LOC110516209


Basic Information

Item Value
gene id LOC110516209
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 78939438 ~ 78942355 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XR_005034243.1
TCAGTTGATATTTGTTTGATTCAGGTCTGGTCAGTAGTCAGTTgatatttgatccaggtctggtcagTTGATATTTGATCCCGGTCTGGTCAGTAGTCAGTTGATATCTGATCCAGGTCTGGTCAGTAGTCAGTTgatatttgatccaggtctggtcagttgatatttgatccaggtctggtcagtagtcagttgatatttgatccaggtctggtcagttgatatttgatccaggtctggtcagTTGATATTTGATCCATGTCTGGTCAGTTGATATTTGATCCATGTCTGGTCAGTTgatatttgatccaggtctggtcagTAGTCAGTTGATATTTGATCCAGGCCTGGTCAGTTgatatttgatccaggtctggtcagtagtcagttgatatttgatccaggtctggtcagtagtcagttgatatttgatccaggtctggtcagTTGATATTTGATCCAGgtctggtcagtagtcagttgatatttgatccaggtctggtcagTGGTCGGTCAGTCAGTAATGTAACAGTGAAGACATATCTAACAGTGAAAGTcttggacaggacaggaggagtgTGTTGTTTGGAAAAAGGACTTCCCAGAACGTCTGTGATTGTTCTTGTCTCGAAGAacagagtggagagggagagagtgtaggCATGTGTTTGGTCATTTCTCCTCTTCGTTTTGTTCTACTTCCTGTATCACACGGGAACAGCCAATCAGTTCATGCGTTGCAGTAACGATGATGACTAGTGAATAGTCTAGAATCTTCCTCTGTGTTTGGGCTGGTGATGATGACGACGCCCAGGAGAGATGCAGCCCAACCTGAATACGTGTTAGTGTGAGACTGAGCGTTGTGCCACGACAACAACCGCCACTGTGTTCCTGTGGATTAAGGACATCAAGGTATTAATGCTTAGACTTGACGCATGGTTTCATGGGGAATCCATTACCTACGAAGCTATGACAAAGtgtgtgtctcacacacacacacacacacacacactttgacatCACTACCCTTCTGACACACATCCCTCAGCAAATTCAGGTCCTTCAGTTTTAGTGTTTTGTGAGTTTTATTGCTGAAAAACTGTTATTGTTGTGTTATTTCCACATCACTGATATACACCCAGCCCAAAGAATGTAACGGTGGAAGAGACTTAATGTATGTATCTTGtttgactgtgtcccaaatgacaccctatttcctatatagtgcactacgttttgTCCAgagctggtctaaagtagtgcgctatgtgTATGAAACAGGGTGGGACGTAGCCATTCTGCTGTAGAAGAGAAACAGGCTTGTGTAATGAAGTGGTTCAATCATGTCCCATTCAGTGGTATGAGAATCGAGTTCTGAAATTCTACGTTCTGATTCTATGATTCCGTTGTTCCGATGTTACTGTAACAAGCAGCTCTGTTTGGACTATTCTGAATGTTGGACCTGAACCGTGTTTCTTTACTATTGACAGACTGAAACccaactgttatttcaccaatacacactgTGGTGGTTTCTAAAAATCCTGCTAGTTTACTGGTTAAAAACCAGCTCAGAAACCTTACTTACCAGGTAACCTCAACTAGTTTTAATGTACACTTTTTCCAGGTAACTCCAACTAGTTTAATGTACACTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGTACACTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGTACACTTACCGGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGTACACTTAACGGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGTACACTTACCGGGTAATCCCAACTAGTTTACTGTACACTTACCGGGTAACTCCAACTAGTTTTAATGTACACTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGTACACTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGTACATTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTAATGTACACTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGTACACTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGTACATTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGTACATTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTAATGTACACTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGTACATTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTAATGTACATTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTAATGTACACTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTAATGTACACTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGTACACTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGTACATTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTAATGTACACTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTAATGTACATTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGTACATTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGTACATTTACCAGGTAATCCCAACTAGTTTTAATGGGGCTCTGCTGACGTGCATTTCCTCTTCCTGTCACCAGgtgtgtcctccctctctcccaaagCAACATGGGAAACGTAGTGTTTCCTGTATTCTaaacccttctcctccctctctcccaaagCAACATGGGAAACGTAGTGTTTCCTGTATTCTaaacccttctcctccctctctcccaaagCAACATGGGAAACGTAGTGTTTCCTGTATTCTaaacccttctcctccctctctcccaaagCAACATGGGAAACGTAGTGTTTCCTGTATTCTAAACCCTTCTCCTCCCGCTCTCCCAAAGCAACATGGGAAACGTAGTGTTTCCTGTATTCTAAACCCTTCTCCTCCCGCGCTCCCTCGGTCAATATGAAAATAAAACCCGATTTACAAATGTA

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106578948

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005034243.1 True 2852 mRNA 0.41 2 78939438 78942355

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110513597 LOC107093492 coding upstream 3768 78885272 ~ 78937306 (+)
LOC118936788 LOC106591635 coding upstream 58242 78874786 ~ 78881196 (+)
LOC110534603 LOC106602125 coding upstream 123000 78805794 ~ 78816438 (+)
LOC118966658 NA coding upstream 151696 78786758 ~ 78787742 (+)
LOC110534589 LOC106610450 coding upstream 161862 78775880 ~ 78777576 (+)
LOC110517676 NA coding downstream 42009 78984364 ~ 78994842 (+)
LOC118936789 NA coding downstream 52616 78994971 ~ 78995813 (+)
LOC118936790 NA coding downstream 61335 79003589 ~ 79004205 (+)
LOC110515636 LOC105020871 coding downstream 81214 79023569 ~ 79065796 (+)
LOC110513572 LOC106596357 coding downstream 217152 79159507 ~ 79164674 (+)
G927105 NA non-coding upstream 8563 78929146 ~ 78930875 (+)
G927098 NA non-coding upstream 30917 78908122 ~ 78908521 (+)
G927080 LOC106610560 non-coding upstream 85273 78848904 ~ 78854165 (+)
G927077 NA non-coding upstream 105031 78834156 ~ 78834407 (+)
G927109 NA non-coding downstream 9651 78952006 ~ 79021764 (+)
G927117 NA non-coding downstream 22899 78965254 ~ 78967722 (+)
G927124 NA non-coding downstream 57610 78999965 ~ 79001000 (+)
G927550 NA non-coding downstream 125269 79067624 ~ 79067968 (+)
G927061 LOC106602167 other upstream 151875 78775935 ~ 78787563 (+)
LOC110497229 LOC106602251 other upstream 408837 78519650 ~ 78533161 (+)
LOC110510687 LOC106591138 other upstream 1214385 77722229 ~ 77734491 (+)
LOC110534594 LOC106577279 other upstream 1485523 77360360 ~ 77632808 (+)
G926448 LOC105024706 other upstream 1643429 77293833 ~ 77296009 (+)
G927584 NA other downstream 257926 79200281 ~ 79202981 (+)
G927606 NA other downstream 339031 79281386 ~ 79284144 (+)
LOC110514189 LOC106593948 other downstream 655290 79597075 ~ 79601686 (+)
LOC110532970 LOC105020822 other downstream 784690 79727045 ~ 79782057 (+)

Expression


Co-expression Network