G956496


Basic Information

Item Value
gene id G956496
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048575.1
NCBI id CM023229.2
chromosome length 86280908
location 23272348 ~ 23275299 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1090537
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>TU1090541
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>TU1090542
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>TU1090543
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>TU1090544
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>TU1090553
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1090537 False 2838 lncRNA 0.39 3 23272348 23275299
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TU1090543 False 2192 lncRNA 0.37 2 23272872 23275120
TU1090544 False 2135 lncRNA 0.37 3 23272872 23275120
TU1090553 True 2192 lncRNA 0.37 2 23272872 23275120

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ptbp2a ptbp2 coding upstream 305545 22951161 ~ 22966803 (+)
LOC110535493 LOC106578494 coding upstream 515371 22750723 ~ 22756977 (+)
tlcd4a LOC106570700 coding upstream 531085 22712577 ~ 22741263 (+)
LOC110535486 LOC106578488 coding upstream 708241 22557109 ~ 22564107 (+)
LOC110535485 LOC106578486 coding upstream 718165 22541599 ~ 22554183 (+)
snx7 snx7 coding downstream 54451 23329750 ~ 23365999 (+)
LOC110535498 NA coding downstream 106230 23381529 ~ 23387901 (+)
LOC118937334 NA coding downstream 199836 23475135 ~ 23477150 (+)
LOC110535500 LOC106578508 coding downstream 219610 23494909 ~ 23531354 (+)
palmdb LOC106578510 coding downstream 288376 23563675 ~ 23604917 (+)
G956494 NA non-coding upstream 544 23271444 ~ 23271804 (+)
G956485 NA non-coding upstream 10490 23261656 ~ 23261858 (+)
G956484 NA non-coding upstream 10982 23261142 ~ 23261366 (+)
G956480 NA non-coding upstream 15952 23256033 ~ 23256396 (+)
G956465 NA non-coding upstream 24621 23247433 ~ 23247727 (+)
G956497 NA non-coding downstream 1083 23276382 ~ 23276597 (+)
G956498 NA non-coding downstream 1905 23277204 ~ 23277648 (+)
G956507 NA non-coding downstream 8058 23283357 ~ 23283565 (+)
G956564 NA non-coding downstream 83602 23358901 ~ 23359868 (+)
G956569 NA non-coding downstream 95018 23370317 ~ 23370563 (+)
phldb2b tcpe other upstream 3502995 19740565 ~ 19799150 (+)
G951511 NA other upstream 4145263 19126665 ~ 19127085 (+)
G948710 NA other upstream 6670456 16554200 ~ 16601892 (+)
LOC110535387 LOC106579475 other upstream 6727059 16543682 ~ 16565783 (+)
G956728 LOC106613263 other downstream 389989 23665288 ~ 23665930 (+)
G956797 NA other downstream 500473 23775772 ~ 23776845 (+)
G957942 NA other downstream 1325172 24600471 ~ 24601653 (+)
G958300 idi1 other downstream 1519301 24794600 ~ 24795736 (+)
G960696 LOC106583976 other downstream 3438326 26713625 ~ 26797294 (+)

Expression


Co-expression Network