si:ch211-215c18.3


Basic Information

Item Value
gene id si:ch211-215c18.3
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 50953168 ~ 50962186 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036933332.1
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>XM_036933331.1
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036933332.1 False 4812 mRNA 0.39 5 50953168 50961942
XM_036933331.1 True 4648 mRNA 0.39 5 50953168 50962186

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110534228 NA coding downstream 185348 50721690 ~ 50767820 (-)
slc25a15b slc25a15 coding downstream 316120 50626130 ~ 50637048 (-)
LOC110534220 LOC106602898 coding downstream 470634 50463950 ~ 50482534 (-)
LOC110534218 LOC106602900 coding downstream 498883 50452453 ~ 50454285 (-)
LOC110534217 LOC106602903 coding downstream 511089 50400786 ~ 50442079 (-)
LOC110534238 bco2b coding upstream 494910 51457096 ~ 51559902 (-)
LOC110534240 bco2b coding upstream 636441 51598627 ~ 51656987 (-)
adamts15a LOC106602881 coding upstream 1127645 52089831 ~ 52124329 (-)
atf5a LOC106602866 coding upstream 1314145 52276331 ~ 52281912 (-)
phldb1a LOC106602858 coding upstream 1350014 52312200 ~ 52396922 (-)
G899939 NA non-coding downstream 121303 50790721 ~ 50831865 (-)
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G899755 NA non-coding downstream 181717 50771238 ~ 50771451 (-)
G899749 NA non-coding downstream 190795 50762160 ~ 50762373 (-)
G899740 NA non-coding downstream 202327 50750630 ~ 50750841 (-)
G900069 LOC106602888 non-coding upstream 11661 50973847 ~ 50983259 (-)
G900078 NA non-coding upstream 32996 50995182 ~ 50995414 (-)
G900087 NA non-coding upstream 43124 51005310 ~ 51005722 (-)
G900094 NA non-coding upstream 75365 51037551 ~ 51038387 (-)
G900109 NA non-coding upstream 81921 51044107 ~ 51044599 (-)
G899739 LOC106602890 other downstream 202935 50743158 ~ 50750233 (-)
G899727 NA other downstream 231565 50720986 ~ 50721603 (-)
G899421 NA other downstream 770380 50182396 ~ 50182788 (-)
G899409 NA other downstream 796266 50156192 ~ 50156902 (-)
G900070 NA other upstream 8577 50970763 ~ 50981750 (-)
G900807 NA other upstream 493314 51455500 ~ 51455942 (-)
G902519 NA other upstream 1940008 52902194 ~ 52937648 (-)
casp3a LOC106602722 other upstream 2910053 53872239 ~ 53878829 (-)
G903619 primpol other upstream 2917358 53879544 ~ 53883773 (-)

Expression


Co-expression Network