGAACcccaaaatatacagttgaagtcataagtttacatacacttagtttggagtcattaaaacttgtttttcaaaaattccacaaatgtaatgttaacaaactatagttttggcaagtcggttaggacatc
>TU1001241
CTAATTTATTTAATAGATTCATTTTTACCACACATTTCGTCGACATCCTCACGATGGAATTCTAAAAAGAAATGTCTAATATCCAGAAATTGTGTTTAGTGAAAAGTTCTGACAAGTCTTGGATCTTGAGGAACCTGGTGACCCATTTATAAAAACTTGTTCCTTTTCTGTGAAACATGACCACAAGTACCACTACCTAcctatagttgaagtcagaagtttacatacacttaggttggagtcattaaaaatgtttcaaccactccacaaatttcttgttaacaaactatagttttggcaagtcggataggacatctactttgtgcatgacacaagtacttttccCCAACAATTGTATGcagagattatttcactatcacaatcccagtgggtcagaggtttacatacactaagttgattgtgcctttaaacagcttggaaaattccagaaaattatgtcatggccttaggctaattgacatcatttgagtcaattggaggtgtacctgtggatgtatttcaaggcctaccttcaaactcagtgcctctttgcttggcatcaaggggagaaaaaaaaaatctaaagaaatcagccaagacctcagaaagaaaattatTGCTcccatgtctggttcatccttgggagcaatttccaaatgcctgaaggtaccacattcatctgtacaaacaatagtatgaaagtataaacaccatgggaccacgcagcagtcatgccgctcaggaaggagacgcgttctgtctcctagagatgaacatacttgtgcgaaaagtgcaaatcaattcaagaagagcagcaaaggaccttgtgaagatactgggaAAAGaatggtacaaaagtatctatatccacagtaaaacgagttctataaatcgacataacctggaaggccgctcagcaaggaagaaactgccgaagaataccatcccaaccgtgaagcacgggggtggcagcatcatgttgtgcgggtgcattgctgcaggagggactggtgcacttcacaaaatagatggcatcatgaggaacgaaaattgtggatatattgaagcaacatcaagacatgtcaggaagttaaagcttggtcgcaaatgggtcttccaaatggacaatgaccccaaggctccaaagttgtggcaaaatggcttaaggacaacaaagtcaaggtattggagtggccatcacaaagccctgacctcaatcccatagaaaatgtgtgggcagaactaaaaagtgtgtgcgagcaaggaggcctacaaacctgactcagttacaccagccaagtcaggaggaatgggccaaaattcacccttgtggaaggctaccaaaaacatttgacccaagttacacaatttaaaggcaatgctaccaaaataCTGAGTGTaggtaaacctctgacccactgggaatgtgatgaaagaaataataaatcattatactattattctgacatttcacattcttaaaaggcgtgatcctaactgacctaaaacagtgcatttttactaggattaagtgtcaggaattgtgaaaaactgagtttaaatgtatttggctaaggtgtatgtaaacttccgacttcaactgtatcataaACTACTTCTCCCTCCCTGTTTTCTGTCTTTCTGAGATTAAACCAATAGAAAATGATTGTCAGTCAGAGGAGGATTTATGTACAAGTGTCATGATCTGGTCATTAAATTGTAGATATCTTTAAGTACAGTCCACCAATAAATCCTATGCTCATTCTATGGAATGAAGTGGGTTAAGATTAAAACAATTATGTTAATCTACACAAATTAAATGTGGAAACAATACCAGTCAATTACGATATTACTGTTTATTTCATTTAAATGAAAAGAAAAATGCAAATTAGGAGTCACTAACAAAGGATAGTGTATATACACCAATATCtagttacattttacattttacaaGGGAAAAGAGTGCTGGACCTAGGTACATTTGTATTTATAAATGTGTTTTCCATTTAATTGATCATACGGGTTTGCTACAGACAGTTTTTTCTATTAGTAGTTCGATCCTGTCAGGCAAGTGAATTATTATAAGAACAGTCCTGTAGCGAATGATAGGCCTTCGCTACATTTACTTGAACTGGTTAACAAGCTCGGACGATAACAAAGAACTTGCTAACCTGAATGCTAGTTTATTTAGCAACTCTGGAGCTGATCAGACTGGTATCCAGGCTACACACGTTTTAGCTGTGACTCTTGAGCTATGACTTCAAAGCTAAATACATccacaaaatgttttgcttgcttCAGTCATATTGGGTGACTACTTATAAACATATATTGATAAGAAAGTGAATGAACACAAATATGTTGGTTTAGTTAGTACTGTACACCTACAATATGAAACCTCAATAGCCAGCATAGTATGATTGAAATTGGGTCAACTCTGTTTCAAATTGGCTACTTTTTAATTATGTTTACAGATGTGTTTTTATCTGATTAATAAATGCCCCATACCATGGACCTTCCAAATCAAACATAATTGATTaaagtggtctgtgtgtgttattagtcATAACcaaatctgtaaaaaaaaatacaaattaaaaaacCTTGTTAAGCCTTATCCCCAAAACCAGTATTTAGAAAATTAATTGATTTCACAATATACTCAATACAGACTGTTCCATGTGACCCAGGAAGCAAATACTGGCACTCATTGGTATTAAAGTGTTATGACACAAGCAACAGTCCAACTGCAGCTTGTTGATTGGACGCAGTTATCTTATTGGTAAGACTTGAATATATCATGATATATGTGTTATGTCATCTGTTACAATGTCGACTAGAAACTGTTGAGAAACTGTCAATTACAGTAAAACAACAAACTGACTATTGTAGGTGGTTATTGTAGGTACCACCATGCCATTCTGGATTACAGGCTTTAAAAACAAATGGTACCTAAAATTATAATTTATTAGTAGGCTTATTACCAATTGTTTTCATTGTAACTATTTCCTCTGAAATTGAGCCTTTCATTGCAGTACATACCGTATTTATTAGTTAAACACTAGTAGCTGTTTCTCTTATTTTCCACTGTGGAAAGTGAGAGGCTCTCCTAATTCtattcattctaattctatggttcCCGCCATCTACATTCTTATCAGAGAAATCCCAGCATCACTTGATGAAACAAACAGGTTAATACTATAATACTTACTAAACACACATAAATACTACAATATCTACTAAACACAGAAATACTATAATGCCTACTAAACACACAGAAACAAGGTAACGTAAAGCTCTTGACCTCATGGCTGGTGTTTTTGTgattttgtgtttttcttgtcTCAGATACTGTGTTAGTGTACCTTAATGATACCTATACCTTGCTGCTATGACATTTTATCTATGTAAACCTCTTTATTTGCTGATGCAAAATTTCCGTGAACATTGGTGTATGCTTGACACAAAGGTGTTAAGCCAAGAGTTTTTGAAAAAGTAATCATCAACCATCCTCCACAGATCAGTAGATACATAATGCATTCTATATAGTAGTGGGAGAGATTAAGAAATTCCTGATGTTGCAGCCACTCACAGTGTTTAAAAATCAAAGTAAATTTGCTTGATTGAGTAGAGAAAGTTAACCGATTCCTGTGTTAGAGATTTCACTCTGAAGTagaataaaacattattttaatttaatttggcAAATTAGTCAACCTTGCCAGAGTGTACTGTTCTTGAGACAGGCGTACGCAAAGGTCAATTCTCTTGATTTAGAGGGGGTAAACATACTGTCATTATAACACCAAATGACGTAATCACCAATTAGCATTGGCAAACATTTATTAGAATTCATGGACTTAATCCATATGACCAGCTATGTACTTAATGCTCCAATATCCACTTCTTAATGCCTTTGTGCATTTAACAAATGGAGCAAAATGTCAAGTGTCATGATGACACACTTATGTAGGCATAATGACACAGTTATGTAGGCATAATGACACAGTTATGTATACGCCTTCAACTAAAGTATTCCCTGTATTTAACCAAgtcatttgttattttttttgtaagAAGAAGAAAAACTGTTTGTGTCATAAAGCCACCTGGGGATAGTAACTGAACCACATAGCTCTGACAACCTTAGTGAAGAAATCAGTCATAGATGTCAAATGAAGGGCTGGTCTTTTAAAAAACAACTGTGTTTTCTGTTTTGAGGTAATAACGCTTCAGATCAGTAAGCTTGAAATCTTTgcttatgtacagtatgttggtACACAATAAAACATTTGTATGCTGTATTCTGTAGCCCTCTTATAGCAGATCAGTGAAAGGCTGAAACACATCAGAGCTACTTGCAGTTTTCAAGAGAGACGCAAGTCGAAAACACTAATAATTGATGATGTGCACAGTGTAAAACGCTAGTGGCGACGCAGGGTCTATAAGAAATATACATGTATACAGTATTGCACAAAGTCTGCACAACTCAATGTATGTCTTTTAAGAATGTACATTTTAATTCTGATTTGTTTATTAATAGACTGGAGCAACATCTGCCAATATCTGTCTGTTGAAATATGGTATTGTCTCATAAACTC
