G882013


Basic Information

Item Value
gene id G882013
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 34808602 ~ 34811529 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1003587
tacaatatgggagacaatatgggctacaatatgggatacaatatgggctacaatatgggctacaatatgggatacaatatgggctacaatatgggctacaatatgggctacaatatgggatacaatatgggctacaatatgggatacaatatgggctacaatatgggctacaatatgggatacaatatgggatacaatatgggatacaatatggactacaatatggactacaatatggactacaatatgggatacaatataggatacaatatgggatacaatatggaatacaatatgggatacaatatggactacaatatgggatacaatatgggatacaatatgggatacaatatggactacaatatgggatacaatatgggatacaatatgggatacaatatgaactacaatatgggatacaatatggactacaatatgggatacaatatggactacaatatgggatacaatatggactacaatatggaatacaatatgggatacaatatgggagacaatatgggctacaatatggactacaatatgggatacaatatgggatacaatatgggatacaatatgggctacaatatgggatacaatatggactacaatatgggatacaatatggactacaatatggactacaatatgggatacaatatgggagacaatatgggctacaatatggactacaatatgggatacaatatggactacaatatggactacaatatggactacaatatgggctacaatatggcaatatgggatacaatatggactacaatatggactacaatatgggattcaatatg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1003587 True 821 TUCP 0.35 2 34808602 34811529

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110533717 LOC106603590 coding upstream 67151 34722868 ~ 34741451 (+)
LOC110533716 LOC106603589 coding upstream 133725 34622408 ~ 34674877 (+)
slc25a14 LOC106567890 coding upstream 189632 34610068 ~ 34618970 (+)
LOC110533713 LOC106603586 coding upstream 219293 34546928 ~ 34589309 (+)
taf9 LOC106603584 coding upstream 273041 34528720 ~ 34535561 (+)
LOC110533719 LOC106603618 coding downstream 134197 34945666 ~ 34949276 (+)
LOC110533722 LOC106603594 coding downstream 160288 34971817 ~ 34975086 (+)
LOC110533726 LOC105023919 coding downstream 239409 35050938 ~ 35063464 (+)
gltpd2 LOC106603604 coding downstream 386422 35197951 ~ 35203782 (+)
mogat3b LOC106603399 coding downstream 496224 35307753 ~ 35321801 (+)
G882011 NA non-coding upstream 820 34807411 ~ 34807782 (+)
G881690 NA non-coding upstream 15696 34792618 ~ 34792906 (+)
G881689 NA non-coding upstream 16927 34791447 ~ 34791675 (+)
G881686 NA non-coding upstream 19305 34788952 ~ 34789297 (+)
G881679 NA non-coding upstream 28703 34779607 ~ 34779899 (+)
G882028 NA non-coding downstream 20089 34831618 ~ 34831874 (+)
G882030 NA non-coding downstream 23204 34834733 ~ 34834959 (+)
G882086 NA non-coding downstream 68972 34880501 ~ 34880720 (+)
G882112 NA non-coding downstream 103862 34915391 ~ 34915604 (+)
G882121 NA non-coding downstream 121417 34932946 ~ 34933149 (+)
G881536 NA other upstream 314501 34489820 ~ 34494101 (+)
LOC110534915 rps17 other upstream 319888 34486712 ~ 34488757 (+)
rnasekb rnasek other upstream 338224 34458769 ~ 34472268 (+)
LOC110533705 LOC106603578 other upstream 365245 34437126 ~ 34443357 (+)
G882202 NA other downstream 264069 35075598 ~ 35075967 (+)
G882225 NA other downstream 295933 35107462 ~ 35109391 (+)
G882265 NA other downstream 349819 35161348 ~ 35163506 (+)
G882300 NA other downstream 413568 35225097 ~ 35264333 (+)

Expression


Co-expression Network