LOC110535269 (LOC106579659)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110535269
gene name LOC106579659
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048575.1
NCBI id CM023229.2
chromosome length 86280908
location 11499972 ~ 11541498 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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Function


NR:

description
unnamed protein product

GO:

id name namespace
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GO:0006184 obsolete GTP catabolic process biological_process
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0003924 GTPase activity molecular_function
GO:0005525 GTP binding molecular_function

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036934863.1 False 2908 mRNA 0.41 8 11499976 11541498
TU1075395 True 856 lncRNA 0.46 3 11501693 11541491

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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vapa vapa coding upstream 827980 10666207 ~ 10671992 (+)
LOC110535272 LOC106579661 coding downstream 3959 11545457 ~ 11548240 (+)
LOC110535274 LOC100136506 coding downstream 256581 11798079 ~ 11885766 (+)
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G943032 NA non-coding upstream 157538 11342090 ~ 11342434 (+)
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G942917 NA non-coding upstream 338444 11161299 ~ 11161528 (+)
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G942702 NA other upstream 388636 11110726 ~ 11111336 (+)
G941893 NA other upstream 1254466 10245109 ~ 10245506 (+)
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G940313 NA other upstream 2959105 8532540 ~ 8540867 (+)
G944957 NA other downstream 1846052 13387550 ~ 13394875 (+)
G946426 ramp3 other downstream 2523050 14064548 ~ 14065869 (+)
LOC110535304 NA other downstream 2613856 14154784 ~ 14202999 (+)
G946644 NA other downstream 2769077 14310575 ~ 14314318 (+)
G946643 NA other downstream 2776510 14318008 ~ 14318623 (+)

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