G937051


Basic Information

Item Value
gene id G937051
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048575.1
NCBI id CM023229.2
chromosome length 86280908
location 5019905 ~ 5028145 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1068725
gacagggtctaatacagggtcaactacaggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacaggtcaactacagggtcaactacagggtcaacaacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaataaagggtctaatacagggtctaatacagggtcaacaacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtgtaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagtgtctaatacagggtcaactacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacaggttCTAAttcagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtataatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtcaactacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatgcagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtttaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtcaactacagggtctaatacagggtc
>TU1068724
gtctaatacagggtcaactacaggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaataaagggtctaatacagggtctaatacagggtcaacaacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtgtaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagtgtctaatacagggtcaactacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtataatacagggtcaactacagggtcaaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacaggatctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtcaactacagggtctaatacagggtcaactacagggtcaactacagggtctaatacagggtataatacagggtctaatacagggtctaatgcagggtcaactacagggtctaatgcagggtcaactacagggtcaactacagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatgcagggtcaactacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactacagggtctaatacaaggtctaatacagggtcaactacagggtcgactacagggtcaactacagggtcaactacagggtctcatacagggtctaatacagggtctaatacagggtctaatacagggtcaactaaAGAGTCAACTACATGGTctaatgtttttgctgtttgttctttgttatagagccaaaaagattggagaagtggtttacccagacatctccattttggatagataactctttgtgttgttgtttgttttgtgttttccaATTTTGTGGTTAGATTCTATGTATTTTTCAATTACGTTGAGcggatttctgacgtgctgttacTTCTTTTTCCATATTTCTgtgttgttttagtgattcaccatagtgtatttctgtgttgttttagtgattcaccatagtgtatttc

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1068725 False 1627 TUCP 0.45 2 5019905 5021613
TU1068724 True 1613 TUCP 0.43 6 5020160 5028145

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118937293 NA coding upstream 56241 4959044 ~ 4963664 (+)
eya1 LOC106590661 coding upstream 63720 4819745 ~ 4956185 (+)
LOC118937435 msc coding upstream 433323 4583616 ~ 4586582 (+)
LOC110536527 trpa1 coding upstream 451314 4491768 ~ 4568591 (+)
LOC118937460 NA coding upstream 902502 4109412 ~ 4117403 (+)
LOC100136147 tram1 coding downstream 140742 5168887 ~ 5184807 (+)
LOC110536532 LOC106579720 coding downstream 165036 5193181 ~ 5518848 (+)
LOC110535182 prdm14 coding downstream 404181 5432326 ~ 5439359 (+)
LOC110535189 LOC106579706 coding downstream 1000515 6028660 ~ 6038322 (+)
LOC110536599 LOC106579705 coding downstream 1013697 6041842 ~ 6098398 (+)
G937038 NA non-coding upstream 15239 5003968 ~ 5004666 (+)
G936917 NA non-coding upstream 177945 4838840 ~ 4841960 (+)
G936905 NA non-coding upstream 209817 4809778 ~ 4810088 (+)
G936876 NA non-coding upstream 227293 4790706 ~ 4792612 (+)
G936869 NA non-coding upstream 243841 4773163 ~ 4776064 (+)
G937071 NA non-coding downstream 52919 5081064 ~ 5085992 (+)
G937082 NA non-coding downstream 109855 5138000 ~ 5187878 (+)
G937098 NA non-coding downstream 120308 5148453 ~ 5153171 (+)
G937100 NA non-coding downstream 121318 5149463 ~ 5152815 (+)
G937104 NA non-coding downstream 131475 5159620 ~ 5160038 (+)
G935977 NA other upstream 1037707 3981851 ~ 3982198 (+)
G935976 NA other upstream 1038754 3980771 ~ 3981151 (+)
G935846 NA other upstream 1469418 3550039 ~ 3550487 (+)
G934640 NA other upstream 3110825 1908660 ~ 1909080 (+)
G934579 NA other upstream 3192539 1826627 ~ 1827366 (+)
G937096 xkr9 other downstream 115172 5143317 ~ 5144565 (+)
G937237 NA other downstream 476559 5504704 ~ 5505329 (+)
G937889 NA other downstream 1093439 6121584 ~ 6122269 (+)
G938723 NA other downstream 1991006 7019151 ~ 7021424 (+)
G939408 NA other downstream 2546207 7574352 ~ 7574909 (+)

Expression


Co-expression Network