XLOC_028666


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_028666
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 16003900 ~ 16025255 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00058154
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000095103

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TCONS_00055582 False 369 processed_transcript 0.40 2 16003900 16008167
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TCONS_00058156 True 12079 lncRNA 0.36 1 16013177 16025255

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_028665 mest coding downstream 2685 15996234 ~ 16001215 (-)
XLOC_028664 NA coding downstream 29753 15913165 ~ 15974147 (-)
XLOC_028663 NA coding downstream 243309 15757435 ~ 15760591 (-)
XLOC_028662 chchd3a coding downstream 400312 15490215 ~ 15603588 (-)
XLOC_028661 NA coding downstream 531706 15469287 ~ 15472194 (-)
XLOC_028667 NA coding upstream 9042 16034297 ~ 16037857 (-)
XLOC_028668 NA coding upstream 14859 16040114 ~ 16042181 (-)
XLOC_028669 NA coding upstream 16300 16041555 ~ 16075501 (-)
XLOC_028670 atp2b1a coding upstream 51464 16076719 ~ 16124419 (-)
XLOC_028671 NA coding upstream 102418 16127673 ~ 16192183 (-)
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XLOC_028672 BX649423.3 non-coding upstream 188169 16213424 ~ 16213540 (-)

Expression


Co-expression Network