LOC118936830


Basic Information

Item Value
gene id LOC118936830
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 82740970 ~ 82780517 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XR_005034283.1
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>TU1058174
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Function

NR:

description
uncharacterized protein LOC103033380

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005034283.1 False 1337 mRNA 0.46 2 82741138 82742592
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TU1058178 True 1033 TUCP 0.48 3 82741434 82742780

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110512972 lias coding upstream 2468 82727415 ~ 82738670 (+)
LOC118936828 wdr19 coding upstream 339898 82316721 ~ 82401240 (+)
LOC118936827 LOC106591767 coding upstream 434413 82261288 ~ 82306725 (+)
LOC110510824 LOC106594418 coding upstream 508162 82212448 ~ 82232976 (+)
LOC118936825 LOC106593007 coding upstream 531804 82173331 ~ 82211022 (+)
LOC118936832 LOC105009164 coding downstream 51061 82793509 ~ 82811450 (+)
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G929302 NA non-coding downstream 6296 82748888 ~ 82749196 (+)
G929304 NA non-coding downstream 17899 82760491 ~ 82761057 (+)
G929306 NA non-coding downstream 22165 82764757 ~ 82765033 (+)
G929307 NA non-coding downstream 24434 82767026 ~ 82767410 (+)
G929267 NA non-coding downstream 31736 82774328 ~ 82775690 (+)
G929159 NA other upstream 431566 82308803 ~ 82309572 (+)
G929305 NA other downstream 19013 82761605 ~ 82762488 (+)
G929370 NA other downstream 292520 83035112 ~ 83035491 (+)
LOC110512947 NA other downstream 843996 83586588 ~ 83639961 (+)
G929316 NA non-coding downstream 32687 82813204 ~ 82813628 (+)
G929323 LOC106592481 non-coding downstream 59182 82839699 ~ 82840188 (+)
G929328 NA non-coding downstream 75690 82856207 ~ 82857225 (+)
G929341 NA non-coding downstream 104223 82884740 ~ 82887716 (+)
G929346 NA non-coding downstream 171573 82952090 ~ 82952710 (+)
LOC110518749 LOC106592297 other downstream 1113077 83893530 ~ 83968790 (+)
G929113 NA other upstream 561008 82179786 ~ 82180426 (+)

Expression


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