G858148


Basic Information

Item Value
gene id G858148
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 15414440 ~ 15434748 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU977887
ggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttagggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatgggatgtttctcagtttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcagtttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttagggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatgggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcgggttatggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgttaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcagtttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcagtttggtctgtcaggttatggggatgtttctcagtttggtctgtcaggttgtgg
>TU977901
ggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttagggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatgggatgtttctcagtttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcagtttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttagggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatgggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcgggt
>TU977883
attttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctttcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttagggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatgggatgtttctcagtttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcat
>TU977898
tggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcattttggtctgtcaggttagggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttagggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatgggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcagtttgttctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatgggatgtttctcagtttgttctgtcagtttatggggatgtttctcattttggtctgtcaggttatggggatgtttctcattttggtctg

Function

NR:

description
PREDICTED: PX domain-containing protein kinase-like protein

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU977887 False 1413 TUCP 0.42 2 15414440 15416864
TU977901 False 948 TUCP 0.42 2 15414440 15417087
TU977883 False 360 lncRNA 0.42 2 15417559 15425500
TU977898 True 484 TUCP 0.42 2 15425159 15434748

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ube2b ube2b coding upstream 231654 15171314 ~ 15185905 (+)
tcf7 skp1 coding upstream 287649 15066890 ~ 15138685 (+)
LOC110533377 LOC106603825 coding upstream 987273 14279497 ~ 14430286 (+)
LOC110533378 LOC106603820 coding upstream 1142361 14224203 ~ 14275198 (+)
LOC118936695 LOC106603828 coding upstream 1193512 14216996 ~ 14224047 (+)
LOC110533411 LOC106603809 coding downstream 74133 15499633 ~ 15523339 (+)
LOC110533412 NA coding downstream 118270 15543770 ~ 15607192 (+)
sytl2a sytl2 coding downstream 190209 15615709 ~ 15662249 (+)
LOC110533414 LOC106603806 coding downstream 237985 15663485 ~ 15666551 (+)
LOC110533415 LOC106603804 coding downstream 255712 15681212 ~ 15993975 (+)
G858062 NA non-coding upstream 8231 15407864 ~ 15409328 (+)
G858136 NA non-coding upstream 40460 15376027 ~ 15377099 (+)
G858113 NA non-coding upstream 93613 15321045 ~ 15323946 (+)
G858082 NA non-coding upstream 176833 15239077 ~ 15240726 (+)
G858078 NA non-coding upstream 182861 15233568 ~ 15234698 (+)
LOC110534855 LOC106603811 non-coding downstream 50382 15208176 ~ 15482337 (+)
G858183 NA non-coding downstream 55931 15481431 ~ 15481887 (+)
G858190 NA non-coding downstream 61114 15486614 ~ 15486946 (+)
G858193 NA non-coding downstream 62650 15488150 ~ 15488398 (+)
G858194 NA non-coding downstream 63149 15488649 ~ 15489008 (+)
G856353 NA other upstream 1642977 13773887 ~ 13774582 (+)
G855498 NA other upstream 2396527 13016534 ~ 13021032 (+)
G855483 LOC106603848 other upstream 2427717 12985031 ~ 12989842 (+)
zcchc10 zcchc10 other upstream 2921304 12485809 ~ 12497278 (+)
G858203 NA other downstream 100889 15526389 ~ 15526807 (+)
G858416 NA other downstream 448529 15874029 ~ 15878692 (+)
G860453 NA other downstream 1676415 17101915 ~ 17102467 (+)
G860570 NA other downstream 1900740 17326240 ~ 17326929 (+)
G860846 NA other downstream 2070112 17495612 ~ 17499171 (+)

Expression


Co-expression Network