G845023 (LOC106604038)


Basic Information

Item Value
gene id G845023
gene name LOC106604038
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 1056774 ~ 1084976 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

NR:

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TU962380 True 1482 lncRNA 0.45 3 1056774 1084976
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118966678 NA coding downstream 131418 922355 ~ 925356 (-)
LOC118966679 LOC106594186 coding downstream 134429 916288 ~ 922345 (-)
LOC118966677 NA coding downstream 165506 886116 ~ 891268 (-)
LOC118966676 NA coding downstream 171405 879647 ~ 885369 (-)
LOC110534824 LOC106604036 coding downstream 232911 792950 ~ 823863 (-)
LOC118936903 NA coding upstream 60884 1145860 ~ 1212061 (-)
LOC110533260 LOC106604035 coding upstream 183654 1268630 ~ 1273544 (-)
LOC110518095 LOC106604029 coding upstream 192436 1277329 ~ 1347922 (-)
LOC110533263 NA coding upstream 501522 1586498 ~ 1590637 (-)
LOC110534825 nbea coding upstream 512373 1597349 ~ 1880906 (-)
G844976 NA non-coding downstream 26778 1028140 ~ 1029996 (-)
G844968 NA non-coding downstream 36857 1018772 ~ 1019917 (-)
G844937 NA non-coding downstream 102193 953065 ~ 954581 (-)
G844870 NA non-coding downstream 159612 896953 ~ 897162 (-)
G844865 NA non-coding downstream 162555 880246 ~ 894219 (-)
G845040 NA non-coding upstream 16162 1101138 ~ 1101431 (-)
G845047 NA non-coding upstream 24210 1109186 ~ 1109392 (-)
G845052 NA non-coding upstream 28113 1113089 ~ 1113315 (-)
G845053 NA non-coding upstream 28734 1113710 ~ 1113917 (-)
G845055 NA non-coding upstream 30951 1115927 ~ 1116164 (-)
G844975 NA other downstream 29332 1025654 ~ 1027442 (-)
G844866 LOC106591684 other downstream 166016 884160 ~ 890758 (-)
G844847 NA other downstream 210022 844673 ~ 846752 (-)
G844794 NA other downstream 274036 782024 ~ 782738 (-)
G845133 NA other upstream 149571 1234547 ~ 1235708 (-)
G845570 NA other upstream 564964 1649940 ~ 1651993 (-)
G845683 NA other upstream 881650 1966626 ~ 1967072 (-)
G845769 NA other upstream 1008259 2093235 ~ 2098359 (-)

Expression

G845023(LOC106604038) Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 30.
End of interactive chart.

G845023(LOC106604038) Expression in each Bioproject

Bar chart with 21 bars.
G845023(LOC106604038) Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 3000.
End of interactive chart.

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