LOC118936862


Basic Information

Item Value
gene id LOC118936862
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 86257257 ~ 86258475 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XR_005034311.1
aggtgtgggacagacagtaacagacagtaaattaacgctgaggtgtgggacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtaacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtAAATTAACACTGAGGTGTGGAACAGACAATAACAGACAGTAAATTAACACTGAGGTAtgggacagacagtaacagacagtaaattaACACTGAGGTGTGGAACAGACAATAACAGACAGTAAATTAACACTGAGGTAtgggacagacagtaacagacagtaaattaacactgaggtatgggacagacagtaacagacagtaaattaacactgaggtgtggaacagacagtaacagacagtaaattaacactgaggtgagggacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtaacagacagtaaattaACACTGAGGTGTGGAACAGACAATAACAGACAGTAAATTAACACTGAGGTAtgggacagacagtaacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtaacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtaacagacagtaaattaACACTGAGTTGAGGGACAGACAGTAAATTAACACTGAGGTGAGGGACAGACAGTAAATTAACGCTGAGGTGAGGGACAGACAGTAAATTAACGCtgaggtgtgggacagacagtaacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtaacagaca
>XR_005034312.1
aggtgtgggacagacagtaacagacagtaaattaacgctgaggtgtgggacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtaacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtAAATTAACACTGAGGTGTGGAACAGACAATAACAGACAGTAAATTAACACTGAGGTAtgggacagacagtaacagacagtaaattaACACTGAGGTGTGGAACAGACAATAACAGACAGTAAATTAACACTGAGGTAtgggacagacagtaacagacagtaaattaacactgaggtatgggacagacagtaacagacagtaaattaacactgaggtgtggaacagacagtaacagacagtaaattaacactgaggtgagggacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtaacagacagtaaattaACACTGAGGTGTGGAACAGACAATAACAGACAGTAAATTAACACTGAGGTAtgggacagacagtaacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtaacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtaacagacagtaaattaACACTGAGTTGAGGGACAGACAGTAAATTAACACTGAGgtgtgggacagacagtaacagacagtaaattaacactgaggtgtgggacagacagtaacagacagta

Function

NR:

description
PREDICTED: ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005034311.1 False 826 mRNA 0.42 2 86257257 86258472
XR_005034312.1 True 769 mRNA 0.41 3 86257257 86258475

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110513338 LOC106595035 coding upstream 48066 86201044 ~ 86209191 (+)
LOC118936859 LOC106595358 coding upstream 74731 86152003 ~ 86182526 (+)
LOC110528614 LOC106592313 coding upstream 239682 86008932 ~ 86017575 (+)
LOC118966669 LOC106591460 coding upstream 248457 85994536 ~ 86008800 (+)
LOC110528615 LOC106597603 coding upstream 300165 85951030 ~ 85957092 (+)
LOC118936863 LOC104951401 coding downstream 29106 86287581 ~ 86323830 (+)
LOC118936864 NA coding downstream 75864 86334061 ~ 86336728 (+)
LOC110514239 LOC106594008 coding downstream 110344 86368819 ~ 86395066 (+)
LOC118936865 NA coding downstream 136718 86395193 ~ 86396534 (+)
LOC118936866 NA coding downstream 146982 86405457 ~ 86409872 (+)
G932013 NA non-coding upstream 40089 86215871 ~ 86217168 (+)
G932034 NA non-coding upstream 64965 86190467 ~ 86192292 (+)
G932027 NA non-coding upstream 104222 86152795 ~ 86153035 (+)
G932026 NA non-coding upstream 104640 86152387 ~ 86152617 (+)
G932055 NA non-coding downstream 22372 86280847 ~ 86281783 (+)
G932056 NA non-coding downstream 32909 86291384 ~ 86293912 (+)
G932061 NA non-coding downstream 55870 86314345 ~ 86314550 (+)
G932062 NA non-coding downstream 56959 86315434 ~ 86315737 (+)
G932063 NA non-coding downstream 74155 86332630 ~ 86333257 (+)
LOC118936495 LOC106594836 other upstream 354645 85900556 ~ 85920664 (+)
LOC118966668 LOC106592313 other upstream 362520 85893094 ~ 85950607 (+)
G932184 NA other downstream 184575 86441024 ~ 86475840 (+)
LOC110518842 tbc1d1 other downstream 465462 86704406 ~ 86830606 (+)
LOC110511479 klhl5 other downstream 739311 86997786 ~ 87054035 (+)
LOC110516832 wdr19 other downstream 860607 87057752 ~ 87129649 (+)
G932422 NA other downstream 937044 87195519 ~ 87288556 (+)

Expression


Co-expression Network