tfr1b (LOC106579454)


Basic Information

Item Value
gene id tfr1b
gene name LOC106579454
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048575.1
NCBI id CM023229.2
chromosome length 86280908
location 16241581 ~ 16253322 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036935025.1
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TTAGCAATA
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Function

NR:

description
transferrin receptor protein 1-like

GO: NA

KEGG:

id description
K06503 TFRC, CD71; transferrin receptor

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036935025.1 False 5009 mRNA 0.47 18 16241581 16253322
XR_005034583.1 True 4939 mRNA 0.48 19 16241581 16253322

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ccl20b LOC100135878 coding upstream 30389 16209929 ~ 16211192 (+)
map3k15 map3k15 coding upstream 36527 16098605 ~ 16205054 (+)
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zdhhc23b zdhhc23 coding upstream 376181 15858519 ~ 15865400 (+)
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tnk2a LOC106579455 coding downstream 687 16254009 ~ 16274994 (+)
adipoqa LOC106579495 coding downstream 35622 16288944 ~ 16290744 (+)
LOC110535372 mynn coding downstream 74071 16327393 ~ 16338373 (+)
lrrc34 lrrc34 coding downstream 90006 16343328 ~ 16355927 (+)
klhl15 klhl15 coding downstream 130399 16383721 ~ 16397791 (+)
G948554 NA non-coding upstream 67009 16174292 ~ 16174572 (+)
G948545 NA non-coding upstream 67866 16136747 ~ 16173715 (+)
G948542 NA non-coding upstream 152607 16088465 ~ 16088974 (+)
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G948626 LOC106579456 non-coding downstream 45616 16298938 ~ 16299177 (+)
G948630 NA non-coding downstream 46554 16299876 ~ 16300305 (+)
G948629 NA non-coding downstream 48524 16301846 ~ 16302047 (+)
G948524 NA other upstream 186943 16054065 ~ 16054638 (+)
boc LOC106579445 other upstream 448547 15747150 ~ 15800515 (+)
atp8a2 LOC106579514 other upstream 582119 15594416 ~ 15660363 (+)
G948587 NA other downstream 70028 16323350 ~ 16326407 (+)
LOC110535387 LOC106579475 other downstream 290493 16543682 ~ 16565783 (+)
G948710 NA other downstream 300878 16554200 ~ 16601892 (+)
G951511 NA other downstream 2873343 19126665 ~ 19127085 (+)

Expression


Co-expression Network