LOC110534107 (LOC106603045)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110534107
gene name LOC106603045
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 46765048 ~ 46799754 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>XM_021618780.2
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>TU1017692
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021618780.2 False 4992 mRNA 0.46 5 46765064 46799754
TU1017692 True 1291 lncRNA 0.37 1 46797943 46799233

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110534106 LOC106603046 coding upstream 17322 46732876 ~ 46747726 (+)
LOC110534104 LOC106603047 coding upstream 34321 46721765 ~ 46730727 (+)
LOC110534099 LOC106603050 coding upstream 149351 46611055 ~ 46615697 (+)
LOC110534926 NA coding upstream 155409 46608456 ~ 46609639 (+)
LOC110534098 LOC106603051 coding upstream 169280 46584495 ~ 46595768 (+)
LOC110534109 NA coding downstream 64293 46864047 ~ 46867604 (+)
LOC110534110 LOC106603042 coding downstream 88246 46888000 ~ 46894991 (+)
LOC110534111 LOC106603040 coding downstream 116382 46916136 ~ 46962543 (+)
LOC110534113 LOC106603039 coding downstream 209595 47009349 ~ 47016212 (+)
LOC110533128 LOC106603037 coding downstream 231675 47031429 ~ 47034505 (+)
G894440 NA non-coding upstream 69883 46693019 ~ 46695165 (+)
G894468 NA non-coding upstream 126773 46633297 ~ 46638275 (+)
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G894457 NA non-coding upstream 160572 46604263 ~ 46604476 (+)
G894512 NA non-coding downstream 147 46799901 ~ 46841538 (+)
G894558 NA non-coding downstream 73835 46873589 ~ 46874000 (+)
G894561 NA non-coding downstream 81492 46881246 ~ 46881537 (+)
G894518 NA non-coding downstream 96116 46895870 ~ 46896819 (+)
G894519 NA non-coding downstream 97184 46896938 ~ 46897829 (+)
G894204 LOC100136012 other upstream 647105 46116285 ~ 46117943 (+)
LOC110534056 LOC106603182 other upstream 863237 45898515 ~ 45901940 (+)
LOC110534042 LOC106603097 other upstream 1121492 45622164 ~ 45654911 (+)
LOC110534033 LOC106603099 other upstream 1172739 45553481 ~ 45592329 (+)
G895515 NA other downstream 240760 47040514 ~ 47042783 (+)
LOC110511048 LOC106603033 other downstream 342290 47132135 ~ 47151549 (+)
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G896043 NA other downstream 1109962 47909716 ~ 47910975 (+)

Expression


Co-expression Network