>TU1001240
agttgaagtcataagtttacatacacttagtttggagtcattaaaacttgtttttcaaaaattccacaaatgtaatgttaacaaactatagttttggcaagtcggttaggacatctactttgtgcatgatgtttacagacagattatttcacttataattcactgtatcacaattccagtgagtcagatgtttatgtacactaagttgactgtgcctttaaacagcttggaaaataacagaaaatgatatcatagctttagaagtgtctgataggctaatttacatattttgagtcaattggaggtgtacctgtggatgtacttcaaggcctaccttcaaactcagtgcctctttgcttgacgtcatggaaaaaacaaaagaaatcagccaagacctcagaaaataaattgtagacctccacaagtctggtttatccttgggagcaatttccaaatgcctgaaggtaccatgttaatctgtacaaacaatagcatgcaagtataaacaccatgggactatgaagccgtcataccgctcaggagggagacacgttctgtctcctagagaagaacgtactttggtgtgaaaagtgcaaatcaatcccagagcaacagaaaatgaccttgtgaagatgctggaggaaacaggtacaaaagtatctatttctacagtaaaatgggtcctatatcgacctaacccgtaaggccgctcagcaaggaagaagccactgctccaaaactgacataaaaaagccagtctacggtttgcaattgcacatggggacgaagatcgtactttttggagaaatgtcctatggtctgatgaaacaaaaatagaactgtttggccataatgaccatcgttatgtttggaggaaaaagagggaggcttgcaagccgaagaacaccatcccaaccgtgaagcacgggggtggcagaatcatgttgtgggggtgctttgctgcaggagggactggtgcacttcacaaaatagatgacatcatgaggaagaaaaatgatgtggatatattaagcaacatctcaatatgggatattgggtcttccaaatggacaatgactccaagcatacttccaaagttgtggtaaaatggcttaaggacaacaaagtcaaggtattggagtggccatcataaagccctgacctcaatcccatagaaaatttgtgggcagaactgaaaaagtgtgtgcgagcaaggaggcctacaaacgccagctctgtcaggaggaatgggccaaaattcaccaaacctattgtgggaagcttttggaaggctacccgaaacgtttgacccaagttaaacaatttaaaggcaatgctaccaaatactaattgagtgtatgtaaacttccgacttcaactgtatcataaACTACTTCTCCCTCCCTGTTTTCTGTCTTTCTGAGATTAAACCAATAGAAAATGATTGTCAGTCAGAGGAGGATTTATGTACAAGTGTCATGATCTGGTCATTAAATTGTAGATATCTTTAAGTACAGTCCACCAATAAATCCTATGCTCATTCTATGGAATGAAGTGGGTTAAGATTAAAACAATTATGTTAATCTACACAAATTAAATGTGGAAACAATACCAGTCAATTACGATATTACTGTTTATTTCATTTAAATGAAAAGAAAAATGCAAATTAGGAGTCACTAACAAAGGATAGTGTATATACACCAATATCtagttacattttacattttacaaGGGAAAAGAGTGCTGGACCTAGGTACATTTGTATTTATAAATGTGTTTTCCATTTAATTGATCATACGGGTTTGCTACAGACAGTTTTTTCTATTAGTAGTTCGATCCTGTCAGGCAAGTGAATTATTATAAGAACAGTCCTGTAGCGAATGATAGGCCTTCGCTACATTTACTTGAACTGGTTAACAAGCTCGGACGATAACAAAGAACTTGCTAACCTGAATGCTAGTTTATTTAGCAACTCTGGAGCTGATCAGACTGGTATCCAGGCTACACACGTTTTAGCTGTGACTCTTGAGCTATGACTTCAAAGCTAAATACATccacaaaatgttttgcttgcttCAGTCATATTGGGTGACTACTTATAAACATATATTGATAAGAAAGTGAATGAACACAAATATGTTGGTTTAGTTAGTACTGTACACCTACAATATGAAACCTCAATAGCCAGCATAGTATGATTGAAATTGGGTCAACTCTGTTTCAAATTGGCTACTTTTTAATTATGTTTACAGATGTGTTTTTATCTGATTAATAAATGCCCCATACCATGGACCTTCCAAATCAAACATAATTGATTaaagtggtctgtgtgtgttattagtcATAACcaaatctgtaaaaaaaaatacaaattaaaaaacCTTGTTAAGCCTTATCCCCAAAACCAGTATTTAGAAAATTAATTGATTTCACAATATACTCAATACAGACTGTTCCATGTGACCCAGGAAGCAAATACTGGCACTCATTGGTATTAAAGTGTTATGACACAAGCAACAGTCCAACTGCAGCTTGTTGATTGGACGCAGTTATCTTATTGGTAAGACTTGAATATATCATGATATATGTGTTATGTCATCTGTTACAATGTCGACTAGAAACTGTTGAGAAACTGTCAATTACAGTAAAACAACAAACTGACTATTGTAGGTGGTTATTGTAGGTACCACCATGCCATTCTGGATTACAGGCTTTAAAAACAAATGGTACCTAAAATTATAATTTATTAGTAGGCTTATTACCAATTGTTTTCATTGTAACTATTTCCTCTGAAATTGAGCCTTTCATTGCAGTACATACCGTATTTATTAGTTAAACACTAGTAGCTGTTTCTCTTATTTTCCACTGTGGAAAGTGAGAGGCTCTCCTAATTCtattcattctaattctatggttcCCGCCATCTACATTCTTATCAGAGAAATCCCAGCATCACTTGATGAAACAAACAGGTTAATACTATAATACTTACTAAACACACATAAATACTACAATATCTACTAAACACAGAAATACTATAATGCCTACTAAACACACAGAAACAAGGTAACGTAAAGCTCTTGACCTCATGGCTGGTGTTTTTGTgattttgtgtttttcttgtcTCAGATACTGTGTTAGTGTACCTTAATGATACCTATACCTTGCTGCTATGACATTTTATCTATGTAAACCTCTTTATTTGCTGATGCAAAATTTCCGTGAACATTGGTGTATGCTTGACACAAAGGTGTTAAGCCAAGAGTTTTTGAAAAAGTAATCATCAACCATCCTCCACAGATCAGTAGATACATAATGCATTCTATATAGTAGTGGGAGAGATTAAGAAATTCCTGATGTTGCAGCCACTCACAGTGTTTAAAAATCAAAGTAAATTTGCTTGATTGAGTAGAGAAAGTTAACCGATTCCTGTGTTAGAGATTTCACTCTGAAGTagaataaaacattattttaatttaatttggcAAATTAGTCAACCTTGCCAGAGTGTACTGTTCTTGAGACAGGCGTACGCAAAGGTCAATTCTCTTGATTTAGAGGGGGTAAACATACTGTCATTATAACACCAAATGACGTAATCACCAATTAGCATTGGCAAACATTTATTAGAATTCATGGACTTAATCCATATGACCAGCTATGTACTTAATGCTCCAATATCCACTTCTTAATGCCTTTGTGCATTTAACAAATGGAGCAAAATGTCAAGTGTCATGATGACACACTTATGTAGGCATAATGACACAGTTATGTAGGCATAATGACACAGTTATGTATACGCCTTCAACTAAAGTATTCCCTGTATTTAACCAAgtcatttgttattttttttgtaagAAGAAGAAAAACTGTTTGTGTCATAAAGCCACCTGGGGATAGTAACTGAACCACATAGCTCTGACAACCTTAGTGAAGAAATCAGTCATAGATGTCAAATGAAGGGCTGGTCTTTTAAAAAACAACTGTGTTTTCTGTTTTGAGGTAATAACGCTTCAGATCAGTAAGCTTGAAATCTTTgcttatgtacagtatgttggtACACAATAAAACATTTGTATGCTGTATTCTGTAGCCCTCTTATAGCAGATCAGTGAAAGGCTGAAACACATCAGAGCTACTTGCAGTTTTCAAGAGAGACGCAAGTCGAAAACACTAATAATTGATGATGTGCACAGTGTAAAACGCTAGTGGCGACGCAGGGTCTATAAGAAATATACATGTATACAGTATTGCACAAAGTCTGCACAACTCAATGTATGTCTTTTAAGAATGTACATTTTAATTCTGATTTGTTTATTAATAGACTGGAGCAACATCTGCCAATATCTGTCTGTTGAAATATGGTATTGTCTCATAAACTC

