LOC110534217 (LOC106602903)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110534217
gene name LOC106602903
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 50400786 ~ 50442079 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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Function


NR:

description
G protein pathway suppressor 2-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021618938.2 False 4083 mRNA 0.41 12 50400786 50441167
XM_021618937.2 False 4749 mRNA 0.41 12 50400786 50441936
XM_036933323.1 True 4037 mRNA 0.41 12 50400786 50442079

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
tp53 tp53 coding downstream 1098 50387948 ~ 50399688 (-)
slc25a35 slc25a35 coding downstream 47500 50341116 ~ 50353286 (-)
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LOC110534213 LOC106602908 coding downstream 140351 50246298 ~ 50260435 (-)
LOC110534218 LOC106602900 coding upstream 10374 50452453 ~ 50454285 (-)
LOC110534220 LOC106602898 coding upstream 21871 50463950 ~ 50482534 (-)
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LOC110534228 NA coding upstream 279611 50721690 ~ 50767820 (-)
si:ch211-215c18.3 NA coding upstream 511089 50953168 ~ 50962186 (-)
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G899527 NA non-coding downstream 43985 50356340 ~ 50356801 (-)
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G899636 NA non-coding upstream 111635 50553714 ~ 50618858 (-)
G899421 NA other downstream 217998 50182396 ~ 50182788 (-)
G899409 NA other downstream 243884 50156192 ~ 50156902 (-)
LOC110534172 LOC106602940 other downstream 1516711 48881449 ~ 48907973 (-)
G896841 NA other downstream 2411710 47987761 ~ 47989076 (-)
LOC110534118 LOC106603020 other downstream 3167740 47203241 ~ 47234608 (-)
G899727 NA other upstream 278907 50720986 ~ 50721603 (-)
G899739 LOC106602890 other upstream 301079 50743158 ~ 50750233 (-)
G900070 NA other upstream 528684 50970763 ~ 50981750 (-)
G900807 NA other upstream 1013421 51455500 ~ 51455942 (-)

Expression



Co-expression Network