G931869


Basic Information

Item Value
gene id G931869
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048574.1
NCBI id CM023228.2
chromosome length 87811138
location 86098706 ~ 86111379 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1061928
atttattgtgatggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtagggtatattacatggatttattgtgatggtgtagactatattacatggatttattgtgaaggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgaaggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtagactatattacatggatttattgtgatggtgtagactatattacatggatttattgtgatggtgtagactatattacatggatttattgtgatggtgtagactatattacatggattcattgtgatggtgtagactatattacatggattcattgtgatggtgtagactatattacatggatttattgtgatggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtagac
>TU1061931
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>TU1061925
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>TU1061929
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>TU1061930
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>TU1061926
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>TU1061927
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1061928 False 433 lncRNA 0.32 2 86098706 86106930
TU1061931 False 240 lncRNA 0.31 2 86098706 86103470
TU1061925 False 267 lncRNA 0.34 3 86099496 86111379
TU1061929 False 288 lncRNA 0.32 4 86103205 86111379
TU1061930 False 255 lncRNA 0.33 2 86103205 86111379
TU1061926 False 244 lncRNA 0.34 3 86103867 86111379
TU1061927 True 238 lncRNA 0.33 3 86103867 86111379

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110528614 LOC106592313 coding upstream 81131 86008932 ~ 86017575 (+)
LOC118966669 LOC106591460 coding upstream 89906 85994536 ~ 86008800 (+)
LOC110528615 LOC106597603 coding upstream 141614 85951030 ~ 85957092 (+)
LOC110516966 LOC106591460 coding upstream 153525 85929157 ~ 85945181 (+)
LOC118936495 LOC106594836 coding upstream 178307 85900556 ~ 85920664 (+)
LOC118936859 LOC106595358 coding downstream 40624 86152003 ~ 86182526 (+)
LOC110513338 LOC106595035 coding downstream 89665 86201044 ~ 86209191 (+)
LOC110514691 uba6 coding downstream 119401 86230780 ~ 86285648 (+)
LOC118936862 NA coding downstream 145878 86257257 ~ 86258475 (+)
LOC118936863 LOC104951401 coding downstream 176202 86287581 ~ 86323830 (+)
G931749 LOC106592660 non-coding upstream 12535 85848782 ~ 86086171 (+)
G931837 LOC106594467 non-coding upstream 13699 85974303 ~ 86085007 (+)
G931835 NA non-coding upstream 18483 86079143 ~ 86080223 (+)
G931836 NA non-coding upstream 68189 85969817 ~ 86030517 (+)
G931834 NA non-coding upstream 68371 86025232 ~ 86030335 (+)
G931996 NA non-coding downstream 3930 86115309 ~ 86115551 (+)
G932017 NA non-coding downstream 18220 86129599 ~ 86131642 (+)
G932018 NA non-coding downstream 19077 86130456 ~ 86131758 (+)
G932024 NA non-coding downstream 32053 86143432 ~ 86144304 (+)
G932026 NA non-coding downstream 41008 86152387 ~ 86152617 (+)
LOC118966668 LOC106592313 other upstream 203969 85893094 ~ 85950607 (+)
G931776 NA other upstream 312208 85785500 ~ 85786498 (+)
G932184 NA other downstream 331671 86441024 ~ 86475840 (+)
LOC110518842 tbc1d1 other downstream 612558 86704406 ~ 86830606 (+)
LOC110511479 klhl5 other downstream 886407 86997786 ~ 87054035 (+)
LOC110516832 wdr19 other downstream 1007703 87057752 ~ 87129649 (+)

Expression


Co-expression Network