XLOC_028678 (dcn)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_028678
gene name dcn
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 16368762 ~ 16443053 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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Function

symbol description
dcn Predicted to enable collagen binding activity. Predicted to be an extracellular matrix structural constituent conferring compression resistance. Acts upstream of or within cartilage development; chondroitin sulfate proteoglycan metabolic process; and convergent extension involved in axis elongation. Predicted to be located in extracellular region. Predicted to be active in extracellular space. Is expressed in several structures, including cranial cartilage; epidermis; nervous system; pericardial region; and periderm. Human ortholog(s) of this gene implicated in breast carcinoma; congenital stromal corneal dystrophy; and high grade glioma. Orthologous to human DCN (decorin).

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ZDB-GENE-010102-1 Predicted to enable collagen binding activity. Predicted to be an extracellular matrix structural constituent conferring compression resistance. Acts upstream of or within cartilage development; chondroitin sulfate proteoglycan metabolic process; and convergent extension involved in axis elongation. Predicted to be located in extracellular region. Predicted to be active in extracellular space. Is expressed in several structures, including cranial cartilage; epidermis; nervous system; pericardial region; and periderm. Human ortholog(s) of this gene implicated in breast carcinoma; congenital stromal corneal dystrophy; and high grade glioma. Orthologous to human DCN (decorin).

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gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_028677 lum coding downstream 14470 16349042 ~ 16354292 (-)
XLOC_028676 kera coding downstream 23535 16337156 ~ 16345227 (-)
XLOC_028675 epyc coding downstream 34400 16317296 ~ 16334362 (-)
XLOC_028673 NA coding downstream 54818 16295524 ~ 16313944 (-)
XLOC_028674 NA coding downstream 67520 16299656 ~ 16301242 (-)
XLOC_028679 wu:fc23c09 coding upstream 4432 16447485 ~ 16451375 (-)
XLOC_028680 btg1 coding upstream 93120 16536173 ~ 16545085 (-)
XLOC_028681 caprin2 coding upstream 171973 16615026 ~ 16628802 (-)
XLOC_028682 sinhcaf coding upstream 188430 16631483 ~ 16644708 (-)
XLOC_028683 dennd5b coding upstream 206489 16649542 ~ 16706978 (-)
XLOC_028672 BX649423.3 non-coding downstream 155222 16213424 ~ 16213540 (-)
XLOC_028671 NA non-coding downstream 176579 16127673 ~ 16192183 (-)
XLOC_028669 NA non-coding downstream 293261 16041555 ~ 16075501 (-)
XLOC_028684 NA non-coding upstream 320652 16763705 ~ 16824556 (-)
XLOC_028690 NA non-coding upstream 670326 17113379 ~ 17216223 (-)
XLOC_028696 NA non-coding upstream 1128242 17571295 ~ 17629444 (-)
XLOC_028702 BX890572.1 non-coding upstream 1293390 17736443 ~ 17737812 (-)
XLOC_028707 NA non-coding upstream 1432018 17875071 ~ 17882930 (-)

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