LOC110533897 (LOC106603248)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110533897
gene name LOC106603248
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 42070963 ~ 42077962 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021618489.2
ATATTGGTGGACCATTAGTGTAGGTAGGCCTATATCTTAATCTAACATACATCCTTGGATTTATACTGGAGGATTTAGAAAATAAAGGATTAGGTCTAACACTGATGGTAAACACATCTAAAATACCGTTTACTGTATTTACCACATCTGCAGCTTTACAGATTTGCTGTAATTAAGACCAAGACCAGATGTATTGCTAGATACCCTACTTTACTTTTAGTATTCGTTttataatggtgtgtgtgtgcgtgtgcgtgcgtgtggtaATCCCTTTGTCTTTTTATCCGTAAATGTGTTTGTCACGATACCAACCGCCGCGTAGCAGTTAAATTCTGTTTCCGCTCTGGGTAAATGACGTTAAACATGCACTTAAGGCATGTGGAAAACAGGTCAATGCAACTGCACCAGCGAAAACCGCTGTGCGTCCCACGGATAGCCCCGGGTTTATTTCTCACAAAACATCTTAATTCTTCTGTTCGCTAATGATCCCGGAACACTTCCCTCTAATCCCCACTCCATTAATTAAAAAGAGCACGAGCCCACGGAAAACCTCGCCATCTGCTGTGGTTTCATTCCGGTAGACAGATTGTGTTTTCATCTTATTTAAAACAAGGGGATTGGAGAGTTTTTAGAGCAGGCGTGTGATGGAGTGATGCGAGAGAGGATGACCTCTCACTGGTGAGGAGACACtgagctccatcccatcctctaCTCACACGCACAGCTGGAATAGCCTAGCCTATAGACTACTGAAAactgtttattttattatttaaactATACATTTGGTCGTTTATTTTAGTGAGATGTTACTTATTTGCTCTTAAAAATAGATATTGTTTGGGTTTTATTCAAATATTTGCCTGTGCGTTGTAAGGTTTATGCAATAGATTTGATTGTAGCCTAGCCTATTACTTTCTTCTTCTGCAATTGGTCATTTTGAATGAAGCTACTGCAGTAGATCTATTTGACAAACCGAGGATCAAATAAACTTGAACCATTTGTAACCCCAAAATGGGTAAGACAGTTTTTCAAATATTAAAGCATGCGATATGTCGCATGAACCATGCATGCATGCTATTTTGTATCATAACCTTCAAGAGAGATAAATTAGTTTAATTCAACTAAACTGTGATAGCCTATCATTTTAGCCCCCCGTCCCGTAGAAATTGGGCTAAATAACACGGTCGCTGCATTTGATTAGTGCGAAAGATTAGCCTATGGTGTTTGTGCTCAAACTGGAATCAGAGCAGATGTCGCTTTTCCCTATCGGAATACTGGGATTGAGCCaataaacacacgcacgcacgcgcgcgcgcgcacacacacacacacacaccagagcatCACAATGCTAATCAGAGACACCAACCTCCTCTGCGCaccccttcttctctcctcttcttttctcactcacacacacattcaaagacACTCCGCTGGGGCGAACTCCAAGGCTCCACTTCAAGTTGTGGATGCTATTAGCCTATATCTTTATATTCACTTTTTTCCATTTAGAATAAAAGAGTACAATTCGAAAATGATTATTTACAGAATAATATATATTTAAACGTAATAATTTTCTAACTGAAACCCATGGAGTGTGCATTTTTTGTAGTATAATCCGCCGCTCAGATGGACCTCCGAGGCGCGAAGAGACGGCTTGGGGGGATATGGCAGGTGACATGCCTAGCTCTCGTCGTATGTGTCCTGGATTTAGTTTGGGCTCAGATTCGTTATTCAATCCCTGAGGAACTGGAACATGGCGCTTTTGTTGGAAACATAGCCGAGGACTTGGGTTTAGACGTCGAGAGACTCTCTGCGCGCAGGTTCAGGATAGTTTCAGGCGCAAAAAAGCAATACTTGGAGGTGAATTTAGAAAATGGTATTTTATTTGTAAACGAAATAATTGATCGAGAGGAACTATGTGAACAGAGTCTGTCTTGCTCTTTCCATTTGCAAGTGGTAATCGAAAACCCATTGGAACTGTACAGGGTTGAGGTGGAGATTTTAGATGTGAACGATAACTCACCCAGTTTTCCGTGGAGTGAGTTTAATTTGGATATATCCGAGTCGGCGGTACCCGGGTCCCGCTTCCCACTAGAGAGCGCGCAGGACTTGGACGTTGGAAGCAACTCGCTCCGCTCGTATCTGCTGAGTGTGAATGAACATTTTGTCCTGGACATCCAGACGCGTAGTGATGGCAGTAAGTTTGCGGAGTTGGTCCTGGAGAGCCCCTTGGACAGAGAGCAGCAGAATACGCACCAGGTGGTGCTGACGGCCGTGGATGGAGGCTCGCCAGAGAGATCCGGGACAGCGCAAATCAATATAACAGTTCTGGATGCAAATGACAACGCGCCCGTGTTCGACCAGTCTTTCTACAGAGTGAGGCTTGTGGAAAACGCACCGAAGGGCACCGTTGTGATAAAACTAAACGCATCGGATTTGGATGAGGGTCCTAATGCGGATATCACATACTCTTTCAGCGGGCATGCTCCCATAAAAGTGCGCGAGCTTTTCAGTGTGGATTCGCGCACTGGAGAGATCAGAGTGAAAGGTGTCGTAGATTATGAAAAGGCCAGGATGCATGAGATATATGTGCAAGCCAAGGACAAGGGCCCATCGGCAGTGGCCGTGCACTGTAAAGTTCTAGTCAATATCTTAGATGTGAATGACAACCTCCCGGAGGTGATCTTGACATCAGTGTCCACACCTGTCCAAGAGGACGCACCACCGGGGACTGTGATAGCTGTCATCAGCGTCATGGACAAAGACTCAGGTGAAAATGGAAATGTTGACTGTGAAATTCCACATCATGTCCCCTTCCAGCTCCACTCCTCTTTTAAGAACTATTACACTTTGGTTACTTGTGATTTTTTGGACAGAGAGACGGTGCCAGAGTACAACATCACTCTCACAGCAAGAGATATGGGCGCACCTCCCTTGTTCACAAGGAAAACTATTTTGGTTCAAGTGTCAGACATGAACGACAACACACCCCGATTCAAGCAGCCGTCATACACCGTCTATTTGACAGAGAATAACGCACCAGGAGCCTCAATTTGCTCGGTTACTGCCCTGGATCCAGATTCTGACCAAAATGCCTATCTCTCTTACTCTATTCTGGAAGGTGATATACATGGGATGTCCGTGTCCACCTACGTCTCCATAAACTCAGACAACGGGAATATTTACGCATTGCGTTCTTTTGACCATGAGCAGCTAAGAAACTTTCAGATTTTAGTCCAAGCACAAGATGCCGGGTTTCCACCCCTGAGAACCAATGTTACCGTAAATGTCTTTATTTTAGACCAAAATGACAATGCACCAGTCATAGTAGCACCTCTACCCCAAAACGGCACCGCGGCGACTGAAGTGGTGCCCAGGTCAGTTGATGCTGGCTATCTTGTGGCAAAAATCACTGCGATGGACGCAGACGCAGGTCAAAACTCGCGTCTGTTCTACCAGGTGCTCCAGGCAAACGACCCGAGCCTGTTTAGCGTCGCTCTGTACACGGGCGAAATCAGGACAATTCGCCGATTTGTGGAAAAAGACCCCATAAGGCAAATGCTGGTCATTCTGGTCAAGGACAACGGTCAGCCACCCCTTTCGGCCACAGTTTCCATCATCCTGTCAGTTGTTGACAACGTGCCAGAATCGCTGCCTGATTTCGGCGACCTCACACTGAGCCCCCAGTACCGCTCGAACCTCACGCTGTACTTAATAGTGTCTCTGGGCGTTATCTCGTTCACGTTTCTGGTGGCTATTATCGTCCTGGCGGCGATAAAGGGATACAGGGATAGACATTCCATTCGGAGGTATAACGTCTCTCTGAGTGCATGCTGCGGGTTCCGATCAGAGGAATCTACCACTGATGTGTTCAAGAAGTCCAACTTGAACGTGCAGATAACCACAGGCACCAAAGGATCCACGAACTGCGTTGAGGCAAATGGCAACGGCCCCCTTTCTCAGCCATACTGCTACAAGATGTGTCTGACCCCGGAATCATCCAAGAGCGATTTCATGTTCCTAAAGTCATGCAGTCCGATGAATGCGACTCCACAGAAGAATAATGCCAAGGGCGCAGACTACCCCAAATCGGGTTGGAGCGCACAGGACTCCCGCAGCCTGATAGTGAACAACGGAGCAACTATTCCGAACGAGCTCAAGCAAGCGAACATGGACTGGACATTGACGAAAAATCGACGAAATTCAGCACACAAAAGGTCAACAAAAATCTTTAGATCCATGGAGAGGACCTTCCCACGTAGACCCAGGCCGGACCCTGATGGCTTCTCCTGCCCGGTGGCACCGCAGTACTATACCTGGGGTAGTCATATGCGTGCAGAATACAAGATGTCCTCCCAGGTCGAAGGGATTGGAGGGGTTGGAAGTGTAGGAAGGGTTCCAAACCGTTCGTGGACTCCGAGTTACACCCAGCCTCCATCTGCACAGCCACCACCTGACTACCAGCACAACGTCTACATCCCTGGCACACCGTCTGGGTACTGCACTCTGAAGCCTGCACCCAGGGGGGAACTGGATGTCTACAACTCATTCTCTACGTTTGGAAAGAATAAGAGGTTCATCTCTAGCTATGACCCGAGCTTTGACCAGAGAGGGGACAACCTGATAAACAAGGACTTTTTTAAATGAATATATTAGAAGACACTGTGCATACAATTTAATACACACTTCCGTGGATGTTCATTAACTATTAATATAATCAACCCATATAGTATAAACCTCTGTGCACAAGGAACATTTAAATAGTTTAGTATATTTGAATCCATGCTTCGAACACATAACTTAATAATTTACAGCATATTCTTTTCTCTCAATACAGCAGTGTCATAATTCTCTATTTTAATTTGTATCATGTACAGTCCTAGTTGATAATGATGATGAGATTGTGCAGATATAAGGGCAATTATAGTCACTTGTGGGGATAATGAGGAAAATGATCTGAGGATATCTGTTCCCAGCAGTTATGGCAAATTCTCCAAATGCCTTGAGGGTTGCGTTGTGAAGATTGTGCACGGCATTCTGTTAGGCAGTGATTTACAAGCATGTATATCATATTGTTGTACTTTATACCTTCATGTTTGACCCGTTTGGCTTCTTAAACACGTTTATATGTATAAAATCGGATTTTACTGCTGA
>XM_021618490.2
