XLOC_002816


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_002816
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 27157937 ~ 27162145 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00006063
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>TCONS_00006062
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Function

GO:

id name namespace
GO:0010133 proline catabolic process to glutamate biological_process
GO:0009065 glutamine family amino acid catabolic process biological_process
GO:0006560 proline metabolic process biological_process
GO:0006562 proline catabolic process biological_process
GO:0050662 obsolete coenzyme binding molecular_function
GO:0004657 proline dehydrogenase activity molecular_function

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00006063 False 3980 lncRNA 0.36 2 27157937 27162145
TCONS_00006062 True 3903 lncRNA 0.36 2 27157937 27162145

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_002815 cnih2 coding downstream 108767 27028019 ~ 27049170 (-)
XLOC_002814 uqcc3 coding downstream 148353 27006266 ~ 27009584 (-)
XLOC_002813 NA coding downstream 155323 27000562 ~ 27002614 (-)
XLOC_002812 zgc:193742 coding downstream 158441 26991805 ~ 26999496 (-)
XLOC_002811 MRPL49 coding downstream 168062 26987108 ~ 26989875 (-)
XLOC_002817 BX248510.3 coding upstream 7811 27169956 ~ 27170072 (-)
XLOC_002818 auts2a coding upstream 20559 27182704 ~ 27741809 (-)
XLOC_002819 AL844197.1 coding upstream 252101 27414246 ~ 27414362 (-)
XLOC_002820 ints2 coding upstream 815228 27977373 ~ 28028999 (-)
XLOC_002821 med13a coding upstream 867433 28029578 ~ 28118035 (-)
XLOC_002809 NA non-coding downstream 255632 26901272 ~ 26902305 (-)
XLOC_002808 CR545465.2 non-coding downstream 262861 26892567 ~ 26895076 (-)
XLOC_002807 NA non-coding downstream 285524 26836836 ~ 26872413 (-)
XLOC_002802 NA non-coding downstream 710766 26441052 ~ 26447171 (-)
XLOC_002823 NA non-coding upstream 1035771 28197916 ~ 28291989 (-)
XLOC_002824 NA non-coding upstream 1084690 28246835 ~ 28248743 (-)
XLOC_002825 CR392341.5 non-coding upstream 1130698 28292843 ~ 28292959 (-)

Expression


Co-expression Network