G925034


Basic Information

Item Value
gene id G925034
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 74718249 ~ 74719101 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1052311
tggtcacatacacatggttatcagatgttaatggtcacatacacatggttatcagatgttaatggtcacatacacatggttatcagatgttaatggtcacatacacatggttagcagatgttaatggtcacatacacatggttatcagatgttaatggtcacatacacatggttatcagatgttaatggtcatatacacatggttagcagatgttaatggtcacatacacatggttagcagatgttaatggtcacatggttagcagatgttaatggtcacatacacatggttatcagatgttaatggtcacatacacatggttatcagatgttaatggtcacatacacatggttagcagatgttaatggtcacatacacatggttagcagatgttaatggtcacatggttagcagatgttaatggtcacatggttagcagatgttaatggtcacatacacatggttagcagatgttaatggtcacatacacatggttagcagatgttaatggtcacatggttagcagatgttaatggtcacatggttagcagatgttaatggtcacatggttagcagatgttaatggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttatcagatgttaatggtcacatacacatggttagcagatgttaatggtcacat

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1052311 True 686 lncRNA 0.38 3 74718249 74719101

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118936766 NA coding downstream 10525 74696063 ~ 74707724 (-)
LOC118936765 LOC106592562 coding downstream 41423 74674780 ~ 74676826 (-)
LOC118966653 NA coding downstream 604632 74112748 ~ 74113617 (-)
LOC118936764 LOC106602208 coding downstream 609838 74093187 ~ 74108411 (-)
LOC118936763 LOC106602222 coding downstream 625601 74079315 ~ 74092648 (-)
LOC110497259 NA coding upstream 39588 74758689 ~ 74760648 (-)
LOC110518241 LOC106592562 coding upstream 46887 74765988 ~ 74768163 (-)
LOC110511351 LOC106597013 coding upstream 106085 74825186 ~ 74877445 (-)
LOC118936768 NA coding upstream 175633 74894734 ~ 74910153 (-)
LOC110517287 LOC106601385 coding upstream 197255 74890707 ~ 74932952 (-)
G924995 NA non-coding downstream 64646 74652525 ~ 74653603 (-)
G924997 NA non-coding downstream 66892 74646413 ~ 74651357 (-)
G924587 NA non-coding downstream 154234 74563612 ~ 74564015 (-)
G924487 NA non-coding downstream 233007 74399317 ~ 74485242 (-)
G924490 NA non-coding downstream 313731 74398647 ~ 74404518 (-)
G925041 NA non-coding upstream 13649 74732750 ~ 74782722 (-)
G925053 NA non-coding upstream 62592 74781693 ~ 74841885 (-)
G925010 NA non-coding upstream 88545 74807646 ~ 74808854 (-)
G925069 NA non-coding upstream 103892 74822993 ~ 74823300 (-)
G925071 NA non-coding upstream 112528 74831629 ~ 74832660 (-)
G924041 NA other downstream 1086279 73630142 ~ 73631970 (-)
G923192 LOC106610383 other downstream 1792515 72905577 ~ 72928468 (-)
LOC110514144 LOC106602209 other downstream 2954329 71747636 ~ 71765505 (-)
LOC110534950 LOC106595337 other downstream 2970365 71744768 ~ 71752698 (-)
LOC118936746 LOC106602209 other downstream 3055115 71658344 ~ 71665901 (-)
LOC118966654 LOC106597013 other upstream 218804 74933999 ~ 74970163 (-)
LOC118936366 LOC106566139 other upstream 334015 75053116 ~ 75056174 (-)
G925211 NA other upstream 564890 75283991 ~ 75284673 (-)
LOC110511405 NA other upstream 773032 75491540 ~ 75494143 (-)

Expression


Co-expression Network