G884398


Basic Information

Item Value
gene id G884398
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 36756002 ~ 36779726 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1006363
gtacagaatgttagtgtgtacagattgttagtgtgtacagattgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtagagattgttagtgtgtacagattgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtacagattgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtacagattgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtgcagattgttagtgtgtacagagtgttagtgtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtacaaaTTGTTAGTGTggacagattgttagtgtgttagtgtgtacagattgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtacagattgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtacagattgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgcacagagtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtaccgagtgtttgtgtgtacagagtgttagtgtgtacagagtgttcgtgtgtacagaGTGttcgtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagaGTGTTAGTGTTTACatggtgttagtgtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgaacagattgttagtgtgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtacagattgttagtgtgtacagattgttaatgtgttagtgtgtacagattgttagtgtgtacagagtgttagtgtgttagtgtgtacagattgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtatgtacagattgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagagtgtccgtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtttacagagtgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagattgttagtgtgtacagattgttagtgtgtacagattgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagatttttagtgtgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagattgttagtgtgttagtgtgtacagagtgttagtgtgttagtgtgtactgaGTGTTAGTGtctacagagtgttagtgtgtaaatgtgtacagagtgttagtgtgttagtgtgtactgaGTGTTAGTTTGTTAGTGTGTGCAGAGTGTTAgtttgttagtgtgtacagagtgttagtttgttagtgtgtacagagtgtacagagtgttagtttgttagtgtgtacagagtgttagtgtgtacagagtgttagtttgttagtgtgtacagagtgttagtgtgttagtgtgtacatgtaacggatgtgaaacggctagtttagttagcagtgtgcggtaaatagcgtttcaatcggtgacgtcacttgctctgagac

Function

NR:

description
oxysterol-binding protein-related protein 10-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1006363 True 1769 lncRNA 0.38 6 36756002 36779726

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110533103 tagl2 coding downstream 9312 36733716 ~ 36746690 (-)
LOC110533780 LOC106603359 coding downstream 44073 36704447 ~ 36711929 (-)
LOC110533101 LOC106603363 coding downstream 73099 36672252 ~ 36682903 (-)
scn4bb LOC106603364 coding downstream 90285 36652707 ~ 36665717 (-)
tmprss13b LOC106603367 coding downstream 120561 36618131 ~ 36635441 (-)
LOC110533783 LOC106603358 coding upstream 1208 36780934 ~ 36785487 (-)
LOC110533786 LOC106603354 coding upstream 17003 36796729 ~ 36799658 (-)
LOC110533787 LOC106603353 coding upstream 22470 36802196 ~ 36806013 (-)
LOC110533789 LOC106603352 coding upstream 56693 36836419 ~ 36851211 (-)
LOC110533791 LOC106603351 coding upstream 75591 36855317 ~ 36876229 (-)
G884423 NA non-coding downstream 13959 36740710 ~ 36742043 (-)
G884417 NA non-coding downstream 23053 36732718 ~ 36732949 (-)
G884410 NA non-coding downstream 32461 36723296 ~ 36723541 (-)
G884409 NA non-coding downstream 33097 36722551 ~ 36722905 (-)
G884402 NA non-coding downstream 53230 36702553 ~ 36702772 (-)
G884519 NA non-coding upstream 142440 36922166 ~ 36922366 (-)
G884542 NA non-coding upstream 216766 36996492 ~ 37038509 (-)
G884653 NA non-coding upstream 332425 37112151 ~ 37112932 (-)
sdhaf1 sdhaf1 non-coding upstream 339929 37119655 ~ 37123249 (-)
G884705 NA non-coding upstream 476161 37255887 ~ 37256086 (-)
G883754 NA other downstream 363475 36391103 ~ 36392527 (-)
G883753 NA other downstream 365088 36389997 ~ 36390914 (-)
G883128 NA other downstream 875051 35880524 ~ 35880951 (-)
G882971 rb1 other downstream 1156917 35598317 ~ 35599085 (-)
G884736 NA other upstream 537191 37316917 ~ 37318864 (-)
LOC110533823 LOC106603321 other upstream 818907 37518096 ~ 37704039 (-)
G885767 NA other upstream 1459224 38238950 ~ 38240559 (-)
rpl36a LOC106568029 other upstream 2403972 39183698 ~ 39185578 (-)
G887329 NA other upstream 2437587 39217313 ~ 39217738 (-)

Expression


Co-expression Network