G942140



Basic Information


Item Value
gene id G942140
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048575.1
NCBI id CM023229.2
chromosome length 86280908
location 10709833 ~ 10713752 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU1074500
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>TU1074501
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>TU1074502
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>TU1074503
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>TU1074504
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Function


NR:

description
PREDICTED: collagen EMF1-alpha-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1074500 False 1504 lncRNA 0.38 3 10709833 10711750
TU1074501 False 1522 lncRNA 0.38 2 10709833 10711750
TU1074502 False 2978 lncRNA 0.41 4 10709833 10713752
TU1074503 False 1612 lncRNA 0.38 3 10709833 10711750
TU1074504 True 2872 lncRNA 0.40 6 10709833 10713752

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
vapa vapa coding upstream 37841 10666207 ~ 10671992 (+)
LOC110535252 LOC106579643 coding upstream 70411 10631364 ~ 10639422 (+)
LOC110536547 LOC106579641 coding upstream 85813 10395438 ~ 10624020 (+)
LOC110535248 LOC106579638 coding upstream 342154 10305885 ~ 10367679 (+)
LOC118937312 NA coding upstream 440414 10267264 ~ 10269419 (+)
LOC110535262 LOC106579655 coding downstream 311885 11025637 ~ 11064599 (+)
LOC110535263 lrrc30 coding downstream 441928 11155680 ~ 11158395 (+)
LOC110535264 LOC106579657 coding downstream 464580 11178332 ~ 11497838 (+)
trnaa-ugc-48 NA coding downstream 621758 11335510 ~ 11335585 (+)
LOC110535269 LOC106579659 coding downstream 786220 11499972 ~ 11541498 (+)
G942138 NA non-coding upstream 2935 10706585 ~ 10706898 (+)
G942134 LOC106579648 non-coding upstream 5406 10697698 ~ 10704427 (+)
G942124 NA non-coding upstream 22254 10687364 ~ 10687579 (+)
G942123 NA non-coding upstream 22949 10686043 ~ 10686884 (+)
G942106 NA non-coding upstream 62545 10646468 ~ 10647288 (+)
G942146 NA non-coding downstream 1249 10715001 ~ 10715632 (+)
G942141 NA non-coding downstream 16977 10730729 ~ 10733085 (+)
G942541 NA non-coding downstream 120697 10834449 ~ 10834721 (+)
G942543 NA non-coding downstream 121289 10835041 ~ 10837927 (+)
G942547 NA non-coding downstream 140828 10854580 ~ 10854782 (+)
G941893 NA other upstream 464327 10245109 ~ 10245506 (+)
LOC118937463 NA other upstream 1854396 8845565 ~ 8855476 (+)
G940376 NA other upstream 2057312 8651504 ~ 8652993 (+)
G940313 NA other upstream 2168966 8532540 ~ 8540867 (+)
G940247 NA other upstream 2270058 8439480 ~ 8439775 (+)
G942702 NA other downstream 396974 11110726 ~ 11111336 (+)
G944957 NA other downstream 2673798 13387550 ~ 13394875 (+)
G946426 ramp3 other downstream 3350796 14064548 ~ 14065869 (+)
LOC110535304 NA other downstream 3441602 14154784 ~ 14202999 (+)
G946644 NA other downstream 3596823 14310575 ~ 14314318 (+)

Expression



Co-expression Network