G895863


Basic Information

Item Value
gene id G895863
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 47607220 ~ 47613316 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1019309
ctactgtatgtgttgtaattagagaggctactctgtgagttataattagagaggctactgtatgtgttgtaattagaggcctactgtatgtgtcgtaattagaggcctactgtatgtgtcgtaatgagaggcctactgtatgtgttgtaattagcgaggctactgtatgtgttgtaattagaggctactgtatgtgttatagttagaggttaatgtatgtgttgtaattagagagcctactaaatgtgttgtaatgagaggcctactgtatgtgtcgtaatgagaggcctactgttggtcttgtaattagaggctactgtatgtgttgtaattagcgagactactgtatgtgttgtaattagcgaggctactgtatgtgttgtaattagaggctactgtatgtgttatagttagtgaggttaatgtatgtgctgtaattagagaggctactaaatgtgttataattagagaggctactgtatgtgttgtaattagagaggctactgaatgtgttataattacagaggctgctgtatgtgttgtaattagagaggctactgtatgtgatgtaattagagaggctactgtatgtgttgtaattatagaatactgtatgtgttgtaattagaggctactgtatgtgttgtaattagagaggctacttactgtatgtattgtaatgagaagcctactgtatgtgtcgtaattagaggctactgtatgtgttgtaattagcgaggttactgtatgtgttgtaattagaggctactgtatgtgttgtaattagataggctactgtatgtgttgtaattagagcctactgtatgtgttgtaatttgagaggctactgtatgtgttatagtttgagaggttaatgtatgtgttatagttagtgaggttaatgtatgtgctgtaattagagaggctactaaatgtgttgtaattagacaGGCTACTGTATTTGTTGTACTTagaggctactctgtgttataattagagaggctactgtatgtgttgtaattagagaggctactgaatgtgttataattacagagactgctgtatgtgttgtaattagaggctacagtatgtgttgtaattagagaggctactatatgtgttgtaattagagaggctactgtatgtgttgtaattagaggggttactgtatgtgttataattagagaagctactgtatgtgttaaaattagagaagctactgaatgttttgtaattagagaggctactgtatgtgttgtaaatagaggctactgtatgttttataattagagcgtctactgtatgtgttgtaatgagacgcctactgtatgtgttataataaGAGGACACTGTATGTggtgtaattagagaggctactgtatgtgttgtaattagaggctaatctgtgttataattagagaggctacggtatgtgttgtaattagaaaggctactgaatgtgttataattacagaggctactgtatgtgttgtaattagagaggctactgtatgtgctgtaattagagaggctactgaatgggttgtaattacagaggctactgtatgtgttgtaattagagtctactgtatgtgttgtaaatagagaggctactgtatgttttataattagagagtctactgtatgtatgtgttataattagag

Function

NR:

description
PREDICTED: cysteine-rich, acidic integral membrane protein-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1019309 True 1665 lncRNA 0.36 2 47607220 47613316

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118936698 NA coding upstream 180739 47420827 ~ 47426481 (+)
LOC110533129 NA coding upstream 187215 47409387 ~ 47420005 (+)
LOC110534120 LOC106563662 coding upstream 232648 47259241 ~ 47374572 (+)
LOC110511048 LOC106603033 coding upstream 455876 47132135 ~ 47151549 (+)
LOC110534117 UBE2D2 coding upstream 479247 47123869 ~ 47127973 (+)
LOC110534124 LOC106602984 coding downstream 244174 47857490 ~ 47887278 (+)
LOC110534126 LOC106602983 coding downstream 288243 47901559 ~ 47905308 (+)
cfb LOC106602980 coding downstream 324047 47937363 ~ 47950461 (+)
LOC110534131 LOC106602979 coding downstream 350119 47963435 ~ 47987449 (+)
rin1a LOC106602976 coding downstream 408742 48022058 ~ 48029576 (+)
G895839 NA non-coding upstream 10164 47524694 ~ 47597056 (+)
G895845 NA non-coding upstream 61956 47522892 ~ 47545264 (+)
G895724 NA non-coding upstream 202940 47388841 ~ 47404280 (+)
G895687 NA non-coding upstream 222986 47383066 ~ 47384234 (+)
G895717 NA non-coding upstream 300502 47301851 ~ 47306718 (+)
G895855 NA non-coding downstream 979 47614295 ~ 47618736 (+)
G896044 NA non-coding downstream 293923 47907239 ~ 47909591 (+)
G896098 NA non-coding downstream 345148 47958464 ~ 47958684 (+)
G896052 NA non-coding downstream 374401 47987717 ~ 47989065 (+)
G896056 NA non-coding downstream 375817 47989133 ~ 47989348 (+)
G895658 LOC106603032 other upstream 390149 47216407 ~ 47217071 (+)
G895652 LOC106603032 other upstream 402378 47202925 ~ 47204842 (+)
G895515 NA other upstream 564437 47040514 ~ 47042783 (+)
G894437 LOC106603023 other upstream 906680 46627292 ~ 46700540 (+)
G896043 NA other downstream 296400 47909716 ~ 47910975 (+)
G896217 NA other downstream 621866 48235182 ~ 48235616 (+)
G897244 dach2 other downstream 1062941 48676257 ~ 48677065 (+)
LOC110534184 LOC106563731 other downstream 1664386 49277626 ~ 49282746 (+)
LOC110534189 LOC106602925 other downstream 1817083 49426785 ~ 49432958 (+)

Expression


Co-expression Network