ATATTGGTGGACCATTAGTGTAGGTAGGCCTATATCTTAATCTAACATACATCCTTGGATTTATACTGGAGGATTTAGAAAATAAAGGATTAGGTCTAACACTGATGGTAAACACATCTAAAATACCGTTTACTGTATTTACCACATCTGCAGCTTTACAGATTTGCTGTAATTAAGACCAAGACCAGATGTATTGCTAGATACCCTACTTTACTTTTAGTATTCGTTttataatggtgtgtgtgtgcgtgtgcgtgcgtgtggtaATCCCTTTGTCTTTTTATCCGTAAATGTGTTTGTCACGATACCAACCGCCGCGTAGCAGTTAAATTCTGTTTCCGCTCTGGGTAAATGACGTTAAACATGCACTTAAGGCATGTGGAAAACAGGTCAATGCAACTGCACCAGCGAAAACCGCTGTGCGTCCCACGGATAGCCCCGGGTTTATTTCTCACAAAACATCTTAATTCTTCTGTTCGCTAATGATCCCGGAACACTTCCCTCTAATCCCCACTCCATTAATTAAAAAGAGCACGAGCCCACGGAAAACCTCGCCATCTGCTGTGGTTTCATTCCGGTAGACAGATTGTGTTTTCATCTTATTTAAAACAAGGGGATTGGAGAGTTTTTAGAGCAGGCGTGTGATGGAGTGATGCGAGAGAGGATGACCTCTCACTGGTGAGGAGACACtgagctccatcccatcctctaCTCACACGCACAGCTGGAATAGCCTAGCCTATAGACTACTGAAAactgtttattttattatttaaactATACATTTGGTCGTTTATTTTAGTGAGATGTTACTTATTTGCTCTTAAAAATAGATATTGTTTGGGTTTTATTCAAATATTTGCCTGTGCGTTGTAAGGTTTATGCAATAGATTTGATTGTAGCCTAGCCTATTACTTTCTTCTTCTGCAATTGGTCATTTTGAATGAAGCTACTGCAGTAGATCTATTTGACAAACCGAGGATCAAATAAACTTGAACCATTTGTAACCCCAAAATGGGTAAGACAGTTTTTCAAATATTAAAGCATGCGATATGTCGCATGAACCATGCATGCATGCTATTTTGTATCATAACCTTCAAGAGAGATAAATTAGTTTAATTCAACTAAACTGTGATAGCCTATCATTTTAGCCCCCCGTCCCGTAGAAATTGGGCTAAATAACACGGTCGCTGCATTTGATTAGTGCGAAAGATTAGCCTATGGTGTTTGTGCTCAAACTGGAATCAGAGCAGATGTCGCTTTTCCCTATCGGAATACTGGGATTGAGCCaataaacacacgcacgcacgcgcgcgcgcgcacacacacacacacacaccagagcatCACAATGCTAATCAGAGACACCAACCTCCTCTGCGCaccccttcttctctcctcttcttttctcactcacacacacattcaaagacACTCCGCTGGGGCGAACTCCAAGGCTCCACTTCAAGTTGTGGATGCTATTAGCCTATATCTTTATATTCACTTTTTTCCATTTAGAATAAAAGAGTACAATTCGAAAATGATTATTTACAGAATAATATATATTTAAACGTAATAATTTTCTAACTGAAACCCATGGAGTGTGCATTTTTTGTAGTATAATCCGCCGCTCAGATGGACCTCCGAGGCGCGAAGAGACGGCTTGGGGGGATATGGCAGGTGACATGCCTAGCTCTCGTCGTATGTGTCCTGGATTTAGTTTGGGCTCAGATTCGTTATTCAATCCCTGAGGAACTGGAACATGGCGCTTTTGTTGGAAACATAGCCGAGGACTTGGGTTTAGACGTCGAGAGACTCTCTGCGCGCAGGTTCAGGATAGTTTCAGGCGCAAAAAAGCAATACTTGGAGGTGAATTTAGAAAATGGTATTTTATTTGTAAACGAAATAATTGATCGAGAGGAACTATGTGAACAGAGTCTGTCTTGCTCTTTCCATTTGCAAGTGGTAATCGAAAACCCATTGGAACTGTACAGGGTTGAGGTGGAGATTTTAGATGTGAACGATAACTCACCCAGTTTTCCGTGGAGTGAGTTTAATTTGGATATATCCGAGTCGGCGGTACCCGGGTCCCGCTTCCCACTAGAGAGCGCGCAGGACTTGGACGTTGGAAGCAACTCGCTCCGCTCGTATCTGCTGAGTGTGAATGAACATTTTGTCCTGGACATCCAGACGCGTAGTGATGGCAGTAAGTTTGCGGAGTTGGTCCTGGAGAGCCCCTTGGACAGAGAGCAGCAGAATACGCACCAGGTGGTGCTGACGGCCGTGGATGGAGGCTCGCCAGAGAGATCCGGGACAGCGCAAATCAATATAACAGTTCTGGATGCAAATGACAACGCGCCCGTGTTCGACCAGTCTTTCTACAGAGTGAGGCTTGTGGAAAACGCACCGAAGGGCACCGTTGTGATAAAACTAAACGCATCGGATTTGGATGAGGGTCCTAATGCGGATATCACATACTCTTTCAGCGGGCATGCTCCCATAAAAGTGCGCGAGCTTTTCAGTGTGGATTCGCGCACTGGAGAGATCAGAGTGAAAGGTGTCGTAGATTATGAAAAGGCCAGGATGCATGAGATATATGTGCAAGCCAAGGACAAGGGCCCATCGGCAGTGGCCGTGCACTGTAAAGTTCTAGTCAATATCTTAGATGTGAATGACAACCTCCCGGAGGTGATCTTGACATCAGTGTCCACACCTGTCCAAGAGGACGCACCACCGGGGACTGTGATAGCTGTCATCAGCGTCATGGACAAAGACTCAGGTGAAAATGGAAATGTTGACTGTGAAATTCCACATCATGTCCCCTTCCAGCTCCACTCCTCTTTTAAGAACTATTACACTTTGGTTACTTGTGATTTTTTGGACAGAGAGACGGTGCCAGAGTACAACATCACTCTCACAGCAAGAGATATGGGCGCACCTCCCTTGTTCACAAGGAAAACTATTTTGGTTCAAGTGTCAGACATGAACGACAACACACCCCGATTCAAGCAGCCGTCATACACCGTCTATTTGACAGAGAATAACGCACCAGGAGCCTCAATTTGCTCGGTTACTGCCCTGGATCCAGATTCTGACCAAAATGCCTATCTCTCTTACTCTATTCTGGAAGGTGATATACATGGGATGTCCGTGTCCACCTACGTCTCCATAAACTCAGACAACGGGAATATTTACGCATTGCGTTCTTTTGACCATGAGCAGCTAAGAAACTTTCAGATTTTAGTCCAAGCACAAGATGCCGGGTTTCCACCCCTGAGAACCAATGTTACCGTAAATGTCTTTATTTTAGACCAAAATGACAATGCACCAGTCATAGTAGCACCTCTACCCCAAAACGGCACCGCGGCGACTGAAGTGGTGCCCAGGTCAGTTGATGCTGGCTATCTTGTGGCAAAAATCACTGCGATGGACGCAGACGCAGGTCAAAACTCGCGTCTGTTCTACCAGGTGCTCCAGGCAAACGACCCGAGCCTGTTTAGCGTCGCTCTGTACACGGGCGAAATCAGGACAATTCGCCGATTTGTGGAAAAAGACCCCATAAGGCAAATGCTGGTCATTCTGGTCAAGGACAACGGTCAGCCACCCCTTTCGGCCACAGTTTCCATCATCCTGTCAGTTGTTGACAACGTGCCAGAATCGCTGCCTGATTTCGGCGACCTCACACTGAGCCCCCAGTACCGCTCGAACCTCACGCTGTACTTAATAGTGTCTCTGGGCGTTATCTCGTTCACGTTTCTGGTGGCTATTATCGTCCTGGCGGCGATAAAGGGATACAGGGATAGACATTCCATTCGGAGGTATAACGTCTCTCTGAGTGCATGCTGCGGGTTCCGATCAGAGGAATCTACCACTGATGTGTTCAAGAAGTCCAACTTGAACGTGCAGATAACCACAGGCACCAAAGGATCCACGAACTGCGTTGAGGCAAATGGCAACGGCCCCCTTTCTCAGCCATACTGCTACAAGATGTGTCTGACCCCGGAATCATCCAAGAGCGATTTCATGTTCCTAAAGTCATGCAGTCCGATGAATGCGACTCCACAGAAGAATAATGCCAAGGGCGCAGACTACCCCAAATCGGGTTGGAGCGCACAGGACTCCCGCAGCCTGATAGTGAACAACGGAGCAACTATTCCGAACGAGCTCAAGCAAGCGAACATGGACTGGACATTGACGAAAAATCGACGAAATTCAGCACACAAAAGGTCAACAAAAATCTTTAGATCCATGGAGAGGACCTTCCCACGTAGACCCAGGCCGGACCCTGATGGCTTCTCCTGCCCGGTGGCACCGCAGTACTATACCTGGGGTAGTCATATGCGTGAATACAAGATGTCCTCCCAGGTCGAAGGGATTGGAGGGGTTGGAAGTGTAGGAAGGGTTCCAAACCGTTCGTGGACTCCGAGTTACACCCAGCCTCCATCTGCACAGCCACCACCTGACTACCAGCACAACGTCTACATCCCTGGCACACCGTCTGGGTACTGCACTCTGAAGCCTGCACCCAGGGGGGAACTGGATGTCTACAACTCATTCTCTACGTTTGGAAAGAATAAGAGGTTCATCTCTAGCTATGACCCGAGCTTTGACCAGAGAGGGGACAACCTGATAAACAAGGACTTTTTTAAATGAATATATTAGAAGACACTGTGCATACAATTTAATACACACTTCCGTGGATGTTCATTAACTATTAATATAATCAACCCATATAGTATAAACCTCTGTGCACAAGGAACATTTAAATAGTTTAGTATATTTGAATCCATGCTTCGAACACATAACTTAATAATTTACAGCATATTCTTTTCTCTCAATACAGCAGTGTCATAATTCTCTATTTTAATTTGTATCATGTACAGTCCTAGTTGATAATGATGATGAGATTGTGCAGATATAAGGGCAATTATAGTCACTTGTGGGGATAATGAGGAAAATGATCTGAGGATATCTGTTCCCAGCAGTTATGGCAAATTCTCCAAATGCCTTGAGGGTTGCGTTGTGAAGATTGTGCACGGCATTCTGTTAGGCAGTGATTTACAAGCATGTATATCATATTGTTGTACTTTATACCTTCATGTTTGACCCGTTTGGCTTCTTAAACACGTTTATATGTATAAAATCGGATTTTACTGCTGA
>XM_021618491.2
TATTGGTGGACCATTAGTGTAGGTAGGCCTATATCTTAATCTAACATACATCCTTGGATTTATACTGGAGGATTTAGAAAATAAAGGATTAGGTCTAACACTGATGGTAAACACATCTAAAATACCGTTTACTGTATTTACCACATCTGCAGCTTTACAGATTTGCTGTAATTAAGACCAAGACCAGATGTATTGCTAGATACCCTACTTTACTTTTAGTATTCGTTttataatggtgtgtgtgtgcgtgtgcgtgcgtgtggtaATCCCTTTGTCTTTTTATCCGTAAATGTGTTTGTCACGATACCAACCGCCGCGTAGCAGTTAAATTCTGTTTCCGCTCTGGGTAAATGACGTTAAACATGCACTTAAGGCATGTGGAAAACAGGTCAATGCAACTGCACCAGCGAAAACCGCTGTGCGTCCCACGGATAGCCCCGGGTTTATTTCTCACAAAACATCTTAATTCTTCTGTTCGCTAATGATCCCGGAACACTTCCCTCTAATCCCCACTCCATTAATTAAAAAGAGCACGAGCCCACGGAAAACCTCGCCATCTGCTGTGGTTTCATTCCGGTAGACAGATTGTGTTTTCATCTTATTTAAAACAAGGGGATTGGAGAGTTTTTAGAGCAGGCGTGTGATGGAGTGATGCGAGAGAGGATGACCTCTCACTGGTGAGGAGACACtgagctccatcccatcctctaCTCACACGCACAGCTGGAATAGCCTAGCCTATAGACTACTGAAAactgtttattttattatttaaactATACATTTGGTCGTTTATTTTAGTGAGATGTTACTTATTTGCTCTTAAAAATAGATATTGTTTGGGTTTTATTCAAATATTTGCCTGTGCGTTGTAAGGTTTATGCAATAGATTTGATTGTAGCCTAGCCTATTACTTTCTTCTTCTGCAATTGGTCATTTTGAATGAAGCTACTGCAGTAGATCTATTTGACAAACCGAGGATCAAATAAACTTGAACCATTTGTAACCCCAAAATGGGTAAGACAGTTTTTCAAATATTAAAGCATGCGATATGTCGCATGAACCATGCATGCATGCTATTTTGTATCATAACCTTCAAGAGAGATAAATTAGTTTAATTCAACTAAACTGTGATAGCCTATCATTTTAGCCCCCCGTCCCGTAGAAATTGGGCTAAATAACACGGTCGCTGCATTTGATTAGTGCGAAAGATTAGCCTATGGTGTTTGTGCTCAAACTGGAATCAGAGCAGATGTCGCTTTTCCCTATCGGAATACTGGGATTGAGCCaataaacacacgcacgcacgcgcgcgcgcgcacacacacacacacacaccagagcatCACAATGCTAATCAGAGACACCAACCTCCTCTGCGCaccccttcttctctcctcttcttttctcactcacacacacattcaaagacACTCCGCTGGGGCGAACTCCAAGGCTCCACTTCAAGTTGTGGATGCTATTAGCCTATATCTTTATATTCACTTTTTTCCATTTAGAATAAAAGAGTACAATTCGAAAATGATTATTTACAGAATAATATATATTTAAACGTAATAATTTTCTAACTGAAACCCATGGAGTGTGCATTTTTTGTAGTATAATCCGCCGCTCAGATGGACCTCCGAGGCGCGAAGAGACGGCTTGGGGGGATATGGCAGGTGACATGCCTAGCTCTCGTCGTATGTGTCCTGGATTTAGTTTGGGCTCAGATTCGTTATTCAATCCCTGAGGAACTGGAACATGGCGCTTTTGTTGGAAACATAGCCGAGGACTTGGGTTTAGACGTCGAGAGACTCTCTGCGCGCAGGTTCAGGATAGTTTCAGGCGCAAAAAAGCAATACTTGGAGGTGAATTTAGAAAATGGTATTTTATTTGTAAACGAAATAATTGATCGAGAGGAACTATGTGAACAGAGTCTGTCTTGCTCTTTCCATTTGCAAGTGGTAATCGAAAACCCATTGGAACTGTACAGGGTTGAGGTGGAGATTTTAGATGTGAACGATAACTCACCCAGTTTTCCGTGGAGTGAGTTTAATTTGGATATATCCGAGTCGGCGGTACCCGGGTCCCGCTTCCCACTAGAGAGCGCGCAGGACTTGGACGTTGGAAGCAACTCGCTCCGCTCGTATCTGCTGAGTGTGAATGAACATTTTGTCCTGGACATCCAGACGCGTAGTGATGGCAGTAAGTTTGCGGAGTTGGTCCTGGAGAGCCCCTTGGACAGAGAGCAGCAGAATACGCACCAGGTGGTGCTGACGGCCGTGGATGGAGGCTCGCCAGAGAGATCCGGGACAGCGCAAATCAATATAACAGTTCTGGATGCAAATGACAACGCGCCCGTGTTCGACCAGTCTTTCTACAGAGTGAGGCTTGTGGAAAACGCACCGAAGGGCACCGTTGTGATAAAACTAAACGCATCGGATTTGGATGAGGGTCCTAATGCGGATATCACATACTCTTTCAGCGGGCATGCTCCCATAAAAGTGCGCGAGCTTTTCAGTGTGGATTCGCGCACTGGAGAGATCAGAGTGAAAGGTGTCGTAGATTATGAAAAGGCCAGGATGCATGAGATATATGTGCAAGCCAAGGACAAGGGCCCATCGGCAGTGGCCGTGCACTGTAAAGTTCTAGTCAATATCTTAGATGTGAATGACAACCTCCCGGAGGTGATCTTGACATCAGTGTCCACACCTGTCCAAGAGGACGCACCACCGGGGACTGTGATAGCTGTCATCAGCGTCATGGACAAAGACTCAGGTGAAAATGGAAATGTTGACTGTGAAATTCCACATCATGTCCCCTTCCAGCTCCACTCCTCTTTTAAGAACTATTACACTTTGGTTACTTGTGATTTTTTGGACAGAGAGACGGTGCCAGAGTACAACATCACTCTCACAGCAAGAGATATGGGCGCACCTCCCTTGTTCACAAGGAAAACTATTTTGGTTCAAGTGTCAGACATGAACGACAACACACCCCGATTCAAGCAGCCGTCATACACCGTCTATTTGACAGAGAATAACGCACCAGGAGCCTCAATTTGCTCGGTTACTGCCCTGGATCCAGATTCTGACCAAAATGCCTATCTCTCTTACTCTATTCTGGAAGGTGATATACATGGGATGTCCGTGTCCACCTACGTCTCCATAAACTCAGACAACGGGAATATTTACGCATTGCGTTCTTTTGACCATGAGCAGCTAAGAAACTTTCAGATTTTAGTCCAAGCACAAGATGCCGGGTTTCCACCCCTGAGAACCAATGTTACCGTAAATGTCTTTATTTTAGACCAAAATGACAATGCACCAGTCATAGTAGCACCTCTACCCCAAAACGGCACCGCGGCGACTGAAGTGGTGCCCAGGTCAGTTGATGCTGGCTATCTTGTGGCAAAAATCACTGCGATGGACGCAGACGCAGGTCAAAACTCGCGTCTGTTCTACCAGGTGCTCCAGGCAAACGACCCGAGCCTGTTTAGCGTCGCTCTGTACACGGGCGAAATCAGGACAATTCGCCGATTTGTGGAAAAAGACCCCATAAGGCAAATGCTGGTCATTCTGGTCAAGGACAACGGTCAGCCACCCCTTTCGGCCACAGTTTCCATCATCCTGTCAGTTGTTGACAACGTGCCAGAATCGCTGCCTGATTTCGGCGACCTCACACTGAGCCCCCAGTACCGCTCGAACCTCACGCTGTACTTAATAGTGTCTCTGGGCGTTATCTCGTTCACGTTTCTGGTGGCTATTATCGTCCTGGCGGCGATAAAGGGATACAGGGATAGACATTCCATTCGGAGGTATAACGTCTCTCTGAGTGCATGCTGCGGGTTCCGATCAGAGGAATCTACCACTGATGTGTTCAAGAAGTCCAACTTGAACGTGCAGATAACCACAGGCACCAAAGGATCCACGAACTGCGTTGAGGCAAATGGCAACGGCCCCCTTTCTCAGCCATACTGCTACAAGATGTGTCTGACCCCGGAATCATCCAAGAGCGATTTCATGTTCCTAAAGTCATGCAGTCCGATGAATGCGACTCCACAGAAGAATAATGCCAAGGGCGCAGACTACCCCAAATCGGGTTGGAGCGCACAGGACTCCCGCAGCCTGATAGTGAACAACGGAGCAACTATTCCGAACGAGCTCAAGCAAGCGAACATGGACTGGACATTGACGAAAAATCGACGAAATTCAGCACACAAAAGCTTTAGATCCATGGAGAGGACCTTCCCACGTAGACCCAGGCCGGACCCTGATGGCTTCTCCTGCCCGGTGGCACCGCAGTACTATACCTGGGGTAGTCATATGCGTGCAGAATACAAGATGTCCTCCCAGGTCGAAGGGATTGGAGGGGTTGGAAGTGTAGGAAGGGTTCCAAACCGTTCGTGGACTCCGAGTTACACCCAGCCTCCATCTGCACAGCCACCACCTGACTACCAGCACAACGTCTACATCCCTGGCACACCGTCTGGGTACTGCACTCTGAAGCCTGCACCCAGGGGGGAACTGGATGTCTACAACTCATTCTCTACGTTTGGAAAGAATAAGAGGTTCATCTCTAGCTATGACCCGAGCTTTGACCAGAGAGGGGACAACCTGATAAACAAGGACTTTTTTAAATGAATATATTAGAAGACACTGTGCATACAATTTAATACACACTTCCGTGGATGTTCATTAACTATTAATATAATCAACCCATATAGTATAAACCTCTGTGCACAAGGAACATTTAAATAGTTTAGTATATTTGAATCCATGCTTCGAACACATAACTTAATAATTTACAGCATATTCTTTTCTCTCAATACAGCAGTGTCATAATTCTCTATTTTAATTTGTATCATGTACAGTCCTAGTTGATAATGATGATGAGATTGTGCAGATATAAGGGCAATTATAGTCACTTGTGGGGATAATGAGGAAAATGATCTGAGGATATCTGTTCCCAGCAGTTATGGCAAATTCTCCAAATGCCTTGAGGGTTGCGTTGTGAAGATTGTGCACGGCATTCTGTTAGGCAGTGATTTACAAGCATGTATATCATATTGTTGTACTTTATACCTTCATGTTTGACCCGTTTGGCTTCTTAAACACGTTTATATGTATAAAATCGGATTTTACTGCTGA
>XM_036990348.1
TATTGGTGGACCATTAGTGTAGGTAGGCCTATATCTTAATCTAACATACATCCTTGGATTTATACTGGAGGATTTAGAAAATAAAGGATTAGGTCTAACACTGATGGTAAACACATCTAAAATACCGTTTACTGTATTTACCACATCTGCAGCTTTACAGATTTGCTGTAATTAAGACCAAGACCAGATGTATTGCTAGATACCCTACTTTACTTTTAGTATTCGTTttataatggtgtgtgtgtgcgtgtgcgtgcgtgtggtaATCCCTTTGTCTTTTTATCCGTAAATGTGTTTGTCACGATACCAACCGCCGCGTAGCAGTTAAATTCTGTTTCCGCTCTGGGTAAATGACGTTAAACATGCACTTAAGGCATGTGGAAAACAGGTCAATGCAACTGCACCAGCGAAAACCGCTGTGCGTCCCACGGATAGCCCCGGGTTTATTTCTCACAAAACATCTTAATTCTTCTGTTCGCTAATGATCCCGGAACACTTCCCTCTAATCCCCACTCCATTAATTAAAAAGAGCACGAGCCCACGGAAAACCTCGCCATCTGCTGTGGTTTCATTCCGGTAGACAGATTGTGTTTTCATCTTATTTAAAACAAGGGGATTGGAGAGTTTTTAGAGCAGGCGTGTGATGGAGTGATGCGAGAGAGGATGACCTCTCACTGGTGAGGAGACACtgagctccatcccatcctctaCTCACACGCACAGCTGGAATAGCCTAGCCTATAGACTACTGAAAactgtttattttattatttaaactATACATTTGGTCGTTTATTTTAGTGAGATGTTACTTATTTGCTCTTAAAAATAGATATTGTTTGGGTTTTATTCAAATATTTGCCTGTGCGTTGTAAGGTTTATGCAATAGATTTGATTGTAGCCTAGCCTATTACTTTCTTCTTCTGCAATTGGTCATTTTGAATGAAGCTACTGCAGTAGATCTATTTGACAAACCGAGGATCAAATAAACTTGAACCATTTGTAACCCCAAAATGGGTAAGACAGTTTTTCAAATATTAAAGCATGCGATATGTCGCATGAACCATGCATGCATGCTATTTTGTATCATAACCTTCAAGAGAGATAAATTAGTTTAATTCAACTAAACTGTGATAGCCTATCATTTTAGCCCCCCGTCCCGTAGAAATTGGGCTAAATAACACGGTCGCTGCATTTGATTAGTGCGAAAGATTAGCCTATGGTGTTTGTGCTCAAACTGGAATCAGAGCAGATGTCGCTTTTCCCTATCGGAATACTGGGATTGAGCCaataaacacacgcacgcacgcgcgcgcgcgcacacacacacacacacaccagagcatCACAATGCTAATCAGAGACACCAACCTCCTCTGCGCaccccttcttctctcctcttcttttctcactcacacacacattcaaagacACTCCGCTGGGGCGAACTCCAAGGCTCCACTTCAAGTTGTGGATGCTATTAGCCTATATCTTTATATTCACTTTTTTCCATTTAGAATAAAAGAGTACAATTCGAAAATGATTATTTACAGAATAATATATATTTAAACGTAATAATTTTCTAACTGAAACCCATGGAGTGTGCATTTTTTGTAGTATAATCCGCCGCTCAGATGGACCTCCGAGGCGCGAAGAGACGGCTTGGGGGGATATGGCAGGTGACATGCCTAGCTCTCGTCGTATGTGTCCTGGATTTAGTTTGGGCTCAGATTCGTTATTCAATCCCTGAGGAACTGGAACATGGCGCTTTTGTTGGAAACATAGCCGAGGACTTGGGTTTAGACGTCGAGAGACTCTCTGCGCGCAGGTTCAGGATAGTTTCAGGCGCAAAAAAGCAATACTTGGAGGTGAATTTAGAAAATGGTATTTTATTTGTAAACGAAATAATTGATCGAGAGGAACTATGTGAACAGAGTCTGTCTTGCTCTTTCCATTTGCAAGTGGTAATCGAAAACCCATTGGAACTGTACAGGGTTGAGGTGGAGATTTTAGATGTGAACGATAACTCACCCAGTTTTCCGTGGAGTGAGTTTAATTTGGATATATCCGAGTCGGCGGTACCCGGGTCCCGCTTCCCACTAGAGAGCGCGCAGGACTTGGACGTTGGAAGCAACTCGCTCCGCTCGTATCTGCTGAGTGTGAATGAACATTTTGTCCTGGACATCCAGACGCGTAGTGATGGCAGTAAGTTTGCGGAGTTGGTCCTGGAGAGCCCCTTGGACAGAGAGCAGCAGAATACGCACCAGGTGGTGCTGACGGCCGTGGATGGAGGCTCGCCAGAGAGATCCGGGACAGCGCAAATCAATATAACAGTTCTGGATGCAAATGACAACGCGCCCGTGTTCGACCAGTCTTTCTACAGAGTGAGGCTTGTGGAAAACGCACCGAAGGGCACCGTTGTGATAAAACTAAACGCATCGGATTTGGATGAGGGTCCTAATGCGGATATCACATACTCTTTCAGCGGGCATGCTCCCATAAAAGTGCGCGAGCTTTTCAGTGTGGATTCGCGCACTGGAGAGATCAGAGTGAAAGGTGTCGTAGATTATGAAAAGGCCAGGATGCATGAGATATATGTGCAAGCCAAGGACAAGGGCCCATCGGCAGTGGCCGTGCACTGTAAAGTTCTAGTCAATATCTTAGATGTGAATGACAACCTCCCGGAGGTGATCTTGACATCAGTGTCCACACCTGTCCAAGAGGACGCACCACCGGGGACTGTGATAGCTGTCATCAGCGTCATGGACAAAGACTCAGGTGAAAATGGAAATGTTGACTGTGAAATTCCACATCATGTCCCCTTCCAGCTCCACTCCTCTTTTAAGAACTATTACACTTTGGTTACTTGTGATTTTTTGGACAGAGAGACGGTGCCAGAGTACAACATCACTCTCACAGCAAGAGATATGGGCGCACCTCCCTTGTTCACAAGGAAAACTATTTTGGTTCAAGTGTCAGACATGAACGACAACACACCCCGATTCAAGCAGCCGTCATACACCGTCTATTTGACAGAGAATAACGCACCAGGAGCCTCAATTTGCTCGGTTACTGCCCTGGATCCAGATTCTGACCAAAATGCCTATCTCTCTTACTCTATTCTGGAAGGTGATATACATGGGATGTCCGTGTCCACCTACGTCTCCATAAACTCAGACAACGGGAATATTTACGCATTGCGTTCTTTTGACCATGAGCAGCTAAGAAACTTTCAGATTTTAGTCCAAGCACAAGATGCCGGGTTTCCACCCCTGAGAACCAATGTTACCGTAAATGTCTTTATTTTAGACCAAAATGACAATGCACCAGTCATAGTAGCACCTCTACCCCAAAACGGCACCGCGGCGACTGAAGTGGTGCCCAGGTCAGTTGATGCTGGCTATCTTGTGGCAAAAATCACTGCGATGGACGCAGACGCAGGTCAAAACTCGCGTCTGTTCTACCAGGTGCTCCAGGCAAACGACCCGAGCCTGTTTAGCGTCGCTCTGTACACGGGCGAAATCAGGACAATTCGCCGATTTGTGGAAAAAGACCCCATAAGGCAAATGCTGGTCATTCTGGTCAAGGACAACGGTCAGCCACCCCTTTCGGCCACAGTTTCCATCATCCTGTCAGTTGTTGACAACGTGCCAGAATCGCTGCCTGATTTCGGCGACCTCACACTGAGCCCCCAGTACCGCTCGAACCTCACGCTGTACTTAATAGTGTCTCTGGGCGTTATCTCGTTCACGTTTCTGGTGGCTATTATCGTCCTGGCGGCGATAAAGGGATACAGGGATAGACATTCCATTCGGAGGTATAACGTCTCTCTGAGTGCATGCTGCGGGTTCCGATCAGAGGAATCTACCACTGATGTGTTCAAGAAGTCCAACTTGAACGTGCAGATAACCACAGGCACCAAAGGATCCACGAACTGCGTTGAGGCAAATGGCAACGGCCCCCTTTCTCAGCCATACTGCTACAAGATGTGTCTGACCCCGGAATCATCCAAGAGCGATTTCATGTTCCTAAAGTCATGCAGTCCGATGAATGCGACTCCACAGAAGAATAATGCCAAGGGCGCAGACTACCCCAAATCGGGTTGGAGCGCACAGGACTCCCGCAGCCTGATAGTGAACAACGGAGCAACTATTCCGAACGAGCTCAAGCAAGCGAACATGGACTGGACATTGACGAAAAATCGACGAAATTCAGCACACAAAAGCTTTAGATCCATGGAGAGGACCTTCCCACGTAGACCCAGGCCGGACCCTGATGGCTTCTCCTGCCCGGTGGCACCGCAGTACTATACCTGGGGTAGTCATATGCGTGAATACAAGATGTCCTCCCAGGTCGAAGGGATTGGAGGGGTTGGAAGTGTAGGAAGGGTTCCAAACCGTTCGTGGACTCCGAGTTACACCCAGCCTCCATCTGCACAGCCACCACCTGACTACCAGCACAACGTCTACATCCCTGGCACACCGTCTGGGTACTGCACTCTGAAGCCTGCACCCAGGGGGGAACTGGATGTCTACAACTCATTCTCTACGTTTGGAAAGAATAAGAGGTTCATCTCTAGCTATGACCCGAGCTTTGACCAGAGAGGGGACAACCTGATAAACAAGGACTTTTTTAAATGAATATATTAGAAGACACTGTGCATACAATTTAATACACACTTCCGTGGATGTTCATTAACTATTAATATAATCAACCCATATAGTATAAACCTCTGTGCACAAGGAACATTTAAATAGTTTAGTATATTTGAATCCATGCTTCGAACACATAACTTAATAATTTACAGCATATTCTTTTCTCTCAATACAGCAGTGTCATAATTCTCTATTTTAATTTGTATCATGTACAGTCCTAGTTGATAATGATGATGAGATTGTGCAGATATAAGGGCAATTATAGTCACTTGTGGGGATAATGAGGAAAATGATCTGAGGATATCTGTTCCCAGCAGTTATGGCAAATTCTCCAAATGCCTTGAGGGTTGCGTTGTGAAGATTGTGCACGGCATTCTGTTAGGCAGTGATTTACAAGCATGTATATCATATTGTTGTACTTTATACCTTCATGTTTGACCCGTTTGGCTTCTTAAACACGTTTATATGTATAAAATCGGATTTTACTGCTGA

Function

NR:

description
protocadherin-10-like isoform X3

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021618489.2 False 5163 mRNA 0.45 4 42070963 42077962
XM_021618490.2 False 5160 mRNA 0.45 4 42070963 42077962
XM_021618491.2 False 5150 mRNA 0.45 4 42070964 42077962
XM_036990348.1 True 5147 mRNA 0.45 4 42070964 42077962

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110533895 LOC106603254 coding upstream 66173 41993741 ~ 42004790 (+)
LOC110533894 LOC106603260 coding upstream 85565 41979285 ~ 41985398 (+)
LOC110533893 LOC106603261 coding upstream 104163 41954207 ~ 41966800 (+)
LOC118966775 NA coding upstream 666821 41401490 ~ 41404142 (+)
LOC110533888 LOC106603264 coding upstream 830835 41029731 ~ 41240128 (+)
LOC110533908 LOC106603248 coding downstream 1580 42079542 ~ 42085755 (+)
LOC110533112 NA coding downstream 34195 42112157 ~ 42115188 (+)
LOC110533898 LOC106603251 coding downstream 39271 42117233 ~ 42150557 (+)
LOC110533900 LOC106603249 coding downstream 87652 42165614 ~ 42306016 (+)
LOC118966776 LOC106603252 coding downstream 90692 42168654 ~ 42171430 (+)
G890203 NA non-coding upstream 46653 42016405 ~ 42024310 (+)
G890205 NA non-coding upstream 46995 42020758 ~ 42023968 (+)
G890201 NA non-coding upstream 55556 42015207 ~ 42015407 (+)
G890199 NA non-coding upstream 57165 42013506 ~ 42013798 (+)
G890195 NA non-coding upstream 61303 42009439 ~ 42009660 (+)
G890228 NA non-coding downstream 12864 42078215 ~ 42154093 (+)
G890247 NA non-coding downstream 17037 42094999 ~ 42098654 (+)
G890249 NA non-coding downstream 19002 42096964 ~ 42101322 (+)
G890318 NA non-coding downstream 256347 42334309 ~ 42334516 (+)
G890325 NA non-coding downstream 265941 42343903 ~ 42344109 (+)
G889906 LOC106603262 other upstream 353671 41712327 ~ 41717292 (+)
LOC110533845 LOC106603305 other upstream 3258824 38755443 ~ 38815017 (+)
G883966 NA other upstream 5219810 36849646 ~ 36851153 (+)
LOC110533788 NA other upstream 5269378 36799376 ~ 36801589 (+)
G883473 om-i other upstream 5775416 36292302 ~ 36295572 (+)
G891133 NA other downstream 904720 42982682 ~ 43109676 (+)
G891188 NA other downstream 1018758 43096720 ~ 43097617 (+)
G891741 NA other downstream 1456354 43534316 ~ 43600230 (+)
G891740 LOC106603170 other downstream 1464504 43542466 ~ 43555517 (+)

Expression


Co-expression Network