LOC118936864


Basic Information

Item Value
gene id LOC118936864
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 86334061 ~ 86336728 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XR_005034313.1
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>TU1062191
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>TU1062192
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>TU1062193
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>TU1062194
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Function

NR:

description
unnamed protein product, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005034313.1 False 759 mRNA 0.54 4 86334339 86336530
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TU1062194 True 1269 lncRNA 0.51 6 86334061 86336728

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118936863 LOC104951401 coding upstream 10509 86287581 ~ 86323830 (+)
LOC110514691 uba6 coding upstream 48691 86230780 ~ 86285648 (+)
LOC118936862 NA coding upstream 75864 86257257 ~ 86258475 (+)
LOC110513338 LOC106595035 coding upstream 125148 86201044 ~ 86209191 (+)
LOC118936859 LOC106595358 coding upstream 151813 86152003 ~ 86182526 (+)
LOC110514239 LOC106594008 coding downstream 32289 86368819 ~ 86395066 (+)
LOC118936865 NA coding downstream 58663 86395193 ~ 86396534 (+)
LOC118936866 NA coding downstream 68927 86405457 ~ 86409872 (+)
LOC118936868 NA coding downstream 238935 86575465 ~ 86671952 (+)
pgm2 pgm2 coding downstream 340060 86676590 ~ 86696929 (+)
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G932069 NA non-coding downstream 8013 86344543 ~ 86344842 (+)
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G932071 NA non-coding downstream 11755 86348285 ~ 86349033 (+)
LOC110528614 LOC106592313 other upstream 321798 86008932 ~ 86017575 (+)
LOC110528615 LOC106597603 other upstream 381666 85951030 ~ 85957092 (+)
LOC118936495 LOC106594836 other upstream 431727 85900556 ~ 85920664 (+)
LOC118966668 LOC106592313 other upstream 439602 85893094 ~ 85950607 (+)
G932184 NA other downstream 106520 86441024 ~ 86475840 (+)
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LOC110511479 klhl5 other downstream 661256 86997786 ~ 87054035 (+)
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Expression


Co-expression Network