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036990084.1 False 7198 mRNA 0.53 19 33009387 33041014
TU1001241 False 4604 TUCP 0.36 2 32981866 33045499
TU1001240 True 4382 lncRNA 0.36 3 33040900 33045499

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110533664 LOC106603537 coding upstream 229455 32639570 ~ 32779932 (+)
LOC110533663 LOC106603538 coding upstream 374292 32599894 ~ 32635095 (+)
LOC110533662 mog2a coding upstream 418021 32565890 ~ 32591366 (+)
LOC110534887 LOC106603535 coding upstream 490000 32505369 ~ 32519387 (+)
LOC110533659 NA coding upstream 512001 32493717 ~ 32497386 (+)
LOC110534913 LOC106603425 coding downstream 20397 33061411 ~ 33063183 (+)
LOC110533672 LOC106603547 coding downstream 89829 33130843 ~ 33140211 (+)
samsn1b LOC106603553 coding downstream 427350 33468364 ~ 33492333 (+)
serpinh1a serph coding downstream 512294 33553308 ~ 33557914 (+)
LOC110533682 NA coding downstream 527423 33568437 ~ 33569230 (+)
G879844 LOC106603544 non-coding upstream 18574 32983645 ~ 32990813 (+)
G879853 NA non-coding upstream 46774 32960875 ~ 32962613 (+)
G879879 NA non-coding upstream 57078 32952039 ~ 32952309 (+)
G879877 NA non-coding upstream 62722 32946445 ~ 32946665 (+)
G879846 LOC106603541 non-coding upstream 72772 32934196 ~ 32936615 (+)
G879914 NA non-coding downstream 11803 33052817 ~ 33053058 (+)
G880032 NA non-coding downstream 213661 33254675 ~ 33255017 (+)
G880068 LOC106603551 non-coding downstream 256200 33297214 ~ 33298232 (+)
G880080 NA non-coding downstream 282958 33323972 ~ 33324235 (+)
G880091 NA non-coding downstream 308566 33349580 ~ 33349805 (+)
LOC110534883 med13 other upstream 1686787 31241426 ~ 31382578 (+)
G877809 NA other upstream 1803969 31205083 ~ 31205418 (+)
LOC110533640 LOC106603515 other upstream 2253731 30748439 ~ 30771331 (+)
G876079 ubb other upstream 2959334 30020641 ~ 30050053 (+)
G880069 NA other downstream 259751 33300765 ~ 33301738 (+)
LOC110533688 NA other downstream 1003480 34044472 ~ 34047724 (+)
hsd20b2 LOC106603577 other downstream 1393528 34422538 ~ 34435620 (+)
LOC110533705 LOC106603578 other downstream 1396326 34437126 ~ 34443357 (+)
G879832 NA non-coding upstream 79197 32876245 ~ 32902669 (+)
LOC110533629 LOC106603502 other upstream 2959576 30021091 ~ 30022290 (+)

Expression


Co-expression Network