G929217



Basic Information


Item Value
gene id G929217
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 82500858 ~ 82502744 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU1058025
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>TU1058026
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>TU1058027
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>TU1058029
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Function


NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG:

id description

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1058025 False 1535 lncRNA 0.39 3 82500858 82502744
TU1058026 False 1599 lncRNA 0.40 2 82500858 82502744
TU1058027 False 1471 lncRNA 0.39 3 82500858 82502744
TU1058029 True 1471 lncRNA 0.39 3 82500858 82502744

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC118936828 wdr19 coding upstream 99618 82316721 ~ 82401240 (+)
LOC118936827 LOC106591767 coding upstream 194133 82261288 ~ 82306725 (+)
LOC110510824 LOC106594418 coding upstream 267882 82212448 ~ 82232976 (+)
LOC118936825 LOC106593007 coding upstream 291524 82173331 ~ 82211022 (+)
LOC118936694 tbc1d1 coding upstream 379921 81997421 ~ 82120937 (+)
LOC110512972 lias coding downstream 224671 82727415 ~ 82738670 (+)
LOC118936830 NA coding downstream 238394 82740970 ~ 82780517 (+)
LOC118936832 LOC105009164 coding downstream 290909 82793509 ~ 82811450 (+)
LOC118936833 NA coding downstream 297175 82799919 ~ 82803172 (+)
LOC110512617 n4bp2 coding downstream 402986 82905730 ~ 82956331 (+)
G929209 NA non-coding upstream 22755 82473627 ~ 82478103 (+)
G929208 NA non-coding upstream 23010 82472220 ~ 82477848 (+)
G929211 NA non-coding upstream 23672 82474289 ~ 82477186 (+)
G929210 NA non-coding upstream 25197 82474092 ~ 82475661 (+)
G929195 NA non-coding upstream 55246 82445194 ~ 82445612 (+)
G929232 NA non-coding downstream 37351 82540095 ~ 82544767 (+)
G929241 NA non-coding downstream 77896 82580640 ~ 82587129 (+)
G929247 NA non-coding downstream 101988 82604732 ~ 82618676 (+)
G929244 NA non-coding downstream 111518 82614262 ~ 82617998 (+)
G929273 NA non-coding downstream 131965 82634709 ~ 82636052 (+)
G929159 NA other upstream 191286 82308803 ~ 82309572 (+)
G929305 NA other downstream 258861 82761605 ~ 82762488 (+)
G929370 NA other downstream 532368 83035112 ~ 83035491 (+)

Expression



Co-expression Network