XLOC_002839 (si:ch211-103f14.3)



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_002839
gene name si:ch211-103f14.3
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 29087810 ~ 29101849 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00005265
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>TCONS_00005264
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>TCONS_00005266
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Function


symbol description
si:ch211-103f14.3 Predicted to be an extracellular matrix structural constituent. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in cell surface and extracellular space.

GO:

id name namespace
GO:0005615 extracellular space cellular_component
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GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0005201 extracellular matrix structural constituent molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-110411-160 Predicted to be an extracellular matrix structural constituent. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in cell surface and extracellular space.

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000088315

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TCONS_00005266 True 1097 mRNA 0.44 9 29094277 29101715

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_002838 BX537347.1 coding downstream 164177 28923517 ~ 28923633 (-)
XLOC_002837 BX537347.2 coding downstream 165559 28922135 ~ 28922251 (-)
XLOC_002836 alcama coding downstream 251998 28731749 ~ 28835812 (-)
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XLOC_002841 BX005332.1 coding upstream 26353 29128202 ~ 29138004 (-)
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XLOC_002844 tmem126a coding upstream 168149 29269998 ~ 29272757 (-)
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XLOC_002858 NA non-coding upstream 2161003 31262852 ~ 31295006 (-)

Expression



Co-expression Network