LOC110533845 (LOC106603305)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110533845
gene name LOC106603305
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 38755443 ~ 38815017 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021618385.2
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>XM_021618386.2
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>TU1008492
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Function

NR:

description
transmembrane protein FAM155A-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021618385.2 False 4559 mRNA 0.42 3 38755443 38815017
XM_021618386.2 False 4094 mRNA 0.41 3 38756706 38815017
TU1008492 True 964 TUCP 0.49 4 38755509 38812139

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110534919 NA coding upstream 12186 38734143 ~ 38743257 (+)
LOC110533840 LOC106603308 coding upstream 419154 38310821 ~ 38336289 (+)
LOC110533839 LOC106603310 coding upstream 468783 38280338 ~ 38286660 (+)
ar-beta ar-beta coding upstream 525205 38178704 ~ 38230238 (+)
LOC110533835 NA coding upstream 637456 38117154 ~ 38117987 (+)
LOC110533846 LOC106603304 coding downstream 14601 38829618 ~ 38891890 (+)
LOC110533847 LOC106603405 coding downstream 77954 38892971 ~ 38898218 (+)
LOC110533848 igbp1 coding downstream 87666 38902683 ~ 38908772 (+)
LOC110533849 cxb1 coding downstream 100876 38915893 ~ 38920113 (+)
LOC110533852 LOC106603303 coding downstream 107325 38922342 ~ 38928260 (+)
G886378 NA non-coding upstream 36946 38718287 ~ 38718497 (+)
G886365 NA non-coding upstream 44349 38710886 ~ 38711094 (+)
G886345 NA non-coding upstream 54777 38700432 ~ 38700666 (+)
G886341 NA non-coding upstream 60579 38694349 ~ 38694864 (+)
G886337 NA non-coding upstream 63868 38691298 ~ 38691575 (+)
G886474 NA non-coding downstream 98498 38913515 ~ 38973414 (+)
G886521 cssa04hxorf57 non-coding downstream 192508 39007525 ~ 39009684 (+)
G886551 NA non-coding downstream 209310 39024327 ~ 39028030 (+)
G886602 NA non-coding downstream 278359 39093376 ~ 39098544 (+)
G883966 NA other upstream 1904290 36849646 ~ 36851153 (+)
LOC110533788 NA other upstream 1953858 36799376 ~ 36801589 (+)
G883473 om-i other upstream 2459896 36292302 ~ 36295572 (+)
LOC110533748 prps1 other upstream 3068870 35674201 ~ 35686573 (+)
G882624 NA other upstream 3339205 35414975 ~ 35416238 (+)
G889906 LOC106603262 other downstream 2897310 41712327 ~ 41717292 (+)
G890228 NA other downstream 3263198 42078215 ~ 42154093 (+)
G891133 NA other downstream 4167665 42982682 ~ 43109676 (+)
G891188 NA other downstream 4281703 43096720 ~ 43097617 (+)
G891741 NA other downstream 4719299 43534316 ~ 43600230 (+)

Expression


Co-expression Network