LOC118936698


Basic Information

Item Value
gene id LOC118936698
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 47420827 ~ 47426481 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XR_005034163.1
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>XR_005034164.1
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005034163.1 False 3517 mRNA 0.41 3 47420827 47426481
XR_005034164.1 True 3599 mRNA 0.41 3 47420827 47426481

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110533129 NA coding upstream 822 47409387 ~ 47420005 (+)
LOC110534120 LOC106563662 coding upstream 46255 47259241 ~ 47374572 (+)
LOC110511048 LOC106603033 coding upstream 269483 47132135 ~ 47151549 (+)
LOC110534117 UBE2D2 coding upstream 292854 47123869 ~ 47127973 (+)
LOC110533128 LOC106603037 coding upstream 386322 47031429 ~ 47034505 (+)
LOC110533130 LOC106602987 coding downstream 137 47426618 ~ 47849279 (+)
LOC110534124 LOC106602984 coding downstream 431009 47857490 ~ 47887278 (+)
LOC110534126 LOC106602983 coding downstream 475078 47901559 ~ 47905308 (+)
cfb LOC106602980 coding downstream 510882 47937363 ~ 47950461 (+)
LOC110534131 LOC106602979 coding downstream 536954 47963435 ~ 47987449 (+)
G895724 NA non-coding upstream 16547 47388841 ~ 47404280 (+)
G895687 NA non-coding upstream 36593 47383066 ~ 47384234 (+)
G895709 NA non-coding upstream 77257 47292167 ~ 47343570 (+)
G895717 NA non-coding upstream 114109 47301851 ~ 47306718 (+)
G895663 NA non-coding upstream 196310 47224278 ~ 47224517 (+)
G895845 NA non-coding downstream 96411 47522892 ~ 47545264 (+)
G895839 NA non-coding downstream 98213 47524694 ~ 47597056 (+)
G895856 NA non-coding downstream 178907 47605388 ~ 47616102 (+)
G895862 NA non-coding downstream 179873 47606354 ~ 47614212 (+)
G895863 NA non-coding downstream 180739 47607220 ~ 47613316 (+)
G895658 LOC106603032 other upstream 203756 47216407 ~ 47217071 (+)
G895652 LOC106603032 other upstream 215985 47202925 ~ 47204842 (+)
G895515 NA other upstream 378044 47040514 ~ 47042783 (+)
G894437 LOC106603023 other upstream 720287 46627292 ~ 46700540 (+)
G896043 NA other downstream 483235 47909716 ~ 47910975 (+)
G896217 NA other downstream 808701 48235182 ~ 48235616 (+)
G897244 dach2 other downstream 1249776 48676257 ~ 48677065 (+)
LOC110534184 LOC106563731 other downstream 1851221 49277626 ~ 49282746 (+)
LOC110534189 LOC106602925 other downstream 2003918 49426785 ~ 49432958 (+)

Expression


Co-expression Network