XLOC_002765 (inpp5kb)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_002765
gene name inpp5kb
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 24302433 ~ 24319526 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00005118
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>TCONS_00005120
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>TCONS_00005119
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>TCONS_00005121
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Function

symbol description
inpp5kb Predicted to enable inositol bisphosphate phosphatase activity; phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate 5-phosphatase activity; and phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity. Acts upstream of or within camera-type eye development and skeletal muscle fiber development. Predicted to be active in endoplasmic reticulum; plasma membrane; and ruffle. Human ortholog(s) of this gene implicated in congenital muscular dystrophy with cataracts and intellectual disability. Orthologous to human INPP5K (inositol polyphosphate-5-phosphatase K).

GO:

id name namespace
GO:0045719 negative regulation of glycogen biosynthetic process biological_process
GO:0048741 skeletal muscle fiber development biological_process
GO:0033137 negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation biological_process
GO:0046855 inositol phosphate dephosphorylation biological_process
GO:0043010 camera-type eye development biological_process
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GO:0034485 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate 5-phosphatase activity molecular_function
GO:0016787 hydrolase activity molecular_function
GO:0016312 inositol bisphosphate phosphatase activity molecular_function
GO:0004439 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-100408-3 Predicted to enable inositol bisphosphate phosphatase activity; phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate 5-phosphatase activity; and phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity. Acts upstream of or within camera-type eye development and skeletal muscle fiber development. Predicted to be active in endoplasmic reticulum; plasma membrane; and ruffle. Human ortholog(s) of this gene implicated in congenital muscular dystrophy with cataracts and intellectual disability. Orthologous to human INPP5K (inositol polyphosphate-5-phosphatase K).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000078618

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00005118 False 3682 mRNA 0.39 13 24302433 24317274
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TCONS_00005119 False 3508 mRNA 0.39 12 24302433 24318538
TCONS_00005121 True 1467 mRNA 0.46 13 24304534 24319526

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_002764 NA coding downstream 253228 23780542 ~ 24049205 (-)
XLOC_002763 NA coding downstream 752551 23548976 ~ 23549882 (-)
XLOC_002762 NA coding downstream 782190 23518061 ~ 23520243 (-)
XLOC_002761 NA coding downstream 783218 23513122 ~ 23519215 (-)
XLOC_002760 cadm2a coding downstream 923287 23216678 ~ 23379146 (-)
XLOC_002766 pitpnab coding upstream 4225 24323751 ~ 24371312 (-)
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XLOC_002768 CU467963.2 coding upstream 63740 24383266 ~ 24383381 (-)
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XLOC_002779 NA non-coding upstream 514170 24833696 ~ 24852525 (-)

Expression


Co-expression Network