G844865


Basic Information

Item Value
gene id G844865
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 880246 ~ 894219 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU962132
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>TU962134
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>TU962135
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>TU962138
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>TU962141
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>TU962142
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>TU962139
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Function

NR:

description
PREDICTED: GTPase IMAP family member 8-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU962132 False 1259 lncRNA 0.36 3 880246 888125
TU962134 False 1930 lncRNA 0.35 6 880246 894219
TU962135 False 1742 lncRNA 0.35 4 880246 894219
TU962138 False 1743 lncRNA 0.35 4 880246 894219
TU962141 False 1306 lncRNA 0.35 5 880246 894219
TU962142 False 1495 lncRNA 0.35 6 880246 894219
TU962139 True 1022 lncRNA 0.35 3 886268 894219

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110534824 LOC106604036 coding downstream 56383 792950 ~ 823863 (-)
mis18a LOC106604044 coding downstream 154753 697530 ~ 725493 (-)
sodc sodc coding downstream 255332 617477 ~ 624914 (-)
LOC110533253 bach1 coding downstream 267215 606394 ~ 613031 (-)
LOC118966673 NA coding downstream 690963 185389 ~ 189283 (-)
LOC118966679 LOC106594186 coding upstream 22069 916288 ~ 922345 (-)
LOC118966678 NA coding upstream 28136 922355 ~ 925356 (-)
LOC118936903 NA coding upstream 251641 1145860 ~ 1212061 (-)
LOC110533260 LOC106604035 coding upstream 374411 1268630 ~ 1273544 (-)
LOC110518095 LOC106604029 coding upstream 383193 1277329 ~ 1347922 (-)
G844859 LOC106604021 non-coding downstream 10449 866424 ~ 869797 (-)
G844823 NA non-coding downstream 57192 822763 ~ 823054 (-)
G844820 NA non-coding downstream 67641 812339 ~ 812605 (-)
G844816 NA non-coding downstream 88343 789810 ~ 791903 (-)
G844870 NA non-coding upstream 2734 896953 ~ 897162 (-)
G844937 NA non-coding upstream 58846 953065 ~ 954581 (-)
G844968 NA non-coding upstream 124553 1018772 ~ 1019917 (-)
G844976 NA non-coding upstream 133921 1028140 ~ 1029996 (-)
G845011 NA non-coding upstream 141035 1035254 ~ 1107144 (-)
G844847 NA other downstream 33494 844673 ~ 846752 (-)
G844794 NA other downstream 97508 782024 ~ 782738 (-)
G844686 NA other downstream 306308 571525 ~ 573938 (-)
LOC110533226 LOC107554284 other downstream 782551 92131 ~ 97728 (-)
heatr6 heatr6 other downstream 815546 44407 ~ 91388 (-)
G844975 NA other upstream 131435 1025654 ~ 1027442 (-)
G845133 NA other upstream 340328 1234547 ~ 1235708 (-)
LOC110533263 NA other upstream 694145 1586498 ~ 1590637 (-)
G845570 NA other upstream 755721 1649940 ~ 1651993 (-)

Expression


Co-expression Network